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蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的紅外檢測(cè)

來(lái)源:上海力晶科學(xué)儀器有限公司   2020年11月26日 13:09  

蛋白質(zhì)是與生命及各種形式的生命活動(dòng)緊密聯(lián)系在一起的物質(zhì),,機(jī)體中的每一個(gè)細(xì)胞和所有重要組成部分都有蛋白質(zhì)的參與,。蛋白質(zhì)是由不同氨基酸以肽鍵相連所組成的具有一定空間結(jié)構(gòu)的生物大分子物質(zhì),,其結(jié)構(gòu)可分為以下4個(gè)結(jié)構(gòu)層次:

圖1 蛋白質(zhì)的四個(gè)結(jié)構(gòu)層次

 

我們所關(guān)注的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)指的是蛋白質(zhì)分子局部區(qū)域內(nèi),多肽鏈沿一定方向盤繞和折疊的方式,,主要是分子內(nèi)的氫鍵維系的局部空間排列,,包括α螺旋、β折疊、轉(zhuǎn)角,、無(wú)規(guī)卷曲等,。

常見(jiàn)的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析的方法有四種:紅外光譜法、X射線衍射法,、圓二色譜法和熒光光譜法,,其中紅外光譜法的優(yōu)勢(shì)非常明顯,可以宏觀整體的鑒定復(fù)雜體系,,測(cè)定不同狀態(tài),、不同濃度和不同環(huán)境中的蛋白質(zhì)和多肽,而且紅外光譜法是一種快速的無(wú)損檢測(cè)方法,。傅里葉變換紅外光譜(FTIR)法應(yīng)用于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的定性和定量分析已有幾十年的歷史,,是一種非常成熟的檢測(cè)方法,人們對(duì)各類蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)紅外吸收峰,,以及同類蛋白質(zhì)不同組分的特種頻率和指認(rèn),,都已非常明確,,如下表所示,。目前,蛋白質(zhì)紅外檢測(cè)方法已廣泛應(yīng)用于藥物研發(fā),、產(chǎn)品質(zhì)量控制和出廠檢測(cè)中,。

表1 各類蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)紅外吸收峰

 

根據(jù)樣品的形態(tài)不同,蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的紅外測(cè)試方法分為兩種:

 

1,、液體樣品

常用配置為紅外光譜儀主機(jī)配套液體池附件和專門的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析軟件,,還可以根據(jù)測(cè)試需要增加溫度控制系統(tǒng),如下圖所示,。

 

圖2 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)檢測(cè)

紅外液體池及溫控裝置

 

2,、固體樣品

常用配置為紅外光譜儀主機(jī)配套壓片機(jī)、衰減全反射(ATR)附件和測(cè)試軟件,,含分峰,、差減、求導(dǎo),、卷積,、去卷積、曲線擬合等功能,,或可根據(jù)測(cè)試需要配套帶溫控功能的ATR附件,。

FTIR用于蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的分析實(shí)例已經(jīng)非常多,不僅可以對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行定性定量分析,,如注射用人免疫球蛋白的檢測(cè),,也可以對(duì)由溫度、化學(xué),、物理和癌變等因素導(dǎo)致的變性蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,,下面力晶小天為大家舉幾個(gè)“栗子”:

 

人工抗原的鑒定

衰減全反射紅外光譜法可以實(shí)現(xiàn)原位測(cè)定和實(shí)時(shí)跟蹤,,對(duì)于需要觀察過(guò)程反應(yīng)的實(shí)驗(yàn)具有很高的利用價(jià)值。通過(guò)對(duì)蛋白質(zhì)酰胺吸收帶的二階求導(dǎo)和去卷積等,,可以觀察蛋白質(zhì)分子部分或全部去折疊引起的二級(jí)機(jī)構(gòu)的破壞以及相對(duì)含量的變化,。對(duì)此,浙江農(nóng)林大學(xué)化學(xué)系的郭明等人合成致癌物氨基甲酸乙酯的人工抗原后,,通過(guò)衰減全反射紅外光譜成功地對(duì)人工抗原蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)及其含量進(jìn)行了分析,。利用FTIR對(duì)人工抗原化學(xué)結(jié)構(gòu)進(jìn)行鑒定的應(yīng)用很多,方法也非常成熟,,除了ATR法,,液體池法和壓片法也經(jīng)常被采用。

 

過(guò)敏原原肌球蛋白檢測(cè)

水產(chǎn)品中,,蝦蟹(甲殼)類和貝類為水產(chǎn)品的主要致敏食物,,而原肌球蛋白是其中主要的過(guò)敏原,其引起的過(guò)敏癥狀日趨復(fù)雜和嚴(yán)重,。而傳統(tǒng)的檢測(cè)方法中,,質(zhì)譜技術(shù)的儀器成本和操作要求高,并且用SDS電泳分離蛋白導(dǎo)致蛋白變性,,對(duì)被檢食品樣品有損害,;PCR檢測(cè)技術(shù)用來(lái)檢測(cè)加工食品可能出現(xiàn)假陰性結(jié)果;免疫學(xué)檢測(cè)技術(shù),、膠體金試紙條檢測(cè),、磁性免疫層析法及生物傳感器檢測(cè)法等步驟繁瑣且都需要抗體。上海海洋大學(xué)的盧瑛等人發(fā)明了紅外衰減全反射法快速鑒定和檢測(cè)過(guò)敏原原肌球蛋白,。

圖3 不同水產(chǎn)品的光譜

 

癌癥早期診斷

隨著FTIR技術(shù)的不斷進(jìn)步,,為癌癥的早期診斷提供了可能,針對(duì)這方面的報(bào)道也越來(lái)越多,。例如,,原發(fā)性膽囊癌細(xì)胞缺乏典型的臨床表現(xiàn),一經(jīng)發(fā)現(xiàn)屬中晚期,,術(shù)后5年生存率不到5%,。而早期原發(fā)性膽囊癌術(shù)后5年生存率可達(dá)100%,早期診斷是提高療效,、改善預(yù)后的關(guān)鍵,。西安交大醫(yī)學(xué)院diyi附屬醫(yī)院普外科的孫學(xué)軍等人通過(guò)賽默飛世爾的紅外光譜儀試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),膽囊癌組織與正常膽囊組織的紅外光譜具有顯著差異,,可作為癌癥早期診斷的手段,。

中科院同步輻射實(shí)驗(yàn)室的馬曉冬等人認(rèn)為檢測(cè)細(xì)胞和組織樣品取樣較為不便,所以根據(jù)中醫(yī)理論——人的指甲在一定程度可以反映出內(nèi)臟器官的生理病理變化,建立了通過(guò)指甲紅外光譜判斷消化道癌的方法,。之前還有人通過(guò)指甲的紅外光譜,,對(duì)鼻咽癌進(jìn)行早期診斷。

 

結(jié)直腸癌化療療效的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)

在結(jié)直腸癌的化療中,,常采用5-氟尿嘧啶誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡,。臨床上對(duì)放化療效果的監(jiān)測(cè)主要是通過(guò)電子顯微結(jié)腸鏡、CT和B超等手段,,只是在組織水平進(jìn)行監(jiān)測(cè),,而組織變化之前腫瘤細(xì)胞內(nèi)部構(gòu)成早已發(fā)生改變,尚未出現(xiàn)臨床癥狀和影像學(xué)改變,。西安交大醫(yī)學(xué)院diyi附屬醫(yī)院普外科的劉棟等人利用賽默飛世爾的iN10 MX型顯微紅外光譜儀,,對(duì)不同時(shí)期腫瘤細(xì)胞中的脂類、氨基酸殘基,、DNA和蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)等進(jìn)行檢測(cè),,研究出實(shí)時(shí)無(wú)創(chuàng)監(jiān)測(cè)腫瘤化療療效的有效方法。

 

圖4 隨凋亡時(shí)間延長(zhǎng)蛋白質(zhì)α螺旋和NH二級(jí)結(jié)構(gòu)吸收峰強(qiáng)降低,,

提示細(xì)胞α螺旋解鏈,,細(xì)胞凋亡(a: Control; b: 12h; c: 24h; d: 48h)

 

不同制備條件對(duì)抗體蛋白的影響

免疫膠乳指特定抗體或抗原固定于膠乳顆粒表面形成具有免疫學(xué)性質(zhì)的膠乳顆粒。傳統(tǒng)物理吸附法固定大分子蛋白容易脫落,,用共價(jià)偶聯(lián)的方法制備免疫膠乳,,蛋白質(zhì)在吸附于膠乳顆粒表面的過(guò)程中結(jié)構(gòu)會(huì)發(fā)生改變,,不同偶聯(lián)條件對(duì)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)影響不同,。華南理工大學(xué)的俞思明等人利用壓片法測(cè)得免疫膠乳的紅外透射光譜,并結(jié)合多種算法,,分析了不同條件下共價(jià)偶聯(lián)對(duì)抗體蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響,。

隨著FTIR軟件和硬件技術(shù)的不斷進(jìn)步,相信未來(lái)紅外光譜法在蛋白質(zhì)檢測(cè)各領(lǐng)域中的應(yīng)用也會(huì)更加普遍,,同時(shí)將由離體分析蛋白質(zhì)向在體分析方向發(fā)展,,這對(duì)化學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域都將具有重大意義。

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