構(gòu)建帶有UMT(Unique Molecular Tags)的Illumina NGS文庫 | ||||||||||||||||
ThruPLEX® Tag-seq Kit | ||||||||||||||||
· 可信賴的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,。ThruPLEX Tag-seq 技術(shù)提供了多達(dá)1,600萬個(gè)分子標(biāo)簽來糾正測序誤差,, 提供可信的變異檢測分析,。 · 發(fā)現(xiàn)更多,,成本更低,。結(jié)合基于雜交技術(shù)的目標(biāo)序列富集系統(tǒng)可分析數(shù)百個(gè)基因,,同時(shí)分析突變和結(jié)構(gòu)變異,。 · 每次都可獲得高質(zhì)量文庫,。單管操作,2小時(shí),,3步操作流程,。使用簡便,可減少使用者操作誤差和污染發(fā)生,。 · 省時(shí)的生物信息學(xué)分析方案,。采用Curio Genomics提供的云服務(wù)軟件或開源軟件可以快速獲得 研究結(jié)果。 · 珍貴樣品分析成為可能,。更低的DNA起始量,,以往由于起始量太低而不能分析的樣品也可以分析了。 ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始,,兼容多種樣品類型,。 | ||||||||||||||||
■ 產(chǎn)品說明: | ||||||||||||||||
ThruPLEX Tag-seq采用帶有特別分子標(biāo)簽(UMT)的ThruPLEX引物構(gòu)建帶有分子標(biāo)記和樣品檢索引物的Illumina NGS文庫。每個(gè)試劑盒包含超過1,600萬個(gè)特別序列用于在擴(kuò)增前標(biāo)記每條DNA小片段,可以在文庫制備,、目標(biāo)富集和數(shù)據(jù)分析過程中追蹤DNA小片段,,以檢測低豐度等位基因或計(jì)數(shù)獨(dú)立片段。采用ThruPLEX 技術(shù)設(shè)計(jì)及優(yōu)化,,可以1到50 ng DNA起始構(gòu)建高多樣性,、高重復(fù)性文庫。整個(gè)流程在單管或單孔中就可完成,,只需3步,,2小時(shí),無需中間純化步驟和樣品轉(zhuǎn)移,,避免了操作誤差和樣品損失,。ThruPLEX Tag-seq Kit 包含所需全部試劑,包括可以多重標(biāo)記96個(gè)樣品的檢索引物,。純化和定量后,,文庫可以采用標(biāo)準(zhǔn)Illumina測序試劑和流程在Illumina NGS平臺進(jìn)行測序。 | ||||||||||||||||
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圖1. 單管,,三步操作流程,。 ThruPLEX Tag-seq Kit以1-50 ng DNA起始構(gòu)建檢索引物文庫只需3步:末端修復(fù),接頭連接和高保真文庫擴(kuò)增,。無需純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟,。簡化的工作流程,在單管或單孔中2個(gè)小時(shí)即可完成,,避免樣品損失,,增強(qiáng)了陽性識別。 | ||||||||||||||||
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圖2. ThruPLEX DNA-seq Kit技術(shù)概要,。ThruPLEX技術(shù)以片段化雙鏈DNA或游離DNA起始,,只需3步反應(yīng),簡單高效,。 | ||||||||||||||||
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圖3. 減少背景,,結(jié)果更可靠。以30 ng 1% Horizon cfDNA standard,,采用 ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫,。Agilent SureSelect富集目標(biāo)區(qū)域,~5,000X覆蓋度測序,,采用Curio Genomics生物信息學(xué)平臺分析數(shù)據(jù),。采用原始數(shù)據(jù)分析,EGFR 的突變(黃色點(diǎn))會被背景誤差遮蓋(左圖),。而在數(shù)據(jù)分析過程中使用UMT修正誤差,,突變更容易識別(右圖),。 | ||||||||||||||||
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圖4. 顯著提高信噪比,發(fā)現(xiàn)更多,。以30 ng(A)或10 ng Horizon cfDNA standard采用ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫,,240 KB定制panel(NimbleGen SeqCapEZ)富集目標(biāo)區(qū)域,HiSeq 2500 ~5,000X覆蓋度測序,。Curio Genomics生物信息學(xué)分析平臺進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,。 *數(shù)據(jù)來源于Takara Bio Inc. | ||||||||||||||||
■ 產(chǎn)品組成 | ||||||||||||||||
· Template Preparation Buffer (Red) · Template Preparation Enzyme (Red) · Library Synthesis Buffer (Yellow) · Library Synthesis Enzyme (Yellow) · Library Amplification Buffer(Green) · Library Amplification Enzyme(Green) · Nuclease-Free Water(Clear) · Indexing Reagent | ||||||||||||||||
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