多肽合成技術(shù)
多肽化學(xué)合成的基本介紹
多肽化學(xué)合成方法,,包括液相和固相兩種方法。液相合成方法現(xiàn)在主要采用BOC和Z兩種保護(hù)方法,,現(xiàn)在主要應(yīng)用在短肽合成,,如阿斯巴甜,,力肽,催產(chǎn)素等,,其相對(duì)與固相合成,,具有保護(hù)基選擇多,,成本低廉,合成規(guī)模容易放大的許多優(yōu)點(diǎn),。與固相合成比較,,液相合成主要缺點(diǎn)是,合成范圍小,,一般都集中在10個(gè)氨基酸以內(nèi)的多肽合成,,還有合成中需要對(duì)中間體進(jìn)行提純,時(shí)間長(zhǎng),,工作量大,。固相合成方法現(xiàn)在主要采用FMOC和BOC兩種方法,它具有合成方便,,迅速,,容易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化,而且可以比較容易的合成到30個(gè)氨基酸左右多肽,。
1.1.氨基酸保護(hù)基
20種常見氨基酸,,根據(jù)側(cè)鏈可以分為幾類:脂肪族氨基酸(Ala,Gly,,Val,,Leu,Ile,,),,芳香族氨基酸(Phe,Tyr,,Trp,,His),酰胺或羧基側(cè)鏈氨基酸(Asp,,Glu,,Asn,Gln),,堿性側(cè)鏈氨基酸(Lys,,Arg),含硫氨基酸(Cys,,Met),,含醇氨基酸(Ser,Thr),,亞氨型基酸(Pro),。多肽化學(xué)合成中氨基酸的保護(hù)非常關(guān)鍵,直接決定了合成能夠成功的關(guān)鍵。因?yàn)槌R姷?0中氨基酸中有很多都是帶有活性側(cè)鏈的,,需要進(jìn)行保護(hù),,一般要求,這些保護(hù)基在合成過程中穩(wěn)定,,無副反應(yīng),,合成結(jié)束后可以*定量的脫除。合成中需要進(jìn)行保護(hù)的氨基酸包括:Cys,,Asp,,Glu,His,,Lys,,Asn,Gln,,Arg,,Ser,Thr,,Trp,,Tyr。需要進(jìn)行保護(hù)的基團(tuán):羥基,,羧基,,巰基,氨基,,酰胺基,胍基,,吲哚,,咪唑等。其中Trp也可以不保護(hù),,因?yàn)檫胚嵝再|(zhì)比較穩(wěn)定,。當(dāng)然在特殊的情況下,有些氨基酸也可以不保護(hù),,象,,Asn,Gln ,,Thr,,Tyr。
表1 常見3種氨基脫除條件
圖1 常見3種氨基保護(hù)基結(jié)構(gòu)
氨基酸側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán)非常多,,同一個(gè)側(cè)鏈有多種不同的保護(hù)基,,可以在不同的條件下選擇性的脫除,這點(diǎn)在環(huán)肽以及多肽修飾上具有很重要的意義。而且側(cè)鏈保護(hù)基和選擇的合成方法有密切的關(guān)系,,液相和固相不一樣,,固相中BOC和FMOC策略也不一樣,從某種意義上看,,多肽化學(xué)就是氨基酸保護(hù)基的靈活運(yùn)用與搭配,。關(guān)于側(cè)鏈保護(hù)基的使用,請(qǐng)參考王德心的《固相有機(jī)合成——原理及應(yīng)用指南》第四章,,我們這里主要介紹Cys,,Lys,Asp的幾種保護(hù)基及其脫除方法,。Cys常見的保護(hù)基有三種,,Trt,Acm,,Mob,,這三個(gè)保護(hù)基可以完成多對(duì)二硫鍵多肽的合成。Lys常見的保護(hù)基有:Boc,,F(xiàn)moc,,Trt,Dde,,Allyl,,這對(duì)于固相合成環(huán)肽提供了很多正交的保護(hù)策略。Asp常見的保護(hù)基有:Otbu,,OBzl,,OMe,OAll,,OFm,,同樣也提供了多種正交的保護(hù)策略。
表2 巰基常見保護(hù)基
表3 氨基常見保護(hù)基
表3 羧基常見保護(hù)基
1.2.多肽縮合試劑
目前多肽合成中,,主要采用羧基活化方法來完成接肽反應(yīng),,早使用的是將氨基酸活化為酰氯,疊氮,,對(duì)稱酸酐以及混合酸酐的方法,,但是由于這些條件下,存在氨基酸消旋,,以及反應(yīng)試劑危險(xiǎn)以及制備比較復(fù)雜,,逐漸被后來的縮合試劑取代,按照其結(jié)構(gòu)可以分為兩種:縮合試劑主要有:碳二亞胺型,,鎓鹽型(Uronium),。
1.2.1.碳二亞胺型
主要包括:DCC,DIC,EDC.HCl等,。采用DCC進(jìn)行反應(yīng),,由于反應(yīng)中生成的DCU,在DMF中溶解度很小,,產(chǎn)生白色沉淀,,所以一般不用在固相合成中,但是由于其價(jià)格便宜,,在液相合成中,,可以通過過濾除去,應(yīng)用仍然相當(dāng)廣泛,。EDC.HCl因?yàn)槠渌芙庑缘奶攸c(diǎn),,在多肽與蛋白的連接中使用比較多,而且也相當(dāng)成功,。但是該類型的縮合試劑的一個(gè)大的缺點(diǎn),,就是如果單獨(dú)使用,會(huì)有比較多的副反應(yīng),,但是研究表明如果在活化過程中添加HOBt,,HOAt等試劑,可以將其副反應(yīng)控制在很低的范圍,。其反應(yīng)機(jī)理如下:
圖2 DIC活化反應(yīng)機(jī)理
1.2.2.鎓鹽型
鎓鹽型縮合試劑反應(yīng)活性高,,速度快,現(xiàn)在使用非常廣泛,,主要包括:HBTU,,TBTU,HATU,,PyBOP等,。該試劑使用過程中需要添加有機(jī)堿,如,,二異丙基乙胺(DIEA),N-甲基嗎啉(NMM),,該試劑加入后,,才能活化氨基酸。其反應(yīng)機(jī)理如下:
圖3 TBTU活化反應(yīng)機(jī)理
1.3.多肽合成方法比較
1.3.1.液相多肽合成(solution phase synthesis)
液相多肽合成現(xiàn)在仍然廣泛的使用,,在合成短肽和多肽片段上具有合成規(guī)模大,,合成成本低的顯著優(yōu)點(diǎn),而且由于是在均相中進(jìn)行反應(yīng),,可以選擇的反應(yīng)條件更加豐富,,象一些催化氫化,堿性水解等條件,都可以使用,,這在固相中,,使用卻由于反應(yīng)效率低,以及副反應(yīng)等原因,,無法應(yīng)用,。液相多肽合成中主要采用BOC和Z兩種反應(yīng)策略。
圖4液相合成Glu-Trp
1.3.2.固相多肽合成
圖5 FMOC固相合成Glu-Trp
固相多肽合成現(xiàn)在使用的主要有兩種策略:BOC和FMOC兩種,。BOC方法合成過程中,,需要反復(fù)使用TFA脫BOC,而且在后從樹脂上切割下來需要使用HF,,由于HF必須使用專門的儀器進(jìn)行操作,,而且切割過程中容易產(chǎn)生副反應(yīng),因此現(xiàn)在使用受到實(shí)驗(yàn)條件限制,,使用也逐漸減少,。FMOC方法反應(yīng)條件溫和,在一般的實(shí)驗(yàn)條件下就可以進(jìn)行合成,,因此,,也得到了非常廣泛的應(yīng)用。
1.3.2.1.固相合成中常用樹脂
固相合成中樹脂,,一般都是聚苯乙烯-二乙烯苯材料,,大小在75-150μm,交聯(lián)度在1-2%之間,,現(xiàn)在使用的大多是1%,,因?yàn)檫@種交聯(lián)度下,樹脂在DMF,,DCM中具有很好的溶脹性能,,立體上是一個(gè)空間網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),反應(yīng)物分子可以在樹脂內(nèi)部自由移動(dòng),。樹脂中關(guān)鍵的部分是連接手臂,,它一端連接在樹脂上,一端作為反應(yīng)位點(diǎn),。目前廣泛使用的樹脂有:PAM,,MBHA,Wang,,2-Cl-Trt,,Rink-Amide-MBHA等。其中PAM,,MBHA是用在BOC策略中,,因?yàn)槠鋵?duì)酸非常穩(wěn)定,,需要在HF,TFMSA等強(qiáng)酸條件下才能夠切割下來,。
圖6 固相合成常用樹脂
1.3.2.2.茚三酮檢測(cè)
固相多肽合成中,,主要是通過檢測(cè)樹脂上游離氨基來判斷連接效率,檢測(cè)方法稱為Kaiser方法,,其檢測(cè)結(jié)果,,如果有游離氨基的時(shí)候,顯示蘭色,,或紅褐色(pro,,ser,His),。
Kaiser試劑包括:
A,,6% 茚三酮的乙醇溶液
B,80% 苯酚的乙醇溶液
C,,2% 0.001M KCN的吡啶溶液
配制中的吡啶需要經(jīng)過茚三酮處理后,,重蒸后再使用。檢測(cè)過程,,取少量樹脂,,加入A,B,,C各2-3滴,,100℃下加熱1-2min,如果溶液有蘭色,,或樹脂出現(xiàn)蘭色,,紅褐色,表明還有游離氨基,,否則說明連接*,。
還有其它檢測(cè)游離氨基的方法:三硝基苯磺酸法,***法,,溴芬蘭法等,。
圖7 茚三酮檢測(cè)原理
1.3.2.3.固相合成切割方法
固相合成完成之后,必須選擇合適的切割試劑將多肽從樹脂上切割下來,,然后經(jīng)過冰**沉淀,,離心收集沉淀,經(jīng)過HPLC分離純化,,冷凍干燥得到后產(chǎn)品。由于選擇的樹脂不同,,氨基酸序列不同,,在切割時(shí)候,,選擇的切割方法也不*相同,一般都是選擇酸性條件下切割的條件,,對(duì)于PAM,,MBHA樹脂,一般采用HF切割,,切割過程中需要添加對(duì)甲苯酚,,對(duì)巰基苯酚,苯甲醚等試劑,。而對(duì)于Wang,,Rink-Amide,Trt樹脂,,一般采用TFA切割,,切割過程中加入,乙二硫醇,,苯甲硫醚,,水,三異丙基硅烷,,苯酚等,。這些添加試劑主要作為碳正離子俘獲試劑使用,目的是俘獲切割反應(yīng)過程中生成的碳正離子,,減少這些碳正離子對(duì)部分氨基酸側(cè)鏈的進(jìn)攻導(dǎo)致的副反應(yīng),,比較容易產(chǎn)生副反應(yīng)的氨基酸有:Trp,Tyr,。切割試劑用量一般10-15ml/g樹脂,。常用的切割配比:HF/p-cresol/p-thiocresol(90/5/5),TFA/TIS/EDT/H2O(94/1/2.5/2.5),,反應(yīng)一般是在室溫條件下2h-4h,。
1.3.3.多肽合成中主要問題
1.3.3.1.消旋及其反應(yīng)機(jī)理
多肽合成過程中,部分氨基酸在活化的過程中會(huì)導(dǎo)致不同程度的消旋,,特別容易消旋的氨基酸有:Cys,,His,Phe,,當(dāng)然這些消旋化還和溶劑,,溫度以及合成中的有機(jī)堿等因素有關(guān)。對(duì)于這些氨基酸,,可以通過采用高效縮合試劑,,減少反應(yīng)時(shí)間,可以減少消旋的比例,,一般條件選擇適當(dāng),,消旋化都可以控制在5%以內(nèi),。消旋反應(yīng)機(jī)理如下:
圖8 消旋反應(yīng)機(jī)理
1.3.3.2.二酮**(DKP)反應(yīng)
DKP副反應(yīng)出現(xiàn)在FMOC-Wang樹脂合成過程中,主要出現(xiàn)在個(gè)氨基酸為Pro的時(shí)候,,當(dāng)?shù)诙€(gè)氨基酸脫FMOC的時(shí)候,,α-氨基被游離出來之后,立即對(duì)Wang樹脂的芐酯鍵進(jìn)行分子內(nèi)胺解,,生成六元環(huán)二酮**衍生物,,同時(shí)從Wang樹脂上釋放出來,導(dǎo)致反應(yīng)終止,。該反應(yīng)非常迅速,,文獻(xiàn)報(bào)道采用50%Pip/DMF,脫1min,,4min的條件,,但是我們實(shí)驗(yàn)證明在多數(shù)情況下,即使是1min左右反應(yīng)就超過了20%,。因此一般在末端個(gè)氨基酸為Pro的時(shí)候,,建議采用2-Cl-Trt樹脂合成,由于該樹脂巨大的空間阻力,,可以*消除該副反應(yīng),。這個(gè)副反應(yīng)在BOC策略合成過程中,卻可以*避免,,因?yàn)锽OC在使用TFA脫除后,,使氨基以TFA鹽的形式存在,從而失去了親核性,,不能進(jìn)攻芐酯鍵,。
圖9 DKP反應(yīng)機(jī)理
1.3.3.3.困難序列多肽合成
固相多肽合成中也經(jīng)常遇到多肽合成失敗或合成效率很低的問題,這里面的主要原因是由于多肽序列引起的,,因?yàn)橛行┒嚯男蛄性跇渲闲纬?beta;-折疊,,改變了樹脂的溶脹性能,還有可能將反應(yīng)的活性位點(diǎn)埋藏在樹脂里面,,這樣使得反應(yīng)很難進(jìn)行,,目前報(bào)道使用的主要方法有:
使用混合溶劑,DMSO/DMF,,6N 胍啶/DMF溶液
提高反應(yīng)溫度,,或采用微波方法
使用高離液鹽,LiCl,,NaClO4等,。
使用溶脹性能更好的PEG-PS樹脂,同時(shí)減少樹脂擔(dān)載量(0.05-0.2mmol/g)
1.4.合成多肽分析鑒定方法
多肽的分析鑒定方法有多肽一級(jí)結(jié)構(gòu),,二級(jí)結(jié)構(gòu)鑒定,,多肽一級(jí)結(jié)構(gòu)包括:質(zhì)譜分析,,氨基酸組成分析,氨基酸序列分析,。二級(jí)結(jié)構(gòu)包括:圓二色譜(CD),NMR,,X-衍射等方法,。
1.4.1.純度分析
多肽的純度分析,一般都采用HPLC進(jìn)行分析,,選擇RP-C18,,粒徑5μm,孔徑300A,,4.6×150mm,,流動(dòng)相:A,0.1% TFA/H2O,;B,,0.1% TFA/ACN,洗脫梯度,,5%B--65%B,,時(shí)間30min。也有些多肽,,特別是短肽,,由于親水性強(qiáng),在C18上保留很弱,,需要改變條件,,這里主要有兩種方法:一個(gè)改變分析梯度,可以將起始梯度改為2%,,等度或小梯度洗脫,;另外一個(gè)方法是在流動(dòng)相中加入強(qiáng)離子對(duì)試劑,如七氟丁酸,,十八烷基磺酸鈉等,。
1.4.2.一級(jí)結(jié)構(gòu)分析
1.4.2.1.質(zhì)譜分析
質(zhì)譜分析的目的主要是確證分子量,當(dāng)然采用MS/MS可以部分的了解多肽序列的信息,,但是這個(gè)需要比較全的數(shù)據(jù)庫(kù)作為基礎(chǔ),,分析才能比較準(zhǔn)確。由于多肽性質(zhì)不穩(wěn)定,,需要采用軟電離技術(shù),,目前多肽分析主要使用了電噴霧(ESI-MS),基質(zhì)輔助激光解吸(MALDI-MS),。其中ESI-MS通常會(huì)給出多電荷峰,,電荷數(shù)目和多肽序列上氨基,,胍基,咪唑基的數(shù)目有關(guān),,因此,,經(jīng)常給出了雙電荷,三電荷等離子峰,。MALDI-MS可以分析蛋白大分子,,而且通常情況下很少帶多電荷,因此數(shù)據(jù)直接對(duì)應(yīng)了分子離子峰,,容易分析,。此外,通常在分析長(zhǎng)肽或蛋白過程中,,需要添加NH4,,Na,K等離子,,提高靈敏度,,所以一般在MS中出現(xiàn)一組峰,分別對(duì)應(yīng):(M+H)+,,(M+NH4)+,,(M+Na)+,(M+K)+,。
1.4.2.2.氨基酸組成分析
氨基酸組成分析一般需要產(chǎn)品的純度較高,,它可以給出多肽中氨基酸的種類,數(shù)目,。分析過程首先通過酸水解破壞肽鍵,,典型酸水解的條件是:真空條件下,110℃,,用6M鹽酸水解16至72小時(shí),。酸水解雖然很有用,但酸水解條件下不能獲得完整的氨基酸分析,,因?yàn)樘於0泛凸劝滨0返膫?cè)鏈含有酰胺鍵,,用于切斷蛋白質(zhì)肽鍵的酸也可以將天冬酰胺轉(zhuǎn)換為天冬氨酸,谷氨酰胺轉(zhuǎn)換為谷氨酸,。由于水解溫度比較高,,色氨酸的吲哚環(huán)容易被空氣氧化,即使在密封的管中,,色氨酸的吲哚環(huán)也幾乎都被破壞了,。因此蛋白質(zhì)的色氨酸含量往往是通過它的紫外吸收光譜估計(jì)的,也可以通過堿水解分析色氨酸的含量。半胱氨酸在酸水解中也不能精確測(cè)定,,要精確測(cè)量需要在蛋白質(zhì)水解之前進(jìn)行氧化或羧甲基化,,形成的衍生物在酸水解之后才能定量。
1.4.2.3.氨基酸序列分析
氨基酸序列分析的基本原理是Edman降解,,主要涉及耦聯(lián),、水解、萃取和轉(zhuǎn)換等4個(gè)過程,。首先使用苯異硫氰酸酯(PITC)在pH9.0的堿性條件下對(duì)蛋白質(zhì)或多肽進(jìn)行處理,,PITC與肽鏈的N-端的氨基酸殘基反應(yīng),形成苯氨基硫甲酰(PTC)衍生物,,即PTC-肽。然后PTC-肽用三***處理,,N-端氨基酸殘基肽鍵被有選擇地切斷,,釋放出該氨基酸殘基的噻唑啉酮苯胺衍生物。接下來將該衍生物用有機(jī)溶劑(例如氯丁烷)從反應(yīng)液中萃取出來,,而去掉了一個(gè)N-端氨基酸殘基的肽仍留在溶液中,。萃取出來的噻唑啉酮苯胺衍生物不穩(wěn)定,經(jīng)酸作用,,再進(jìn)一步環(huán)化,,形成一個(gè)穩(wěn)定的苯乙內(nèi)酰硫脲(PTH)衍生物,即PTH-氨基酸,。留在溶液中的減少了一個(gè)氨基酸殘基的肽再重復(fù)進(jìn)行上述反應(yīng)過程,,整個(gè)測(cè)序過程現(xiàn)在都是通過測(cè)序儀自動(dòng)進(jìn)行。
1.4.3.二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
1.4.3.1.圓二色譜(CD)
圓二色譜是一種特殊的吸收譜,,它通過測(cè)量蛋白質(zhì)等生物大分子的圓二色光譜,,從而得到生物大分子的二級(jí)結(jié)構(gòu),簡(jiǎn)單,、快捷,,廣泛應(yīng)用在蛋白質(zhì)折疊,蛋白質(zhì)構(gòu)象研究,,酶動(dòng)力學(xué)等領(lǐng)域,。圓二色譜紫外區(qū)段(190-240nm),主要生色團(tuán)是肽鏈,,這一波長(zhǎng)范圍的CD譜包含了生物大分子主鏈構(gòu)象的信息,。α-螺旋構(gòu)象的CD譜在222nm、208nm處呈負(fù)峰,,在190nm附近有一正峰,。β-折疊構(gòu)象的CD譜,在217-218nm處有一負(fù)峰,在195-198nm處有一強(qiáng)的正峰,。無規(guī)則卷曲構(gòu)象的CD譜在198nm附近有一負(fù)峰,,在220nm附近有一小而寬的正峰。
1.4.3.2.核磁共振(NMR)
隨著二維,、三維以及四維NMR的應(yīng)用,,分子生物學(xué)、計(jì)算機(jī)處理技術(shù)的發(fā)展,,使NMR逐漸成為大分子結(jié)構(gòu)物質(zhì)分析的主要方法之一,。NMR可用于確定氨基酸序列、分布以及構(gòu)象,。目前,,NMR在分析分子中含少于30個(gè)氨基酸的小肽時(shí)是非常有用的,分析結(jié)果快速準(zhǔn)確,。
1.4.3.3.X-衍射
X-衍射可獲得有關(guān)化合物晶型的直接信息,,而且可以判斷相對(duì)與構(gòu)型。
多肽標(biāo)記及修飾
目前多肽標(biāo)記及修飾的內(nèi)容非常多,,廣泛應(yīng)用在多肽藥物,,多肽生物學(xué),多肽抗體以及多肽試劑的研究中,。目前應(yīng)用廣泛的有:非放射性核素標(biāo)記(C13,,H2),熒光標(biāo)記(FAM,,F(xiàn)ITC),,生物素標(biāo)記,磷酸化修飾等,。
2.1.非放射性核素標(biāo)記
目前在非放射性核素標(biāo)記中,,使用廣泛的仍然是C13,H2,,因?yàn)槠涫褂冒踩?,放射性小。現(xiàn)在有比較*的非放射性標(biāo)記的氨基酸,,可以按照正常的多肽合成方法將標(biāo)記好的氨基酸直接連接到多肽上,。
2.2.熒光標(biāo)記
熒光標(biāo)記由于沒有放射性,實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單,。因此,,目前在生物學(xué)研究中熒光標(biāo)記應(yīng)用非常廣泛,熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,,對(duì)于有游離羧基的采用的方法與接肽反應(yīng)相同,,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法連接,。但是對(duì)于FITC標(biāo)記,需要在連接FITC前,,增加一個(gè)氨基己酸,,避免在切割的過程中被TFA切割掉。
2.3.生物素標(biāo)記
生物素-親合素系統(tǒng) (biotin-avidin system,,BAS),,是70年代后期應(yīng)用于免疫學(xué),并得到迅速發(fā)展的一種新型生物反應(yīng)放大系統(tǒng),。由于它具有生物素與親合素之間高度親和力及多級(jí)放大效應(yīng),,并與熒光素、酶,、同位素等免疫標(biāo)記技術(shù)有機(jī)地結(jié)合,,使各種示蹤免疫分析的特異性和靈敏度進(jìn)一步提高。主要有用于標(biāo)記多肽氨基的生物素N-羥基丁二酰亞胺酯(BNHS)和生物素對(duì)硝基酚酯(pBNP),,其中以BNHS常用,,當(dāng)然,也可以直接使用生物素也可以標(biāo)記,,因?yàn)槠浣Y(jié)構(gòu)上有個(gè)游離的羧基,采用HBTU/HOBt/DIEA方法縮合,,由于生物素的溶解度低,,使用DMSO/DMF的混合溶劑增加溶解度。
2.4.磷酸肽合成
磷酸肽在生命過程中發(fā)揮重要作用,,磷酸化的位置在多肽上的Ser,,Thr,Tyr,。目前磷酸肽合成一般都采用磷酸化氨基酸,,目前使用的都是單芐基磷酸化氨基酸,Tyr也可以直接使用磷酸化氨基酸,。磷酸化氨基酸的連接一般采用HBTU/HOBt/DIEA方法,,但是目前采用該方法合成磷酸化也有缺點(diǎn),特別是在合成多磷酸化多肽或長(zhǎng)肽的時(shí)候,,連接效率低,,后產(chǎn)品純度很低,對(duì)于這種磷酸化多肽,,我們考慮采用后磷酸化方法,,其合成過程就是在多肽合成結(jié)束后,選擇性脫去要標(biāo)記的氨基酸的側(cè)鏈保護(hù)基,,對(duì)于Tyr,,Thr可以直接使用側(cè)鏈不保護(hù)的氨基酸進(jìn)行反應(yīng),而Ser可以采用Fmoc-Ser(trt),在1% TFA/DCM條件下可以定量的脫除,。后磷酸化,,采用雙芐基亞磷酰胺,四氮唑生成亞磷酰胺四唑活性中間體,,連接到羥基上,,隨后在過氧酸下氧化生成磷酰基,,完成反應(yīng),。
蛋白結(jié)構(gòu)與功能模擬多肽
多肽在與蛋白受體結(jié)合發(fā)揮功能的時(shí)候,總是先折疊出某些特殊的結(jié)構(gòu),,多肽類似物合成主要是為了模擬這些結(jié)構(gòu),,保持或提高生物活性,同時(shí)也為了改變多肽的穩(wěn)定性,,提高其抗酶解能力,。
3.1.α-螺旋多肽
α-螺旋是蛋白結(jié)構(gòu)中為普通的一種,但是一般多肽在溶液中大多是無規(guī)卷曲的,,目前使用多的方法是多肽保持α-螺旋結(jié)構(gòu)就是在多肽表面通過共價(jià)鍵將處在α-螺旋結(jié)構(gòu)的兩個(gè)氨基酸連接起來,,選擇的位點(diǎn)(i,i+4或i,,i+7),,選擇的化學(xué)鍵包括:二硫鍵,硫醚鍵,,酰胺鍵,,烯烴鍵(RCM)等方法。
3.1.1.二硫鍵
二硫鍵廣泛存在與蛋白結(jié)構(gòu)中,,對(duì)穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)具有非常重要的意義,,二硫鍵一般是通過序列中的2個(gè)Cys的巰基,經(jīng)氧化形成,。形成二硫鍵的方法很多:空氣氧化法,,DMSO氧化法,過氧化氫氧化法等,。二硫鍵的合成過程,,可以通過Ellman檢測(cè)以及HPLC檢測(cè)方法對(duì)其反應(yīng)進(jìn)程進(jìn)行監(jiān)測(cè)。
3.1.2.硫醚鍵
硫醚鍵的形成可以通過序列中的Lys,,將溴乙酸連接到Lys的側(cè)鏈氨基上,,利用其和巰基的特異性反應(yīng),反應(yīng)在緩沖溶液中進(jìn)行,,迅速高效,。
3.1.3.酰胺鍵
多肽的內(nèi)酰胺環(huán)肽的合成一般是利用Lys,,Asp(Glu)的選擇性保護(hù),在固相上直接環(huán)化,。BOC策略中可以采用BOC-Lys(Fmoc),,BOC-Asp(OFm),F(xiàn)MOC策略中可以采用FMOC-Lys(Aloc),,F(xiàn)MOC-Asp(Allyl),。對(duì)于首尾環(huán)肽,還可以先合成保護(hù)的多肽,,然后在液相中環(huán)化生成目標(biāo)多肽,。
3.1.4.烯烴鍵(RCM)
RCM反應(yīng)是一個(gè)過渡金屬催化反應(yīng),其反應(yīng)中使用催化劑:(Cy3P)2Cl2Ru=CHPh,,可以催化烯烴環(huán)化,,過程中脫去一分子乙烯。
圖10 固相RCM反應(yīng)
該反應(yīng)也可以在固相樹脂上直接環(huán)化,反應(yīng)條件:15-25% (Cy3P)2Cl2Ru=CHPh DCM,60-80℃,,24-48h,。
3.2.TASP(template-assembled synthetic peptide)多肽
瑞士Basel大學(xué)的化學(xué)家*提出TASP的概念,他們利用具有“發(fā)夾”結(jié)構(gòu)的肽鏈作為模板,,然后將具有α-螺旋結(jié)構(gòu)的多肽直接連接到模板上,,模擬蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu)。
3.3.長(zhǎng)肽或蛋白合成
3.3.1.FMOC-tbu片段縮合方法
FMOC-tbu片段縮合方法在合成長(zhǎng)肽以及蛋白上面運(yùn)用非常廣泛,,其合成過程首先是合成保護(hù)性肽片段,,經(jīng)過純化后,將幾個(gè)片段在液相或固相上組裝起來,。使用本方法主要注意幾個(gè)方面:片段的選擇,片段的合成與純化,,片段縮合方法,。片段選擇要考慮到片段連接反應(yīng)時(shí)間長(zhǎng),容易導(dǎo)致消旋,,故片段的C末端好選擇Gly,,Pro。合成的片段一般需要經(jīng)過C4,,C8等純化,,對(duì)于溶解性很差的多肽,可以采用硅膠柱層析方法進(jìn)行純化,。由于片段的分子大,,在樹脂內(nèi)移動(dòng)速度慢,故反應(yīng)時(shí)間一般都很長(zhǎng),,而且反應(yīng)過程中與片段濃度關(guān)系很大,,溶解的時(shí)候,,盡量提高片段的濃度。對(duì)多種條件的選擇,,發(fā)現(xiàn)采用DMF為溶劑,,DIC/HOBt的方法縮合效率高,消旋也小,。
圖11 FMOC-tbu片段縮合示意圖
3.3.2.自然化學(xué)連接(Native Chemical Ligation)
自然化學(xué)連接方法的優(yōu)點(diǎn)是可以采用*脫保護(hù)的多肽,,因此不存在溶解性問題,其反應(yīng)也是在緩沖水溶液中進(jìn)行,,由于其利用的是巰基和硫酯的特異性反應(yīng),,再經(jīng)過由S到N的轉(zhuǎn)變完成肽鍵的合成。
圖13自然化學(xué)連接
總之,,今后多肽化學(xué)的研究,,不僅是將更多的有機(jī)化學(xué)合成新方法,新技術(shù)引入到多肽研究當(dāng)中,,而且對(duì)蛋白的結(jié)構(gòu)以及功能模擬,,開展結(jié)構(gòu)活性研究(structure activity relationship)將是研究開發(fā)的熱點(diǎn),因?yàn)檫@將為揭示蛋白的內(nèi)在的生物活性本質(zhì)提供大量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),。
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