技術服務 抗體測序服務
艾柏森生物科技有限公司作為值得信賴的抗體研發(fā)服務供應商,擁有專業(yè)的技術團隊,,可為客戶提供的抗體測序服務,。艾柏森生物打造的全新一代抗體測序平臺,,基于蔦槍法與抗體數(shù)據(jù)庫相結合的技術“Database Assisted Shotgun Sequencing”(DASS)技術,這項技術還適用于其他亞型和不同形式的抗體,,如:IGM,,熒光偶聯(lián)抗體,固定化抗體,,不同物種的抗體等,。
等重氨基酸測序
與其它基于MS測序方法不同的是,我們可以分辨大多數(shù)等重氨基酸復合物
★ W可與GE,、AD,、SV區(qū)分
★ R可從GV中區(qū)別出來
★ Q可從GA、K中區(qū)別出來
★ N可從GG中區(qū)別出來
Figure 1.Workflow of Service
運用DASS技術對V,、J,、C片段測序
目前已有的一些數(shù)據(jù)庫(如NCBI)雖包含抗體V,、J、C片段序列,,但是在抗體成熟的過程中,,一個B細胞中的抗體基因要經(jīng)過體細胞突變的過程才會產(chǎn)生高親和力的成熟抗體。
我們采用*的計算方法,,并能匹配相應物種的突變肽段,,保證每條肽段都會被檢測到,且每一個氨基酸位點都會生成20-7-條MS/MS光譜,,對難測序的proline和arginine的肽段也可實現(xiàn)測序,。
Figure 2.Sequence coverage is verified with the integrity of the combination of multipleLC-MS/MS datasets
CDR3區(qū)測序
抗體輕鏈的CDR3去多由胚系基因編碼,而重鏈的CDR3區(qū)則由D基因編碼,,D基因大部分區(qū)域由于受到核酸酶及末端轉(zhuǎn)移酶等重組酶的作用而發(fā)生基因重排,,導致抗體重鏈CDR區(qū)在數(shù)據(jù)庫中無法進行同源對比,而只能對其進行de novo測序,。高質(zhì)量的質(zhì)譜數(shù)據(jù)與高效率的數(shù)據(jù)挖掘算法的結合,使我們對抗體CDR3區(qū)域的解讀更為有力,,我們可以測得數(shù)據(jù)庫中無同源序列的20kDa的蛋白質(zhì),。
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