01

 為什么DH5α生長速度慢/長斑??？

原因：

（1）DH5α感受態(tài)細胞生長速度較慢,；

（2）涂板菌液太多，菌落過多,，導致菌落生長速度慢/菌落小,。

方案：

（1）延長菌的生長時間；

（2）建議減少菌液涂布量,，剩下的菌液可放4℃保存,，看菌的生長狀況再決定去留。

02

DH5α和DH5α-的區(qū)別是什么,？

DH5α需要IPTG和X-Gal共同使用進行藍白斑篩選,。

DH5α-無需加入IPTG，只需X-Gal即可進行藍白斑篩選,。

03

Mach1T1和Turbo哪個生長速度快,？

Turbo

04

細菌怎么實現(xiàn)抗噬菌體的特點？

（1）抑制吸附：改變細菌表面的受體蛋白結構,，受體缺失,，競爭性抑制產(chǎn)物的作用等；

（2）阻止噬菌體DNA的注入,；

（3）降解或干擾噬菌體DNA,；

（4）流產(chǎn)感染。

05

DB3.1細胞是怎樣實現(xiàn)含有ccdB基因在細胞內(nèi)擴增的,？

ccdB蛋白的毒性作用是通過與促旋酶GyrA亞基第462位氨基酸相結合使得DNA斷裂后不能進行修復,，DNA合成受阻，導致細胞死亡,。

DB3.1菌株的細胞含有gyrA462基因,，能夠表達GyrA亞基蛋白與ccdB結合的區(qū)域，可以競爭性抑制ccdB蛋白的活性,，使得促旋酶可以正常行使功能,，實現(xiàn)含有ccdB的載體的正常擴增。

06

 從JM110細胞制備的質?？梢杂糜诨贒pn I消化的點突變試劑盒嗎,？

不能,。JM110是甲基化基因dam，dcm缺失突變株,，在其內(nèi)擴增的質粒無法進行甲基化,，而點突變試劑盒中的DpnⅠ的作用是消化甲基化的模板質粒。

注：

（1）基于DpnⅠ消化的點突試劑盒是以甲基化的載體質粒作為模板,，設計一對點突引物進行擴增,；

（2）使用DpnⅠ消化甲基化的模板質粒；

（3）PCR擴增的片段沒有甲基化,，因此不能被DpnⅠ消化降解,；

（4）將DpnⅠ消化后的產(chǎn)物轉入感受態(tài)細胞。

07

大腸桿菌質粒甲基化有哪幾類,？通過何種方法可以去甲基化,？何種方法來驗證質粒已經(jīng)去甲基化？JM110可以用于大量質粒制備嗎,？

2種,，Dam，Dcm（Dam甲基化酶可將GATC序列中的腺嘌呤N6位點進行甲基化修飾,，Dcm甲基化酶可將CCAGG和CCTGG序列中胞嘧啶C5位點進行甲基化修飾）,。  

可以將質粒轉化進入JM110感受態(tài)細胞中，實現(xiàn)質粒的去甲基化,。

可以使用XbaⅠ酶切的方法驗證質粒是否去甲基化,。

不可以，JM110感受態(tài)細胞轉化效率低,，并且它不能使質粒甲基化,，容易引起突變。

08

stbl3和stbl4的區(qū)別（菌株是從哪家公司來的）,？適用于哪種類型的質粒構建,？

區(qū)別：（Stbl3和Stbl4菌株是從invitrogen公司來的）Stbl3為鏈霉素抗性菌株，Stbl4是四環(huán)素抗性菌株,。Stbl4較Stbl3生長較慢,。

適用于逆轉錄病毒或慢病毒質粒的構建，即帶有5’-LTR和3’-LTR結構的質粒,，如pLV-Flag質粒,。

09

藍白斑篩選原理是什么？

（1）藍白斑篩選的條件是具有LacZα編碼區(qū)的載體與可以進行α-互補的宿主細胞（如Mach1-T1,、*0,、DH5α、JM109,、DH10B和NEB10-beta等）配合使用,；

（2）一些載體具有LacZα基因編碼區(qū)，可以編碼LacZ蛋白N端的α片段（此編碼區(qū)中含有多克隆位點,，允許外源基因的插入）,。其宿主細胞是一種僅可以編碼LacZ蛋白C端ω區(qū)域的細胞，載體和宿主單獨產(chǎn)生的LacZ片段并沒有β-半乳糖苷酶活性,；

（3）當載體進入宿主細胞時,，載體的α片段和宿主的ω片段實現(xiàn)了互補，由α-互補產(chǎn)生的β-半乳糖苷酶具有活性,，在IPTG和X-Gal的存在下,，菌落變?yōu)樗{色；

（4）但是當外源基因插入到在載體LacZα編碼區(qū)中,，破壞了LacZ基因α片段的正常表達,，使得其與宿主細胞不能進行α-互補，因此在IPTG和X-Gal的存在下,，菌落為白色,。

10

DH10B和DH10Bac有何區(qū)別？

DH10B是一種可以用來進行大質粒（>8 kb）轉化的克隆感受態(tài)細胞,。

DH10Bac是一種用于昆蟲桿狀病毒Bac-to-Bac系統(tǒng)中同源重組所用的菌株,，其可用于pFastBac系列質粒（如pFastBacl和pFastBacDual）的轉化。其感受態(tài)細胞中含有用于pFastBac系列質粒重組的Bacmid和輔助質粒,。

11

BL21 和BL21(DE3)的區(qū)別是什么,，DE3代表什么基因？

BL21(DE3)是在BL21菌株的基因組上整合了T7 RNA聚合酶基因,，適合于T7系統(tǒng)的表達（具有T7 promoter）,。

DE3是一段可以表達T7 RNA聚合酶的序列，通過溶原性噬菌體將序列整合到細菌基因組中,。

12

 BL21(DE3)和T7 express表達菌有什么區(qū)別,？

T7 express表達菌株來源于BL21菌株，T7 express與BL21(DE3)的主要區(qū)別在于T7 express菌株的T7 RNA聚合酶基因整合在菌株基因組中的Lac操縱子區(qū)域,，并具有抗T1噬菌體感染的特點,。BL21（DE3）菌株中的T7 RNA聚合酶基因來源于噬菌體溶原方法，存在噬菌體成分,。

13

表達含有稀有密碼子的基因需要選擇哪類感受態(tài)細胞,，這類細胞實現(xiàn)表達的原理是什么?

Rosetta（DE3）

Rosetta（DE3）具有一個帶有氯霉素抗性的質粒，可以補充6種稀有密碼子的tRNA（精氨酸 Arg R: AGA  AGG,，異亮氨酸 Ile I: AUA,， 脯氨酸 Pro P CCC， 亮氨酸Leu  L：CUA，甘氨酸 Gly G:GGA）,。

14

使用BL21(DE3)細胞進行蛋白表達時,，細胞一誘導就死，請問用什么方法解決,？

可以使用BL21（DE3）pLysS 或T7pLysY表達菌株,。

15

pLysY和pLysS有什么區(qū)別？

pLysY表達的T7溶菌酶保留了對T7RNA聚合酶的抑制作用,，但是缺失了水解細胞壁的酰胺酶活性,，避免了誘導過程中細胞的裂解。

pLysS表達的T7溶菌酶具有完整活性,。

16

 含有二硫鍵的蛋白請問用何種感受態(tài)細胞比較好,？

OrigamiB（DE3）或Shuffle T7-K12，Shuffle T7-B,。

17

增加表達蛋白的可溶性表達采用何種感受態(tài)細胞,？

OrigamiB（DE3）或Shuffle T7-K12，Shuffle T7-B,。

18

使用OrigamiB（DE3）感受態(tài)細胞時應該注意什么,？

OrigamiB（DE3）感受態(tài)細胞具有卡那霉素和四環(huán)素抗性，所以轉化的質粒不能是卡那霉素抗性或四環(huán)素抗性的,。

19

說明書上寫這XL10-Gold細胞具有四環(huán)素和氯霉素抗性,，我的質粒是氨芐青霉素抗性，請問轉化這個質粒時,，需要加四環(huán)素和氯霉素抗生素嗎,？

不用，四環(huán)素和氯霉素是在菌株的基因組中穩(wěn)定存在的,，不用加這兩種抗生素,。

20

下面的抗生素如何配制，工作濃度是多少,？

配置方法：通?？股厥且怨ぷ鳚舛?000倍的濃度儲存的。以配置10ml的Amp為例,，首先稱取1 g粉末狀的氨芐抗生素藥品,，裝入15 ml EP管中，使用ddH2O溶解并定容到10 ml,，搖晃使其*溶解后,，使用0.22 μm的過濾器過濾除菌，分裝到1.5 ml EP管中保存使用,。

21

Rosetta（DE3）感受態(tài)細胞的工作原理是什么,？

Rosetta（DE3）具有一個帶有氯霉素抗性的質粒,，可以補充6種稀有密碼子的tRNA（精氨酸 Arg R: AGA  AGG，異亮氨酸 Ile I: AUA,， 脯氨酸 Pro P CCC,， 亮氨酸Leu  L：CUA，甘氨酸 Gly G:GGA）,。

22

轉化效率可達10⁸ cfu/μg,，是什么意思,？如何測定轉化效率,？

指的是每微克超螺旋構象的DNA即pUC19（2686 bp）經(jīng)轉化后可以得到的陽性克隆菌落的個數(shù)為10⁸個。

大腸桿菌感受態(tài)通常使用0.1 ng/μl pUC19作為測定轉化效率的質粒,，在100 μl感受態(tài)細胞中加入1 μl pUC19質粒,，轉化完成后加入900ul SOC孵育1 h（此時pUC19的濃度為0.1 ng/ml），其后吸取10 μl菌液稀釋到990 μl SOC中（此時pUC19的濃度為0.001 ng/ml）,，吸取100 μl菌液涂在抗性板（此時pUC19的含量為0.0001 ng）,，37℃培養(yǎng)過夜后，數(shù)取菌落個數(shù)并計算轉化效率,。假設平板生長菌落數(shù)為100個,，那么轉化效率計算公式:

100 cfu/0.0001ng=1×10⁹ cfu/μg

農(nóng)桿菌感受態(tài)通常使用超螺旋構象的100 ng/μl pCAMBIA2301（11633 bp）作為測定轉化效率的質粒。

23

羧芐青霉素為何比氨芐青霉素在搖菌中效果要好,？

細菌生長過程中培養(yǎng)基pH降低,，羧芐青霉素在pH降低的情況下仍可穩(wěn)定存在，而氨芐青霉素在pH降低后不穩(wěn)定,，易降解,。

24

氨芐抗生素的平板上的衛(wèi)星菌落是如何產(chǎn)生的？

具有Amp抗性的細菌生長過程中會產(chǎn)生β-內(nèi)酰胺酶,，并釋放到細胞外,。而β-內(nèi)酰胺酶可以降解氨芐抗生素，使得菌落周圍沒有了抗性,，長出衛(wèi)星菌落,。

25

需要做phage display（噬菌體展示實驗），請問用哪種感受態(tài)細胞,？

XL1-Blue感受態(tài)細胞

26

分別簡單敘述一些大腸桿菌感受態(tài)細胞和農(nóng)桿菌感受態(tài)細胞的轉化操作步驟

大腸桿菌感受態(tài)細胞轉化步驟：

（1）將100 μl感受態(tài)細胞放在冰上溶解,；

（2）將1-10 μl的連接產(chǎn)物加入到100 μl感受態(tài)細胞中，輕彈底部混勻,；

（3）冰上孵育20-30 min,；

（4）42℃，熱擊90 sec,；

（5）迅速放到冰上孵育2 min,；

（6）加入900 μl 無抗性LB，200 rpm ，37℃孵育1 h,；

（7）6000 rpm離心收集菌,，棄掉900 μl 上清，使用剩余的LB輕輕重懸菌液,；

（8）將重懸菌液涂在相應的抗性板上,。

注：具有Amp抗性的質粒(<8 kb)轉化后，可以不經(jīng)過孵育直接涂板,。

農(nóng)桿菌感受態(tài)細胞轉化步驟：

（1）將100 μl感受態(tài)細胞放在冰上溶解,；

（2）將1-10 μl的連接產(chǎn)物加入到100 μl感受態(tài)細胞中，輕彈底部混勻,；

（3）冰上孵育5 min,，液氮5 min，37℃放置5 min,，冰浴5 min,；

（4）加入900 μl SOC培養(yǎng)基，28℃振蕩培養(yǎng)2-3 h,；

（5）6000 rpm離心收集菌,，棄掉900 μl 上清，使用剩余的SOC輕輕重懸菌液,；

（6）將重懸菌液涂在相應的抗性板上,。

27

具有卡那抗性的質粒pEGFP-N1為什么不能轉化到4種農(nóng)桿菌感受態(tài)細胞中？

因為pEGFP-N1不具有農(nóng)桿菌的復制起始子,，所以不能在農(nóng)桿菌中擴增,。

28

農(nóng)桿菌細胞是如何將外源基因轉移植物細胞核基因組中的？

小知識：農(nóng)桿菌轉化的雙元載體系統(tǒng)  

包含兩個不同的質粒：一種是野生宿主源的小復制子（wide-host-range small replicon）,，含有一復制起始點（ori）,，能夠讓質粒在包括大腸桿菌和農(nóng)桿菌在內(nèi)的細菌內(nèi)維持生長，這類質粒通常含有a）替換T-DNA的外源DNA,。b）T-DNA左右邊界序列（或至少含T-DNA右邊界）,。c）同時維持和篩選大腸桿菌和農(nóng)桿菌的標記基因。d）植物生長的篩選標記基因,。 一種是輔助型Ti質粒（helper Ti plasmid）,，缺乏完整的T-DNA區(qū)域，但是含有完整的vir區(qū),，能夠激活T-DNA的轉移,。

（1）構建重組質粒，將目的基因插入到T-DNA區(qū),，隨后將重組質粒轉化進入農(nóng)桿菌感受態(tài)細胞中,；

（2）農(nóng)桿菌含有Ti 質粒,，借助Ti質粒的功能，使插入目的基因的T-DNA轉移進宿主植物中并進一步整合,、表達,。

29

LB，SOB,，SOC,，2×YT培養(yǎng)基的區(qū)別是什么？

LB培養(yǎng)基用于一般的細菌培養(yǎng),。

SOB培養(yǎng)基是一種富營養(yǎng)培養(yǎng)基,。與LB培養(yǎng)基相比，SOB培養(yǎng)基中含有兩倍多蛋白胨,，蛋白胨中富含氨基酸及多肽,。另外，SOB培養(yǎng)基中含有鎂離子,，鎂離子是高密度培養(yǎng)必須的離子。在SOB培養(yǎng)基中的大腸桿菌具有更高的轉化效率,。
SOC培養(yǎng)基是SOB加入葡萄糖以抑制分解代謝,，增加生長速度。

2×YT 培養(yǎng)基是比LB培養(yǎng)基營養(yǎng)更為豐富的培養(yǎng)基,。細胞能夠生長更長的時間,，濃度達到更高的值。

30

制備腺病毒選擇哪個感受態(tài)細胞,？

BJ5183-AD-1或BJ5183

31

感受態(tài)細胞Shuffle T7-K12和Shuffle T7-B 感受態(tài)細胞有什么區(qū)別,？

Shuffle T7-K12來源于K12菌株,，可以組成型表達LacI阻遏蛋白，降低基因表達的背景,，有利于毒性蛋白的表達,。

Shuffle T7-B 是BL21 增強型菌株，適合非毒性蛋白的表達,。

不同的蛋白在這兩種細胞中的可溶性差異很大,，所以建議兩種都試一下。

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