冷凍干燥機用于細菌領域也常被稱為菌種冷凍干燥機、細菌凍干機、菌種凍干機等，可以用于凍干保存細菌,、菌種等，其操作步驟如下：

1. 所用培養(yǎng)基及凍干保護劑均高壓滅菌,；

2. 取分離所得細菌菌液或甘油保存的細菌一環(huán),，在培養(yǎng)板上分區(qū)或蛇形劃板（大腸桿菌在麥康凱平板上劃板），37℃倒置培養(yǎng)過夜,；

3. 取一只干凈的試管,，倒入約10mL培養(yǎng)液（大腸桿菌用LB培養(yǎng)液），從培養(yǎng)過夜的平板中挑取一個單菌落于該培養(yǎng)液中,，37℃振蕩培養(yǎng)過夜,；

4. 取10個干凈的西林瓶，每瓶加入1mL凍干保護劑,，再加入1mL培養(yǎng)過夜的菌液,，蓋上橡膠塞，留出氣孔,，標記好之后放入-80℃冰箱使其冷凍,；

5. 啟動冷凍干燥機預熱約30min，迅速將已冷凍的菌液放于冷凍干燥機上,，一般十幾小時之后細菌已凍干,，關閉冷凍干燥機，取出已凍干的細菌,，壓蓋,，放于-80℃超低溫冰箱保存，可達十年之久,。

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