Genetic Signatures成立于2001年,由Geoffrey Grigg博士(原澳大利亞聯(lián)邦科學與工業(yè)研究組織(CSIRO)分子生物學部主任)創(chuàng)立,。甲基化分析中使用廣泛的方法是亞硫酸氫鹽法,,由Grigg博士在英國劍橋設想,并被減少到CSIRO實驗室的實踐中[1],。初的方法隨后得到改進,這些改進導致了遺傳簽名MethylEasy™DNA亞硫酸氫鈉修飾產(chǎn)品系列的開發(fā)和發(fā)布。
由于改進的轉化方法和用于胞嘧啶甲基化檢測的應用,,發(fā)現(xiàn)了一個有趣的發(fā)現(xiàn):通過亞硫酸氫鈉處理微生物DNA能夠?qū)⑺姆N核酸堿基還原成僅三個堿基,通過將胞嘧啶轉化為胸腺嘧啶,。該技術被稱為3base ™,,是我們的EasyScreen ™病原體檢測試劑盒的基石。
此后,,遺傳標志開發(fā)并商業(yè)化了一套基于EasyScreen ™實時PCR的產(chǎn)品,,用于常規(guī)檢測傳染病。EasyScreen ™產(chǎn)品為醫(yī)院和病理實驗室提供了分子工具,,可在快速高通量的環(huán)境中篩查各種傳染性病原體,。
樣品制備工作流程:
所述 EasyScreen ™樣品處理試劑盒提供直接從主檢體的核酸流線型制備。
該試劑盒可分離 DNA和RNA,,并與所有EasyScreen ™病原體檢測試劑盒兼容 ,。
自動化NA提取平臺兼容性 |
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遺傳簽名GS1 |
生物梅里埃NucliSENS easyMAG |
Qiagen QIAsymphony,EZ1 |
羅氏MagNA Pure 96 |
Thermo KingFisher Flex |
一旦使用EasyScreen™樣品處理試劑盒 準備好 樣品后,,可按照 下面的實時PCR工作流程設置任何(或全部)適用的EasyScreen™ 病原體檢測分析,。
例如,通過將拭子浸入樣品并接種EasyScreen TM試劑并如上所述進行操作來制備糞便樣品,。通過自動核酸提取的提取過程產(chǎn)生足夠的洗脫液以執(zhí)行所有的細菌,,病毒和原生動物PCR。
實時PCR工作流程:
實時PCR平臺兼容性 |
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Bio-rad CFX(96和384孔格式) |
羅氏LC480(96和384孔格式) |
Qiagen RotorGene |
Applied Biosystems 7900HT /?? 7500 |
Applied Biosystems QuantStudio™5 |
Stratagene / Agilent Mx |
產(chǎn)品 | EasyScreen™套件 | 檢測到微生物 |
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EB001和EB001-HT | 腸道細菌檢測 | (i)沙門氏菌屬 (ii)彎曲桿菌屬(Campylobacter spp,。) (iii)志賀菌屬,。/腸侵襲性大腸桿菌(EIEC) (iv)小腸結腸炎耶爾森菌。 (v)產(chǎn)毒的艱難梭菌和 (vi)單核細胞增生李斯特菌 |
EP001和EP001-HT | 腸道原生動物檢測 | (i)隱孢子蟲屬(Cryptosporidium spp,。) (ii)腸道賈第蟲 (iii)脆弱東部阿米巴 (iv)溶組織內(nèi)阿米巴和 (v)人芽囊原蟲(Blastocystis hominis) |
EV002和EV002-HT | 腸道病毒檢測 | (i)諾如病毒GI (ii)諾如病毒GII (iii)星狀病毒 (iv)輪狀病毒A (v )沙波病毒 (vi)腸病毒 (vii)博卡 病毒(viii)腺病毒和 (ix)腺病毒(僅40 + 41) |
CDD001 | 艱難梭菌檢測 | 毒素艱難梭菌(目標都TCDA和毒素tcdB) |
CDD002 | 艱難梭菌反射 | 超致病性艱難梭菌包括 (i)位置117處的tcdC基因缺失,,(ii)二元毒素基因(cdtA)和(iii)gyrA基因突變(氟喹諾酮耐藥性)的核糖體027和078 , |
英文信息如下:
Product | EasyScreen™ Kit | Microorganisms Detected |
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EB001 & EB001-HT | Enteric Bacteria Detection | (i) Salmonella spp. (ii) Campylobacter spp. (iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC) (iv) Yersinia enterocolitica. (v) toxigenic C. difficile and (vi) Listeria monocytogenes |
EP001 & EP001-HT | Enteric Protozoan Detection | (i) Cryptosporidium spp. (ii) Giardia intestinalis (iii) Dientamoeba fragilis (iv) Entamoeba histolytica and (v) Blastocystis hominis |
EV002 & EV002-HT | Enteric Viral Detection | (i) Norovirus GI (ii) Norovirus GII (iii) Astrovirus (iv) Rotavirus A (v) Sapovirus (vi) Enterovirus (vii) Bocavirus (viii) Adenovirus and (ix) Adenovirus (40 + 41 only) |
CDD001 | C. difficile Detection | Toxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB) |
CDD002 | C. difficile Reflex | Hypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance) |
對于HT(384孔格式)試劑盒,,所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs
所有 EasyScreen™ 病原體檢測試劑盒都可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒準備的 樣品,。
有關EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實時PCR平臺的兼容性的更多信息, 請訪問我們的 EasyScreen™ 工作流程頁面,。
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