1,, SNP序列查詢
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/
2,, 搜索目的SNP位點:(rs114234235為例)
3,,搜索結(jié)果
4,, 點擊查看明細
5,, SNP明細信息:
6,, 獲取SNP上下游序列:
>gnl|dbSNP|rs114234235|allelePos=201|totalLen=401|taxid=9606|snpclass=1|alleles='A/C'|mol=Genomic|build=151
GGGAGGGGGT CTCAGGGGAG GAAGGGCAGC TCTAATTGGT TTCTCAATGA AAGATAATCA
CCTACTCCCC AGAGAGGCTG GAGATTAGCA CTCTGCCTCT CCTCTCCATC GCTTTTAGAC
TTCTCATCCT CCCCTCGGTG CTTTTAGTCC ATTCAGCAGA AGCGGATCGA AGCAGGAGGC
TCCCCGCGCC GCATTAGGGG
M
GCACTCCGCC GCGCTCGAGT ACTTAGCGCC CATTCACTCG CTCACCCGCG CTCTCCGCTG
CCGGCTGCCG TCCCAGCCGC CGCCGCCGCC GCCGCCGCCG CCGCCGCCCG AGAAAAAGTT
TCGCGGAGGG GCTCAGTGAA AAAATGAGCG AGCTAGAGGA AGACTTTGCC AAGATTCTCA
TGCTCAAGGA GGAGAGGATC
7, 在SNP對應基因中進行比對
rs114234235位于PRKG1基因的啟動子區(qū)域;
http://www.umibio,。,。cn/Luciferase
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