不同分光光度計(jì)間細(xì)菌光密度測(cè)定的差異分析
背景
細(xì)菌培養(yǎng)基的光密度(OD)測(cè)定是微生物學(xué)中使用的一種常見(jiàn)技術(shù),。研究人員主要依靠分光光度計(jì)來(lái)進(jìn)行這些測(cè)定,,然而實(shí)際上這個(gè)測(cè)定是基于培養(yǎng)基的光散射量而不是光吸收量,。在其標(biāo)準(zhǔn)配置中,,分光光度計(jì)并未對(duì)光散射測(cè)定進(jìn)行優(yōu)化,,這通常會(huì)導(dǎo)致儀器間所測(cè)得吸光度上的差異,。
方法
該研究調(diào)查了不同的分光光度計(jì)光學(xué)配置對(duì)在分批培養(yǎng)基中生長(zhǎng)的大腸桿菌JM109光密度測(cè)定的影響,。分光光度計(jì)檢測(cè)包括了使用陣列檢測(cè)的反向光學(xué)系統(tǒng),、基于單色器的傳統(tǒng)系統(tǒng)以及一種配備積分球配件(ISA)的單色器系統(tǒng),。在每個(gè)儀器上測(cè)定OD600生長(zhǎng)曲線,同時(shí),,對(duì)McFarland進(jìn)行CFU/mL計(jì)數(shù)來(lái)進(jìn)一步對(duì)每個(gè)光學(xué)系統(tǒng)進(jìn)行鑒定,。
結(jié)果
來(lái)自相同光學(xué)配置類別的分光光度計(jì)其OD數(shù)據(jù)是相當(dāng)的。用反向光學(xué)系統(tǒng)測(cè)定較高OD時(shí)數(shù)據(jù)變化更大,,這是由較低雜散光所導(dǎo)致,。基于單色器的系統(tǒng)測(cè)試較高OD時(shí)準(zhǔn)確度較高,,主要是因?yàn)榕c來(lái)自反向光學(xué)系統(tǒng)的多色光相比,,單色光具有更好的雜散光去除能力,。然而,反向光學(xué)系統(tǒng)測(cè)定OD時(shí)卻有具有良好的動(dòng)態(tài)范圍,。使用ISA產(chǎn)生出的數(shù)據(jù)與用其它系統(tǒng)產(chǎn)生出的數(shù)據(jù)不同,,這是因?yàn)槠渚哂胁蹲綆缀跛星跋蛏⑸涔獾哪芰Α6鴮?duì)McFarland標(biāo)準(zhǔn)品的測(cè)定確認(rèn)了這些現(xiàn)象,。
結(jié)論
分光光度計(jì)進(jìn)行可靠的光散射測(cè)定的能力在很大程度上取決于其光學(xué)配置,;因此,具有不同光學(xué)配置的分光光度計(jì)會(huì)呈現(xiàn)出不同的OD測(cè)定值,。理想狀態(tài)下,,高度散射樣品(如細(xì)胞培養(yǎng)基)的吸光度是使用ISA進(jìn)行測(cè)定的,目的是為了捕捉幾乎所有的散射光,。培養(yǎng)基生長(zhǎng)可使用OD600測(cè)定,,然而每當(dāng)改變分光光度計(jì)時(shí),就應(yīng)該計(jì)算和應(yīng)用一個(gè)換算因數(shù),。
引言
培養(yǎng)基中細(xì)菌生長(zhǎng)(遲緩期,、對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期、穩(wěn)定生長(zhǎng)期和衰亡期)各個(gè)階段都能記錄下來(lái),,其中對(duì)數(shù)期被認(rèn)為是細(xì)菌分裂zui快的階段(1),。使用分光光度計(jì)測(cè)定細(xì)菌培養(yǎng)基在600nm(OD600)時(shí)的光密度,從而監(jiān)控細(xì)菌生長(zhǎng)一直是微生物學(xué)中的一種核心技術(shù),。使用細(xì)菌OD600的三種更為常見(jiàn)的應(yīng)用如下:(a)在細(xì)菌表達(dá)蛋白質(zhì)時(shí),,找到誘導(dǎo)蛋白的*時(shí)間,(b)用于zui小抑菌濃度(MIC)實(shí)驗(yàn)的接種體濃度的確定和標(biāo)準(zhǔn)化,,和(c)收獲和制備感受態(tài)細(xì)胞的zui佳時(shí)間的確定,。研究人員繼續(xù)依靠分光光度計(jì)進(jìn)行這些OD測(cè)定。然而,,光密度不是一個(gè)吸光度指標(biāo),,而是細(xì)菌混懸液的一種光散射指標(biāo),將其自身作為吸光度顯示(圖1),。分光光度計(jì)光學(xué)配置對(duì)光密度測(cè)定的影響得到了很好的記錄(2-4),。具有不同光學(xué)配置的儀器對(duì)同一細(xì)菌混懸液測(cè)定得到了不同的光密度。分光光度計(jì)光學(xué)配置上的差異對(duì)觀察到的差異影響zui大,。前向光學(xué)系統(tǒng)采用單色光來(lái)進(jìn)行吸光度的測(cè)定,,而反向光學(xué)系統(tǒng)則利用多色輻射進(jìn)行測(cè)定,光在其穿過(guò)樣品后再區(qū)分成單獨(dú)波長(zhǎng)(圖2),。前向光學(xué)系統(tǒng)的一些要素導(dǎo)致了測(cè)得OD值上的差異:(a)樣品與檢測(cè)器之間的距離,,(b)聚光透鏡的尺寸和焦距大小不同,,和(c)檢測(cè)器的面積和靈敏度(5),。盡管現(xiàn)在都知道不同的光學(xué)配置會(huì)產(chǎn)生不同的OD值,但是研究人員仍繼續(xù)關(guān)注在不同分光光度計(jì)間發(fā)現(xiàn)的OD值差異。在本研究中,,我們分析了多種光學(xué)配置分光光度計(jì)測(cè)出的OD值差異,。我們?cè)诜峙囵B(yǎng)基中培養(yǎng)大腸桿菌JM109,并監(jiān)控OD達(dá)9.5小時(shí),。在測(cè)定之前稀釋培養(yǎng)基,,并將由于不同分光光度計(jì)光學(xué)元件差異造成的不同OD值進(jìn)行換算。
儀器 | 光學(xué)系統(tǒng) | 光學(xué)幾何學(xué) | 光源 | 檢測(cè)器 |
Evolution Array | 反向光學(xué) |
| 氘和鎢燈 | 光電二極管陣列 |
NanoDrop 2000c | 反向光學(xué) |
| 氙燈 | CMOS陣列 |
SPECTRONIC 200 | 反向光學(xué) |
| 鎢燈 | CCD陣列 |
Evolution 260 Bio | 前向光學(xué) | 前向光學(xué) | 氙燈 | 硅光電二極管 |
Evolution 300 | 前向光學(xué) | 前向光學(xué) | 氙燈 | 硅光電二極管 |
BioMate 3S | 前向光學(xué) | 雙光束 | 氙燈 | 硅光電二極管 |
結(jié)果
從未稀釋和稀釋的培養(yǎng)基中收集的OD600數(shù)據(jù)如圖3所示,。將來(lái)自稀釋溶液的OD600值乘以稀釋因數(shù),,并與未稀釋的樣品進(jìn)行對(duì)比。兩張圖的分歧表明,,不同的光學(xué)配置在光密度測(cè)定方面會(huì)有不同的動(dòng)態(tài)范圍,。當(dāng)對(duì)比每個(gè)分光光度計(jì)的校正OD值與細(xì)胞計(jì)數(shù)時(shí),我們發(fā)現(xiàn),,隨著時(shí)間的推移,,具有相似光學(xué)系統(tǒng)的儀器產(chǎn)生了相似的OD曲線(圖4)。具有前向光學(xué)系統(tǒng),,但卻是雙光束光學(xué)幾何結(jié)構(gòu)的BioMate 3S,,與儀器組的差異zui大。McFarland數(shù)據(jù)呈現(xiàn)出一種與大腸桿菌生長(zhǎng)相似的曲線(圖5),。ISA使用McFarland標(biāo)準(zhǔn)品產(chǎn)生了更低的光密度(圖6),。
圖1結(jié)論
·計(jì)算OD測(cè)定值時(shí),確定您所用分光光度計(jì)的光密度性能和動(dòng)態(tài)范圍是至關(guān)重要的,。為獲得有關(guān)生長(zhǎng)曲線的zui準(zhǔn)確信息,,稀釋細(xì)胞混懸液是很重要的。
·OD測(cè)定在很大程度上取決于光學(xué)系統(tǒng)和幾何學(xué),。對(duì)于相同的混懸液,,具有不同光學(xué)系統(tǒng)和配置的分光光度計(jì)會(huì)讀出不同的OD值。例如,,在反向光學(xué)系統(tǒng)Evolution Array和前向光學(xué)系統(tǒng),,雙光束BioMate 3S之間有實(shí)質(zhì)性的分歧。
·積分球配件(ISA)可捕捉幾乎所有的前向散射光,,從而產(chǎn)生了更低的光密度,。這是因?yàn)橥ǔ?雌饋?lái)被
樣品吸收的散射光實(shí)際上是被ISA配件所收集,。ISA對(duì)測(cè)定高度散射溶液中分析成分的吸光度是理想之選,;然而,在測(cè)定細(xì)胞混懸液的光密度時(shí),,其是無(wú)效的,。
·zui后,,我們提出了如何計(jì)算一個(gè)可用于使OD數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化,以便能在不同分光光度計(jì)間進(jìn)行適當(dāng)比較的換算因數(shù),。值得注意的是,,這個(gè)換算因數(shù)是針對(duì)一種特定的有機(jī)體,因?yàn)槲⒘5某叽绾托螤顣?huì)影響換算因數(shù),。
分光光度法中的光散射
致,。
B 在一個(gè)散射樣品中(如一種細(xì)菌混懸液),到達(dá)檢測(cè)器的光會(huì)因光散射而進(jìn)一步減少,。到達(dá)檢測(cè)
器光的減少造成了樣品吸光度增
長(zhǎng)的錯(cuò)覺(jué),。
圖2前向和反向光學(xué)系統(tǒng)之間的差
異
在前向光學(xué)系統(tǒng)中
相關(guān)產(chǎn)品
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