每當拿到一個質粒圖譜,是不是一下就有點懵了,?這些ori、RBS,、tet是什么?這些箭頭代表什么,,轉錄的方向嗎,?不要著急,,申知心生物把這些告訴你,,也許會解決你的困惑。
質粒和載體傻傻分不清楚
質粒(Plasmid)是附加到細胞中的非細胞的染色體或核區(qū)DNA原有的能夠自主復制的較小的DNA分子(即細胞附殖粒,、又胞附殖粒),。大部分的質粒雖然都是環(huán)狀構型。
載體即要把一個有用的基因(目的基因——研究或應用基因)通過基因工程手段送到生物細胞(受體細胞),,需要運載工具(交通工具)攜帶外源基因進入受體細胞,,這種運載工具就叫做載體(vector)。細菌或病毒質粒是重組DNA技術中常用的載體,。
簡而言之,,質粒可以說是一個統(tǒng)稱,,載體是質粒改造過用來運載的工具
選用質粒做載體的要求
以常用的為例
(1)選分子量小的質粒,,即小載體(1-1.5kb)→不易損壞,在細菌里面拷貝數(shù)也多(也有大載體),;
(2)一般使用松弛型質粒在細菌里擴增不受約束,,一般 10 個以上的拷貝,而嚴謹型質粒<10 個,。
(3)必需具備一個以上的酶切位點,,有選擇的余地;
(4)必需有易檢測的標記,,多是抗生素的抗性基因,,不特指多位 Ampr。
無論選用哪種載體,,先都要獲得載體分子,,然后采用適當?shù)南拗泼笇⑤d體 DNA 進行切割,獲得分子,,以便于與目的基因片段進行連接,。
如何一眼看穿質粒圖譜
① 復制起始位點Ori,了解質粒的類型(原核/真核/穿梭質粒),,Ori的箭頭指復制方向,,其他元件標注的箭頭多指轉錄方向(正向),。
② 再看篩選標記,如抗性,,決定使用什么篩選標記:
Ampr:水解β-內酰胺環(huán),,解除氨芐的毒性。
tetr :可以阻止四環(huán)素進入細胞,。
camr:生成氯霉素羥乙?;苌铮怪ザ拘?。
neor(kanr):氨基糖苷磷酸轉移酶,,使G418(卡那霉素衍生物)失活。
hygr:使潮霉素β失活,。
③ 看多克隆位點(MCS):它具有多個限制內切酶的單一切點(質粒上只能有該內切酶的*酶切序列,,不然就一刀好幾段了),便于咱們要研究的基因的插入,。如果在這些位點外有外源基因的插入,,會導致某種標志基因的失活,而便于篩選,,常見的是β-半乳糖苷酶的藍白斑篩選系統(tǒng),。
④再看外源DNA插入片段大小:質粒一般只能容納小于10Kb的外源DNA的片段,。一般來說,,外源DNA的片段越長,越難插入,,越不穩(wěn)定,,轉化效率越低。
⑤ 是否含有表達系統(tǒng)元件,,即啟動子(promoter)-核糖體結合位點(RBS)-轉錄終止信號(AATAAA同時是poly A),。這是用來區(qū)別克隆載體與表達載體??寺≥d體中加入一些與表達調控有關的元件即成為表達載體,。選用那種載體,還是要以實驗目的為準繩,。
⑥看報告基因:主要是為了能迅速檢查功能基因是否表達的陽性判斷,,表達成功的蛋白在小鼠體內分布位置。
⑦看質粒圖譜上的箭頭:它代表DNA兩條鏈(正義鏈和反義鏈),,即質粒是環(huán)狀雙鏈DNA,,它的啟動子等在其中一條鏈上,而它的抗性基因在另一條鏈上,。
目的基因片段進行連接,。
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