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不會N-糖蛋白質組學,?搞懂這三篇文獻,,帶你輕松入門

時間:2024/12/6閱讀:702
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簡介:

N-糖蛋白質組學是蛋白質組學的一個分支,主要研究蛋白質的N-糖基化修飾,。N-糖基化是蛋白質zui普遍,、復雜及重要的一種翻譯后修飾之一,位點特異的完整糖肽分析不僅能反映出特定糖型變化,,并且可以指向特定的肽段及蛋白,。


接下來讓我們從三篇文章看阿爾茨海默病糖蛋白質組學研究現狀

第一篇

  Zhang Q, Ma C, Chin L, et al. Integrative glycoproteomics reveals protein N-glycosylation aberrations and glycoproteomic network alterations in Alzheimer's disease[J]. Sci Adv, 2020,6(40).

關鍵論點:

      1.本研究是shou次對人類AD和對照大腦進行大規(guī)模、位點特異性的N-糖蛋白組分析,,采用質譜定量技術,。

      2.研究識別了AD中N-糖肽、N-糖蛋白及N-糖基化位點占用率的疾病特征,。

      3.N-糖基組驅動的網絡分析揭示了與AD表型相關的多個共調控模塊,。

  研究方法:

本研究采用了質譜基礎的定量N-糖基組學方法,對人類AD和對照大腦進行了系統(tǒng)分析:

  1.樣本采集:收集人類AD患者和健康對照者的腦組織樣本,,進行N-糖基組的全面分析,。

  2.質譜分析:利用高分辨率質譜技術,進行N-糖基化位點的定量和特征識別。

  3.網絡分析:通過對共調控N-糖肽/糖蛋白的網絡分析,,識別出13個模塊,,其中6個與AD表型相關。

  4.數據分析:運用生物信息學工具分析N-糖基化影響的生物過程和通路,,揭示AD中N-糖基化的異常,。


第二篇

    Hawkinson T R, Clarke H A, Young L E A, et al. In situ spatial glycomic imaging of mouse and human Alzheimer's disease brains[J]. Alzheimers Dement, 2022,18(10):1721-1735.

關鍵論點:

      1.N-連接糖的異質性與AD相關,可能揭示AD病理機制的基礎,。

      2.通過優(yōu)化的酶輔助,、基質輔助激光解吸電離(MALDI)質譜成像技術,能夠有效地分析和映射大腦中的N-連接糖,。

研究方法:

本文提出了一種優(yōu)化的工作流程,,用于大腦N-連接糖的空間成像,具體方法如下:

  1.方法設計:采用酶輔助的MALDI質譜成像技術,,能夠高效地分析大腦樣本中的N-連接糖分布,。此方法的優(yōu)化在于提高了成像的分辨率和靈敏度。

  2.樣本處理:樣本包括小鼠和人類AD大腦及其年齡匹配的對照組,,通過特定的酶處理以釋放N-連接糖,,隨后進行質譜成像分析。

  3.數據分析:對獲取的質譜數據進行定量分析,,以識別與AD相關的區(qū)域特異性N-連接糖變化,。這些變化可能反映出糖基化在AD進展中的潛在作用。


第三篇

    Zhang Q, Ma C, Chin L, et al. Human brain glycoform coregulation network and glycan modification alterations in Alzheimer's disease[J]. Sci Adv, 2024,10(14):eadk6911. 

關鍵論點:

      1.通過完整的糖肽定量糖蛋白組學和系統(tǒng)生物學方法,,研究識別了超過10,000種人腦N-糖型及其在阿爾茨海默病中的變化,。

      2.發(fā)現了糖基化的疾病特征,包括在AD中減少的唾液酸化,、N-糖的分支和延長,,以及增加的甘露糖化和N-糖的截短。

      3.通過網絡分析,,揭示了腦糖蛋白組的高階組織結構及其與AD臨床表型,、淀粉樣β積累和tau病理的關聯(lián)。

研究方法

本文采用了一種完整的糖肽定量糖蛋白組學方法,,并結合系統(tǒng)生物學進行數據分析:

  1.方法設計:通過分析人腦樣本中的糖肽,,識別和定量不同的N-糖型,構建糖基化網絡,。此方法允許對糖基化變化進行全面的定量分析,,提供了疾病相關的生物標志物。

  2.數據分析:使用網絡分析方法對識別的糖型進行高階組織結構分析,,揭示了不同糖基化模式之間的相互作用和調控關系,。

  3.創(chuàng)新點:結合系統(tǒng)生物學的網絡分析方法,,shou次揭示了腦糖蛋白組中糖型和糖基的模塊化結構,,提供了與AD相關的臨床表型的深入理解,。

 

    這三篇文章從不同角度解析了與AD發(fā)生相關的蛋白質N-糖基化修飾。對于疾病糖蛋白質組學的研究來說,,臨床樣本的選擇是最為關鍵的:目前更多研究AD的文章主要采用腦脊液或者血液作為研究目標,,這樣的研究發(fā)現的糖蛋白質一般為診斷標志物,限制了對于疾病發(fā)生發(fā)展機制的深入研究,。對于糖蛋白質組學技術來說,,以完整糖肽為核心的糖蛋白質組學策略可以從蛋白質、糖基化位點和糖鏈三位一體的分析糖蛋白質,;針對于以N-糖鏈為核心的糖蛋白質組學技術,,質譜成像技術可以繪制N-糖鏈分子的組織空間分布圖像,這使得這一技術備受關注,。



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