質(zhì)譜儀以離子源,、質(zhì)量分析器和離子檢測(cè)器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置,。電離后的分子因接受了過(guò)多的能量會(huì)進(jìn)一步碎裂成較小質(zhì)量的多種碎片離子和中性粒子,。它們?cè)诩铀匐妶?chǎng)作用下獲取具有相同能量的平均動(dòng)能而進(jìn)入質(zhì)量分析器。
質(zhì)譜分析手段在過(guò)去的十年中飛速發(fā)展,，目前這種分析手段的應(yīng)用幾乎遍及每個(gè)角落,。尤其是在生命科學(xué)領(lǐng)域中，質(zhì)譜分析已經(jīng)成為蛋白質(zhì)以及小分子應(yīng)用中*的一種分析手段,。
從技術(shù)的角度來(lái)說(shuō),，大部分的質(zhì)譜儀都無(wú)法獲得所需要的所有信息，因此必須同時(shí)應(yīng)用兩種或更多的檢測(cè)手段來(lái)達(dá)到*大的靈敏度和生產(chǎn)能力,。
對(duì)于某些應(yīng)用來(lái)說(shuō),，由于產(chǎn)物離子的靈敏性通常情況下不是很強(qiáng)，因此想要通過(guò)三倍的四極矩設(shè)備來(lái)獲得高質(zhì)量的譜圖是非常困難的,。這種靈敏性上的欠缺可以通過(guò)QqTOF技術(shù)來(lái)克服,，這種技術(shù)能夠提供附加的質(zhì)譜信息，但是真實(shí)的前體和中性損失掃描實(shí)驗(yàn)以及可信賴的定量分析就很難實(shí)現(xiàn)了,。盡管離子阱質(zhì)譜儀（MS）可以實(shí)現(xiàn)多次敏感的質(zhì)譜（MSn）實(shí)驗(yàn),，從而弄清楚反應(yīng)機(jī)理，簡(jiǎn)化光譜的干擾。
但是前面的問(wèn)題對(duì)于三維離子阱技術(shù)來(lái)說(shuō)同樣無(wú)法避免,。盡管如此,，三維離子阱很容易發(fā)生過(guò)載現(xiàn)象（空間充電效應(yīng)），這種現(xiàn)象可能導(dǎo)致質(zhì)量漂移,，分解損失以及光譜和校準(zhǔn)曲線的非線性,。因此，三維離子阱不適用于較大量的分析,。所有這些在**代混合線性離子阱/三倍四極質(zhì)譜儀開發(fā)出以后都得到了改變,，來(lái)自Applied Biosystems 和MDS SCIEX公司的Q TRAP LC/MS/MS系統(tǒng)，是在API 2000 LC/MS/MS平臺(tái)的基礎(chǔ)上開發(fā)出來(lái)的,，產(chǎn)品已經(jīng)投放市場(chǎng),，馬上受到蛋白質(zhì)以及藥物開發(fā)質(zhì)譜儀領(lǐng)域的廣泛歡迎。
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