毛細管柱明顯好于填充柱,，口徑越細,，效果越明顯。由于毛細管柱內徑極小,，有效地解決了柱內擴散效應,，使得鋒形尖銳，分離度好,。

毛細管柱柱效高,，分離性能好，可一次分離的組分多,，柱容量小,，通常情況要分流進樣。

毛細管色譜柱是填充色譜柱的升級產品,，目前安捷倫公司已經停止填充色譜柱的生產,。毛細管色譜柱在各方面的性能都比填充柱高出許多，但目前毛細管色譜柱也不能*取代填充色譜柱,，填充色譜柱也有它的優(yōu)勢,。