玉米育種的主流是優(yōu)勢(shì)育種,，基本途徑是先選育純合的親本自交系,，再將親本自交系雜交,，選育出優(yōu)勢(shì)強(qiáng)的雜交種,。生產(chǎn)上利用的是F1代的優(yōu)勢(shì),。自交系的選育不但要求本身性狀優(yōu)良,，還要求配合力高,。這就大大提高了育種的難度，延長了育種的周期,。不僅如此,，自交系的性狀同雜交種的性狀雖然有關(guān)系，但仍然有距離,，在雜交種水平上還要對(duì)農(nóng)藝性狀進(jìn)行選擇鑒定,，同時(shí)對(duì)主要目標(biāo)性狀的優(yōu)勢(shì)水平進(jìn)行比較，然后育成優(yōu)良雜交品種,。
玉米育種的自交系的選育方法:
1.常規(guī)選育法
　　這種選育方法就是在分離的原始群體中選擇個(gè)體自交系,，經(jīng)若干世代按目測自交選擇之后，進(jìn)行配合力的測定,，然后選出優(yōu)良的自交系,。在育種規(guī)模不大的情況下，常規(guī)選育法,，更多地依靠育種者的經(jīng)驗(yàn),。
2.單倍體選系法
　　其基本原理是利用自然或人工的誘發(fā)、培育的單倍體植株經(jīng)過人工的染色體加倍或自然加倍獲得純合的二倍體,，然后再從中選育優(yōu)良的單株,，成為自交系。單倍體育種一般只需2年就能獲得純合的自交系,，比常規(guī)方法縮短了育種的周期,，對(duì)育種家有很大的吸引力。
3.輻射與化學(xué)誘變選系法
　　此種方法的誘變機(jī)理主要以損傷恢復(fù),，在恢復(fù)過程中發(fā)現(xiàn)有利的變異,，因而在選擇原始材料上要兼顧遺傳基礎(chǔ)豐富和抗損傷能力強(qiáng)，在選系過程中要注意淘汰各種畸形株和不利變異,，選擇突變性狀明顯的健康的植株,。
4.分子選系法
　　所謂分子選系法是在DNA水平上開展的自交系選育，包括轉(zhuǎn)基因選系法和分子標(biāo)記輔助選系法,。轉(zhuǎn)基因選系就是借助遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù),，將一些其他動(dòng)植物有利的外源基因?qū)俗越幌祷螂s交種內(nèi)，育成有外源基因控制性狀的優(yōu)良自交系,，這種方法對(duì)于改造玉米基因庫中不具備的某些目標(biāo)性狀是致關(guān)重要的,。
5.自交系的改良
　　改良自交系常用的方法是回交轉(zhuǎn)育法,?；亟晦D(zhuǎn)育法就是以被改良的自交系為輪回親本，以目的基因供體親本為非輪回親本,，經(jīng)過5代以上的回交改良和1~2代的自交穩(wěn)定后,，就可以育成新的改良自交系,。回交效果的好壞同目標(biāo)性狀的遺傳方式有關(guān),，一般回交法對(duì)簡單性狀或單基因控制的性狀以及細(xì)胞質(zhì)遺傳性狀較有效,，對(duì)復(fù)雜性狀效果差。