動(dòng)物組織DNA的制備
一,、實(shí)驗(yàn)原理
提取核酸的基本程序包括細(xì)胞破碎-解聚核蛋白并去除蛋白質(zhì)-沉淀核酸并去除其它雜質(zhì)三步,。破碎細(xì)胞的方法很多,高等動(dòng)植物材料常用液氮研磨法,。
核蛋白利用DNA核蛋白在0.14mol/L Nacl鹽溶液的溶解度很低的特點(diǎn)而實(shí)驗(yàn)其與RNA核蛋白分離,,殘存的RNA經(jīng) R Nase水解而去除。
蛋白質(zhì)經(jīng)蛋白酶水解,,并經(jīng)苯酚,、Trichloromethane變性而分開(kāi),。提純過(guò)程中的DNA酶活性經(jīng)低溫操作并用SDS解聚或檸檬酸三鈉和EDTA.Na2等螯合劑抑制。逐漸純化的DNA經(jīng)乙醇或異丙醇沉淀而收集,,終實(shí)現(xiàn)DNA分離純化之目的,。
二、實(shí)驗(yàn)用品
(一)器材
(1)離心機(jī),。
(2)水浴鍋,。
(3)紫外分光光度計(jì)。
(4)研缽,、液氮,、帶蓋離心管。
(二)試劑
(1)蛋白酶K:用水或TEN9溶液溶解成10mg/ml,,或直接用粉末,。
(2)TEN9 pH9.0:稱取Tris6.05g EDTA.Na237.224g和NaCL 11.688g按順序溶于蒸餾水中,以HCL調(diào)PH9.0,。
(3)TE溶液:50mmol/L Tris.HCL(PH8.0)-10mmol/L EDTA.Na2(PH8.0),。
(4)SS-phenol:以Tris平衡重蒸酚至PH8.0,加入0.1%的8-羥基喹啉(使溶液呈黃色,,防止酚的氧化),。
(5)1mmol/L Tris.HCL(PH8.0):Tris121.14g溶解于蒸餾水中,以HCL調(diào)PH至8.0定容至1L,。
(6)20% SDS:20g SDS溶于100ml蒸餾水中,,配制時(shí)要小心,SDS對(duì)呼吸道有強(qiáng)烈的刺激,,且毒性較大,。
(7)RNase A 若試劑含有痕量DNase,用*℃ 10min滅活DNase,。
(8)3mol/L NaAc,pH6.5:稱取NaAc.3H2O408.1g溶于蒸餾水中,,HAc調(diào)PH至6.5后定容至1L。
TEN9,、 Tris.HCL,、NaAc均需高壓滅菌。
(三)材料
新鮮兔肝或雞肝,。
二,、實(shí)驗(yàn)程序
(一)操作方法
1.操作步聚
(1)在液氮存在的條件下,于研中將5g動(dòng)物組織碾成細(xì)粉(約需20~30min),。
(2)待液氮揮發(fā)后,,將細(xì)粉轉(zhuǎn)至50ml帶蓋的離心管中,加入20mlTEN9和RNase(100µg/ml),混合均勻,,加入1ml 20%SDS,,將離心管上下顛倒幾次,,并繼續(xù)輕揺10min。
(3)加入10mg蛋白酶K粉末,,慢速攪拌使之溶解并混勻,。
(4)在37℃至55 ℃保溫2~4小時(shí),其間不時(shí)地輕搖,。
(5)如需要,,再加入10mg蛋白酶K粉末,繼續(xù)保溫至少2h,,使組織充分消解,。
(6)加入20ml SS-phenol,溫和顛倒離心管,使兩相充分混合,,形成類似乳濁液狀,。
(7)室溫,10000r/min離心10min,,使混合液清晰分相(如分層不明顯,,可適當(dāng)加大離心力及離心時(shí)間)。上層水相含DNA,,中間為變性蛋白質(zhì),,下層為酚相。
(8)用大口吸管將上層水相轉(zhuǎn)至另一只離心管中,,棄去界面相和酚相,。
(9)將第6~8步重復(fù)進(jìn)行幾次,直至中間相*消失(蛋白質(zhì)必須去除干凈,,否則對(duì)DNA的溶解及酚切都不利),。
(10)離心后,將水相轉(zhuǎn)到透析袋中以去除小分子物質(zhì),。在TE中透析(稀釋因數(shù)應(yīng)大于1000,,稀釋因數(shù)指外界溶解與待透析液體積比的累積乘積),,并用磁力攪拌器攪拌,,提高透析效率,2h后轉(zhuǎn)至4℃繼續(xù)透析4h或過(guò)液(開(kāi)始時(shí),,溶液中含大量的SDS,,低溫下易析出,因此開(kāi)始時(shí)必須先在溫室透析,,由于透析袋較昂貴,,用后可用TE浸泡,煮沸10min,可續(xù)用),,可靜止透析,。
(11)將透析后的溶液轉(zhuǎn)至50ml離心管中,,加入NaAc溶液,使其終濃度為0.3mol/L,再加入0.8體積的異丙醇,,溫和混勻(亦可用2倍體積的乙醇代替異丙醇,,但可能使沉淀體積過(guò)大)。
(12)用玻璃棒繞起或鉤出呈現(xiàn)纖維狀的DNA,,由于異丙醇不易干燥,,可用70%的乙醇快速?zèng)_洗干燥后,在2~5ml TE中*溶解,,并置冰箱保存,。
(13)測(cè)定此DNA溶液在260nm和280nm波長(zhǎng)下的OD值,此值應(yīng)大于1.7.如果小于1.7,,則說(shuō)明含較多的蛋白,,需加少量蛋白酶K保溫后,用SS-酚進(jìn)一步抽提,。另外,,235nm處為鹽類及小分子化合物的吸收峰,因此應(yīng)大于1.7,。
2得率的計(jì)算
由于1OD260的DNA濃度為50µg/ml,,因此DNA得率可按下公式計(jì)算:
1g新鮮組織的DNA含量=OD260×50×溶解體積/組織鮮重(µg DNA/g)。
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