HPLC技術(shù)主要應(yīng)用是在臨床藥學(xué)和臨床生理學(xué)中,。臨床藥學(xué)主要是治療藥物監(jiān)測(TDM)和藥代動(dòng)力學(xué),。HPLC之所以在TDM中占有重要地位,。其主要原因是：
    (1)可以同時(shí)監(jiān)測不同種類的藥物,。
    (2)一次進(jìn)樣可同時(shí)分析原藥及代謝產(chǎn)物,。
    (3)分離和定量同時(shí)進(jìn)行．具有較高的準(zhǔn)確性和度,。此外HPLC還具有*的經(jīng)濟(jì)效益比，花費(fèi)遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于其它傳統(tǒng)方法,。目前用HPLC分析臨床常用藥物 超過數(shù)百種,。已廣泛用于TDM中的如抗癲癇藥，抗心律失常藥,。茶堿．撲熱息痛,，環(huán)孢霉索等。在臨床生理研究方面,，許多復(fù)雜化合物或內(nèi)源代謝物也可用 HPLC法分析,。如血中兒茶酚胺、氨基酸,、激素,、前列腺素、多肽,、核酸等,。
此外HPLC還可應(yīng)用到臨床診斷中，如在新生兒疾病篩查中,，開發(fā)了血紅蛋白病的Hb,，苯丙酮尿酸癥的PKU，成神經(jīng)細(xì)胞瘤等方法,。
    需要注意的是臨床樣品都是生物樣品,，如血、尿,、痰,、體液等，成分復(fù)雜,，性質(zhì)各異,，生物大分子多，必須進(jìn)行適當(dāng)?shù)奶幚?，去除某些干擾物,。處理時(shí)嚴(yán)格按要求去做，否則會導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗或造成柱的阻塞,，甚至報(bào)廢,。