免疫印跡(Western blot, WB)是分子生物學(xué)中檢測復(fù)雜生物提取物中特定蛋白質(zhì)存在的常用方法之一。WB必須控制上樣量以確保目標(biāo)蛋白變化具有可比性,,通常選擇在所有組織中普遍分布的具有相對恒定量的蛋白質(zhì)作為內(nèi)參(Loading control),。
為何要選用內(nèi)參
在Western Blotting中使用內(nèi)參就是在試驗中另外用內(nèi)參對應(yīng)的抗體檢測內(nèi)參蛋白。內(nèi)參就是內(nèi)部參照,,一般是指管家基因編碼表達的蛋白,,它們在各個組織和細胞中的表達相對恒定,在檢測蛋白的表達水平變化時常用它來做參照,。
如何選擇內(nèi)參抗體
1.樣本種屬來源
選擇內(nèi)參首先要考慮的就是實驗樣本來源于什么物種,。哺乳動物的組織或者細胞樣本,通常選擇β-actin、β-tubulin,、GAPDH,、Lamin B、Na+/K+-ATPase, Histone H3 等,。植物來源實驗樣本,,則可以選擇Plant actin、Rubisco等,。其他來源樣本研究較少,,所以就應(yīng)該參照文獻報導(dǎo),選擇合適的蛋白作為內(nèi)參,。
2.目的蛋白分子量
選擇內(nèi)參抗體時,,應(yīng)該考慮目的蛋白分子量的大小。通常應(yīng)該保證目的蛋白與內(nèi)參蛋白分子量相差5KD以上,。比如檢測目的蛋白分子量為45KD,,此時不適宜選擇β-actin(42KD)作為內(nèi)參,可以考慮選擇GAPDH(36KD)作為內(nèi)參,。
3.目的蛋白表達部位
就一般的蛋白檢測來說,,β-actin、β-Tubulin抗體等就可以了,,而針對于核蛋白的定量,,特別是樣本蛋白就是核蛋白時,選擇恰當(dāng)?shù)暮说鞍變?nèi)參則更能體現(xiàn)內(nèi)部參照的價值,。常用的核內(nèi)參抗體有Lamin A,、Lamin B、Histone H3,,除此之外,,其它常見的核蛋白內(nèi)參還有PCNA、K70,、K80等,,在一些文獻報道中,Erk2,、TATA binding protein(TBP)以及c-Jun,、c-Fos等都有使用。而對于膜蛋白檢測,,常用的內(nèi)參抗體為Na,K ATPase,。對于線粒體蛋白的檢測,常用VDAC1和COX IV作為內(nèi)參抗體,。內(nèi)參的選擇需要考慮實際的試驗環(huán)境,,比如某些細胞中,,由于組織缺氧、糖尿病等因素會導(dǎo)致GAPDH的表達增高,,不適合做內(nèi)參,。比如在在凋亡實驗時,Lamin等也不適合作為內(nèi)參,。因此設(shè)計實驗方案的時候應(yīng)該考慮這些因素并查詢相應(yīng)文獻,,在實驗過程中也應(yīng)該注意如果內(nèi)參表達出現(xiàn)異常,應(yīng)考慮這方面因素,。
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