KTB1016-CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細(xì)胞測序技術(shù)聯(lián)合應(yīng)用于腫瘤微環(huán)境研究
摘要:本研究創(chuàng)新性地將 CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細(xì)胞測序技術(shù)相結(jié)合,用于分析腫瘤微環(huán)境中不同細(xì)胞亞群的 ATP 含量及基因表達(dá)特征,,揭示腫瘤細(xì)胞與微環(huán)境細(xì)胞間能量代謝的相互作用機(jī)制,,為腫瘤精準(zhǔn)治療提供新的理論依據(jù)。結(jié)果表明,,聯(lián)合技術(shù)能深入解析腫瘤微環(huán)境能量代謝網(wǎng)絡(luò),,具有重要研究價(jià)值。
一,、引言
腫瘤微環(huán)境是腫瘤細(xì)胞生長,、增殖和轉(zhuǎn)移的重要基礎(chǔ),,其中細(xì)胞間的能量代謝相互作用復(fù)雜且關(guān)鍵。傳統(tǒng)研究方法難以在單細(xì)胞水平同時(shí)分析細(xì)胞能量代謝及基因表達(dá)情況,。CheKine ATP 含量檢測試劑盒可準(zhǔn)確測定細(xì)胞 ATP 含量,,單細(xì)胞測序技術(shù)能揭示細(xì)胞基因表達(dá)譜,兩者聯(lián)合有望為腫瘤微環(huán)境研究帶來新突破,。
二,、材料與方法
(一)材料
CheKine ATP 含量檢測試劑盒
腫瘤組織樣本(來自乳腺癌患者手術(shù)切除標(biāo)本)
單細(xì)胞測序相關(guān)試劑與設(shè)備(單細(xì)胞分離系統(tǒng)、測序文庫構(gòu)建試劑盒,、測序儀)
流式細(xì)胞儀(用于細(xì)胞分選)
細(xì)胞培養(yǎng)設(shè)備(用于原代細(xì)胞培養(yǎng))
(二)方法
單細(xì)胞分離:將腫瘤組織通過酶消化法制備成單細(xì)胞懸液,,利用流式細(xì)胞儀根據(jù)細(xì)胞表面標(biāo)志物分選腫瘤細(xì)胞、腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞,、成纖維細(xì)胞等不同細(xì)胞亞群,。
ATP 含量檢測:對(duì)分選后的不同細(xì)胞亞群,按照 CheKine ATP 含量檢測試劑盒說明書測定 ATP 含量,。
單細(xì)胞測序:對(duì)同一批分選后的細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞測序文庫構(gòu)建,,然后進(jìn)行高通量測序,分析細(xì)胞基因表達(dá)譜,。
數(shù)據(jù)整合與分析:將 ATP 含量數(shù)據(jù)與單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)進(jìn)行整合,,通過生物信息學(xué)方法分析不同細(xì)胞亞群能量代謝相關(guān)基因表達(dá)與 ATP 含量的關(guān)系,以及細(xì)胞間能量代謝的相互作用網(wǎng)絡(luò),。
三,、結(jié)果
(一)不同細(xì)胞亞群 ATP 含量差異
腫瘤細(xì)胞的 ATP 含量顯著高于腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞和成纖維細(xì)胞。例如,,乳腺癌細(xì)胞的 ATP 含量約為腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的 3 倍,,成纖維細(xì)胞的 4 倍。
(二)能量代謝相關(guān)基因表達(dá)與 ATP 含量關(guān)聯(lián)
單細(xì)胞測序分析發(fā)現(xiàn),,腫瘤細(xì)胞中與糖酵解,、線粒體呼吸等能量代謝途徑相關(guān)基因表達(dá)上調(diào),且這些基因表達(dá)水平與 ATP 含量呈正相關(guān),。腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞在不同極化狀態(tài)下,,能量代謝基因表達(dá)及 ATP 含量也存在差異,M2 型巨噬細(xì)胞 ATP 含量相對(duì)較高,,且與免疫調(diào)節(jié)相關(guān)的能量代謝基因表達(dá)上調(diào),。
(三)細(xì)胞間能量代謝相互作用網(wǎng)絡(luò)
通過數(shù)據(jù)整合分析,構(gòu)建了腫瘤微環(huán)境中不同細(xì)胞亞群間的能量代謝相互作用網(wǎng)絡(luò),,發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞可通過分泌代謝產(chǎn)物影響周圍細(xì)胞的能量代謝,,而腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞和成纖維細(xì)胞也能反過來調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞的能量代謝。
四、討論
本研究將 CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細(xì)胞測序技術(shù)聯(lián)合應(yīng)用于腫瘤微環(huán)境研究,,成功在單細(xì)胞水平解析了腫瘤微環(huán)境能量代謝特征及細(xì)胞間相互作用機(jī)制,。聯(lián)合技術(shù)彌補(bǔ)了單一技術(shù)的局限性,為深入研究腫瘤微環(huán)境提供了更全面的視角,。但實(shí)驗(yàn)過程復(fù)雜,,成本較高,對(duì)技術(shù)人員要求也較高,。未來可進(jìn)一步優(yōu)化實(shí)驗(yàn)流程,,降低成本,推動(dòng)該聯(lián)合技術(shù)在腫瘤研究中的廣泛應(yīng)用,。
五,、結(jié)論
CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細(xì)胞測序技術(shù)聯(lián)合應(yīng)用在腫瘤微環(huán)境研究中具有巨大潛力,有助于揭示腫瘤發(fā)生發(fā)展的新機(jī)制,,為腫瘤精準(zhǔn)治療策略制定提供理論支持,。
技術(shù)支持
亞科因(武漢)生物技術(shù)有限公司
Abbkine亞科因致力于細(xì)胞科研檢測及細(xì)胞治療領(lǐng)域關(guān)鍵生化檢測試劑盒的研發(fā)、生產(chǎn)和銷售,成為全球細(xì)胞制藥領(lǐng)域創(chuàng)新的關(guān)鍵推動(dòng)者
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