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有害的細(xì)菌和真菌不僅可能會(huì)污染原材料和生產(chǎn)設(shè)備,，更糟糕的是有可能會(huì)污染最終的成品,。我們的Applied Biosystems MicroSEQ™快速微生物鑒定系統(tǒng)(圖1)采用了高度精確的系統(tǒng)發(fā)生學(xué)方法，用于微生物的鑒定,。這種方法主要是通過(guò)對(duì)細(xì)菌的16S rRNA基因和真菌大亞基的D2基因區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,，并將測(cè)序結(jié)果與數(shù)據(jù)庫(kù)中經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的序列進(jìn)行比較而完成的。在rRNA測(cè)序完成后,，MicroSEQ系統(tǒng)自動(dòng)將測(cè)序結(jié)果與MicroSEQ微生物數(shù)據(jù)庫(kù)中經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的序列進(jìn)行比較,。該結(jié)果根據(jù)參考序列與樣本間的遺傳距離排列并以遺傳系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)的方式顯示(圖2)。這一系統(tǒng)包含廣泛驗(yàn)證的細(xì)菌和真菌數(shù)據(jù)庫(kù),。細(xì)菌序列數(shù)據(jù)庫(kù)包含有超過(guò)2000個(gè)條目,，這其中包括葡萄球菌、芽孢桿菌,、棒狀桿菌,、分枝桿菌以及非發(fā)酵型革蘭氏陰性菌等。真菌數(shù)據(jù)庫(kù)涵蓋了超過(guò)1100個(gè)條目,。這兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)經(jīng)常進(jìn)行更新和擴(kuò)充。