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賽默飛熒光定量PCR儀的工作原理
賽默飛熒光定量PCR儀(Thermo Fisher Scientific Real-Time PCR Systems)是基于聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction, PCR)技術的熒光定量檢測設備,,其核心原理是通過實時監(jiān)測熒光信號的變化來定量分析核酸擴增過程,,揭示目標DNA或RNA的起始量。以下是賽默飛熒光定量PCR儀的詳細工作原理:
1. 基本工作流程
賽默飛熒光定量PCR儀的工作流程可以分為以下幾個階段:
(1) 樣本準備
提取核酸:目標DNA或RNA從細胞,、組織或其他樣本中提取,。
反轉(zhuǎn)錄(對于RNA樣本):使用逆轉(zhuǎn)錄酶將RNA轉(zhuǎn)錄為cDNA。
(2) PCR反應設置
反應體系:PCR混合液包括模板核酸,、引物,、探針或熒光染料、dNTP,、Taq DNA聚合酶及緩沖液,。
PCR試劑:
使用特定熒光標記的探針(如TaqMan探針)或熒光染料(如SYBR Green)以實時監(jiān)測擴增反應。
(3) PCR循環(huán)
PCR反應在熱循環(huán)系統(tǒng)中分為以下三個步驟,,循環(huán)30-40次:
變性:高溫(通常為95℃)使雙鏈DNA分離為單鏈,。
退火:降低溫度(通常為55-65℃),引物與模板DNA結(jié)合,。
延伸:通過Taq DNA聚合酶在72℃合成新鏈,。
(4) 熒光信號檢測
賽默飛熒光定量PCR儀內(nèi)置的光學檢測系統(tǒng)實時監(jiān)測每個PCR循環(huán)中的熒光信號變化。
熒光強度與目標核酸的擴增量成正比,。
2. 熒光定量PCR的關鍵技術
(1) 熒光信號產(chǎn)生與檢測
賽默飛熒光定量PCR儀使用熒光探針或染料標記擴增反應的產(chǎn)物,,具體技術包括:
TaqMan探針法
探針是一段帶有熒光標記和猝滅基團的寡核苷酸。
工作原理:
在PCR延伸階段,,Taq DNA聚合酶的5'-3'外切酶活性將探針降解,,釋放熒光基團,使熒光信號得以監(jiān)測,。
熒光強度與擴增產(chǎn)物數(shù)量呈線性相關,。
SYBR Green染料法
SYBR Green是一種嵌入雙鏈DNA的熒光染料。
工作原理:
隨著PCR反應中雙鏈DNA的生成,,SYBR Green嵌入其中,,產(chǎn)生熒光信號。
熒光強度的增加反映擴增產(chǎn)物的累積量,。
高分辨率熔解曲線分析(HRM)
HRM技術通過監(jiān)測DNA解鏈時的熒光信號變化,,用于檢測單核苷酸多態(tài)性(SNP)和突變分析。
(2) 定量方法
賽默飛熒光定量PCR儀通過以下兩種方式實現(xiàn)核酸的絕對定量或相對定量分析:
絕對定量
使用標準曲線,,通過已知濃度標準品的熒光信號,,計算未知樣本中核酸的起始量。
相對定量
通過參考基因的表達量對目標基因進行標準化分析,,適合基因表達研究,。
(3) 光學檢測系統(tǒng)
賽默飛熒光定量PCR儀配備多色光學檢測系統(tǒng):
使用LED光源激發(fā)熒光。
CCD相機或光電二極管陣列捕獲熒光信號,。
系統(tǒng)實時采集熒光信號并進行數(shù)據(jù)分析。
3. 數(shù)據(jù)分析與結(jié)果輸出
賽默飛熒光定量PCR儀通過內(nèi)置的軟件平臺對熒光信號進行分析,主要步驟包括:
(1) 閾值循環(huán)數(shù)(Ct值)
Ct值是熒光信號達到設定閾值時的PCR循環(huán)數(shù),。
Ct值越低,,模板起始量越高。
(2) 標準曲線分析
通過繪制標準曲線,,計算未知樣本的絕對濃度,。
(3) 熔解曲線
熔解曲線用于驗證PCR擴增的特異性,單一峰值表明反應特異性好,,多峰值可能提示非特異擴增或引物二聚體,。
(4) 定量結(jié)果展示
數(shù)據(jù)可通過曲線圖、柱狀圖等形式直觀展示,,便于分析,。
4. 賽默飛熒光定量PCR儀的優(yōu)化設計
高靈敏光學檢測
多通道熒光檢測系統(tǒng)可同時監(jiān)測多個靶標,確保實驗靈活性和高效性,。
快速熱循環(huán)系統(tǒng)
賽默飛儀器通過精準的溫度控制系統(tǒng),,加速PCR反應,縮短實驗時間,。
智能化軟件平臺
支持自動分析Ct值,、熔解曲線,簡化數(shù)據(jù)處理流程,。
云端連接功能,,支持遠程實驗管理和數(shù)據(jù)共享。
兼容性與靈活性
支持96孔,、384孔板和TaqMan Array卡等多種平臺,。
靈活適配不同熒光染料和探針。
5. 賽默飛熒光定量PCR儀的優(yōu)勢
靈敏度高:精確檢測低豐度模板,。
多通道檢測:最多支持8色熒光檢測,,適合多重實驗。
實驗效率高:快速模式大幅縮短反應時間,。
特異性強:采用TaqMan探針,,避免非特異性擴增影響結(jié)果。
便捷操作:直觀界面設計,,支持自動化運行,。
6. 應用領域
基因表達分析
精確定量基因表達變化,用于研究基因調(diào)控機制,。
病原體檢測
快速,、準確檢測病毒和細菌,核酸檢測,。
遺傳突變分析
檢測SNP和點突變,,適合癌癥研究和遺傳性疾病篩查,。
藥物篩選
高通量基因表達分析,為新藥開發(fā)提供支持,。
分子診斷
應用于個性化醫(yī)療,,通過實時檢測提供臨床診斷依據(jù)。
總結(jié)
賽默飛熒光定量PCR儀通過先進的光學檢測系統(tǒng),、靈敏的熒光探針技術和高效的反應體系,,確保實驗數(shù)據(jù)的精確性與可靠性。其工作原理結(jié)合TaqMan探針法和SYBR Green染料法,,支持多種定量檢測需求,。同時,智能化操作和多樣化適配平臺使其廣泛應用于科研和臨床領域,,為分子生物學研究提供強有力的技術支持,。