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晉江市疾病預(yù)防控制中心是2005年4月經(jīng)晉江市人民政府批準(zhǔn)設(shè)立的公益性的事業(yè)單位,，前身為晉江市衛(wèi)生防疫站,，位于晉江市青陽街道洪宅垵社區(qū)120號。
主要承擔(dān)傳染病,、寄生蟲病和地方病,、慢性非傳染性疾病等的預(yù)防與控制；突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急處置,；疫情及健康相關(guān)因素信息管理,；職業(yè)危害因素控制、食源性疾病預(yù)防與控制及公共營養(yǎng),；實驗室檢測與評價,；健康教育與健康促進(jìn),；技術(shù)指導(dǎo)與應(yīng)用研究等,。
中心人員編制92人，設(shè)有3個職能科室和10個業(yè)務(wù)科室,，現(xiàn)有人員104人；其中在編員工84人,，大專以上學(xué)歷78人，各類專業(yè)技術(shù)人員77人,，其中職稱8人,，中級職稱25人，,。  
占地面積11483平方米,，建有衛(wèi)生檢測大樓和實驗綜合大樓各一幢，總建筑面積20041.6平方米,，其中實驗室面積7500平方米,。擁有液相色譜儀、氣質(zhì)聯(lián)用儀,、原子吸收分光光度計,、離子色譜儀,、原子熒光分光光度計,、實時熒光定量PCR儀、全自動微生物鑒定系統(tǒng),、酶標(biāo)儀,、全自動生化分析儀,、全自動血液分析儀、流式細(xì)胞儀,、全自動蛋白印跡儀,、熒光顯微鏡、P2實驗室,、100級潔凈實驗室,、PCR實驗室、培養(yǎng)箱,、干燥箱,、馬弗爐等重要儀器設(shè)備。現(xiàn)已掌握13類395項檢測技術(shù),，基本達(dá)到衛(wèi)計委,、國家發(fā)改委規(guī)定的縣級疾控機(jī)構(gòu)檢測能力要求。于1998年通過實驗室資質(zhì)認(rèn)證（計量認(rèn)證）,，2012年通過食品檢驗機(jī)構(gòu)資質(zhì)認(rèn)定,；具備HIV抗體初篩實驗室、HIV抗體確證實驗室,、國家鹽碘實驗室等資格,。