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晉江市疾病預(yù)防控制中心是2005年4月經(jīng)晉江市人民政府批準(zhǔn)設(shè)立的公益性的事業(yè)單位，前身為晉江市衛(wèi)生防疫站,，位于晉江市青陽街道洪宅垵社區(qū)120號(hào),。
主要承擔(dān)傳染病、寄生蟲病和地方病,、慢性非傳染性疾病等的預(yù)防與控制,；突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急處置,；疫情及健康相關(guān)因素信息管理,；職業(yè)危害因素控制、食源性疾病預(yù)防與控制及公共營養(yǎng),；實(shí)驗(yàn)室檢測與評(píng)價(jià),；健康教育與健康促進(jìn)；技術(shù)指導(dǎo)與應(yīng)用研究等,。
中心人員編制92人,，設(shè)有3個(gè)職能科室和10個(gè)業(yè)務(wù)科室，現(xiàn)有人員104人,；其中在編員工84人,，大專以上學(xué)歷78人，各類專業(yè)技術(shù)人員77人,，其中職稱8人,，中級(jí)職稱25人，,。  
占地面積11483平方米,，建有衛(wèi)生檢測大樓和實(shí)驗(yàn)綜合大樓各一幢，總建筑面積20041.6平方米,，其中實(shí)驗(yàn)室面積7500平方米。擁有液相色譜儀,、氣質(zhì)聯(lián)用儀,、原子吸收分光光度計(jì)、離子色譜儀,、原子熒光分光光度計(jì),、實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,、全自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)、酶標(biāo)儀,、全自動(dòng)生化分析儀,、全自動(dòng)血液分析儀、流式細(xì)胞儀,、全自動(dòng)蛋白印跡儀,、熒光顯微鏡、P2實(shí)驗(yàn)室,、100級(jí)潔凈實(shí)驗(yàn)室,、PCR實(shí)驗(yàn)室、培養(yǎng)箱,、干燥箱,、馬弗爐等重要儀器設(shè)備。現(xiàn)已掌握13類395項(xiàng)檢測技術(shù),，基本達(dá)到衛(wèi)計(jì)委,、國家發(fā)改委規(guī)定的縣級(jí)疾控機(jī)構(gòu)檢測能力要求。于1998年通過實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)認(rèn)證（計(jì)量認(rèn)證）,，2012年通過食品檢驗(yàn)機(jī)構(gòu)資質(zhì)認(rèn)定,；具備HIV抗體初篩實(shí)驗(yàn)室、HIV抗體確證實(shí)驗(yàn)室,、國家鹽碘實(shí)驗(yàn)室等資格,。