E.coli 殘留總RNA檢測試劑盒 (RT-PCR熒光探針法) 說明書

貨號：HG-ER001

產(chǎn)品簡介：

E.coli 殘留總RNA試劑盒用于定量檢測各種生物制品中大腸桿菌總RNA的殘留情況，輔助進(jìn)行生物制品的核酸質(zhì)控,。本試劑盒使用RT-PCR熒光探針法原理,，將反轉(zhuǎn)錄和熒光探針qPCR檢測技術(shù)融合，可實(shí)現(xiàn)一步法定量檢測,。通過在大腸桿菌含量高,、表達(dá)穩(wěn)定的RNA靶標(biāo)上，設(shè)計(jì)特異性引物和探針,，通過絕對定量的方法測定總RNA殘留,。

規(guī)格：

100 Reactions

產(chǎn)品組成：

產(chǎn)品儲存條件與有限期：

所有試劑都于-20℃避光保存與運(yùn)輸，有效期18個(gè)月

實(shí)驗(yàn)步驟：

一,、 樣品前處理（需使用試劑盒：HG-CL300）

1.樣品中大腸桿菌（E.coli）RNA殘留檢測作為殘留類的檢測項(xiàng)目,，檢測前需要去除供試品中的DNA，因此需要對供試品進(jìn)行樣本前處理,?？蛇x擇使用我司配套的樣本前處理試劑盒，處理方式如下 ：

2. 按照上表方式配置供試品 DNaseI 消化液,，震蕩混勻,，離心 5s；
3. 將配置完成的供試品 DNaseI 消化液置于 37℃恒溫水浴鍋中孵育 60min,；
4. 取出孵育后供試品 DNaseI 消化液,，瞬時(shí)離心 5s 后置于 65℃干式恒溫器中孵育 10min 滅活 DNase I 酶，將滅活后的供試品DNaseI 消化液放置于 2-8℃冰箱暫存,。

二,、 qPCR操作步驟

1.定量參考品及NTC制備
1.1 將試劑盒中的大腸桿菌RNA定量標(biāo)準(zhǔn)品和RNA稀釋液置于冰上，待完i全融化后,，輕微振蕩混勻,，短暫離心將液體甩至管底；
1.2 取6支干凈的1.5mL離心管,，分別標(biāo)記為ST0,，ST1，ST2,，ST3,，ST4，ST5,；
1.3按下表進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)品的梯度稀釋,，每次稀釋確保充分混勻后再進(jìn)行下一個(gè)梯度的稀釋,。（表格中的體積僅供參考，可根據(jù)實(shí)際實(shí)驗(yàn)需求等比例擴(kuò)大）,；

1.4 NTC 的制備：100uL RNA 稀釋液,。
2.RT-qPCR反應(yīng)液的制備和加樣
2.1 從冰箱里取出各試劑置于冰上解凍；
2.2 PCR反應(yīng)液配制：詳見表5,，One Step RT-qPCR buffer,、One Step Enzyme Mix、E.coli RNA Primer& Probe Mix,、ROX,，這4種試劑可提前預(yù)混成Mix, 再依次加入5μL標(biāo)曲 (ST1/ST2/ST3/ST4/ST5)、NTC,、供試品溶液,，混勻,。每個(gè)樣各做三個(gè)平行,。
2.3 根據(jù)反應(yīng)孔數(shù)計(jì)算本次所需的Mix混合液總量：
Mix混合液 =（反應(yīng)孔數(shù)+2）× (10+1+3.6+0.4) μL（含有2孔的損失量）
加樣完成密封好管子后，請先低速離心10 sec將管壁的液體離心收集至管底,，再震蕩混勻5 sec以上,，完i全混勻反應(yīng)液，再低速離心10 sec將管壁的液體離心收集至管底,，如有氣泡,，需將氣泡排盡。

RT-qPCR反應(yīng)液配制表

*請對應(yīng)機(jī)型選擇適配的ROX,；若機(jī)型適配為no ROX,，請加入等體積的去離子水（要求無核酸及核酸酶污染級去離子水）。

3. IPC組配制反應(yīng)液的制備和加樣（如果在檢測中已經(jīng)有如加標(biāo)回收等方式,，IPC檢測可以取消）每次實(shí)驗(yàn)需做一個(gè)無模板對照（IPC-NTC）和各個(gè)待測樣本的IPC（IPC-S）檢測,，根據(jù)下表：

IPC RT-qPCR反應(yīng)液配制表

備注：
加標(biāo)體系ERC：90μL 樣品+10μL ST3,；
加標(biāo)回收率=ERC/（0.9*樣品+0.1*ST3）,；（加標(biāo)回收率質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)：50%~150%）
加標(biāo)回收與IPC二選一，如選擇加標(biāo)回收,，可將表7中IPC-S更換為ERC-S,。

4.反應(yīng)孔排版示例

備注：該示例表示的是檢測5個(gè)濃度梯度的RNA標(biāo)準(zhǔn)曲線、1個(gè)無模板對照NTC,、3個(gè)待測樣本,。針對IPC的無模板對照（IPC-NTC）和待測樣本的 IPC（IPC-S1，IPC-S2,，IPC-S3）,。每個(gè)檢測做3個(gè)重復(fù)孔,。實(shí)際檢測時(shí)可根據(jù)樣本多少，參照上表示例進(jìn)行96孔板排版加樣,。
加樣完成后將96孔板用光學(xué)膜封閉,，輕微震蕩混勻，用96孔板專用離心機(jī)短暫離心將液體全部甩至管底后放入qPCR儀中,。

三,、 反應(yīng)程序和參數(shù)設(shè)置

（以ABI公司7500 qPCR儀，軟件版本V2.0.6為例）

1.創(chuàng)建空白新程序,，選擇絕對定量檢測模板,，taqman探針法。
2.創(chuàng)建新檢測探針,，命名為E.coli RNA,，選擇報(bào)告熒光基團(tuán)為FAM，猝滅熒光基團(tuán)為none,；創(chuàng)建新檢測探針,，命名為RNA IPC，選擇報(bào)告熒光基團(tuán)為VIC,，猝滅熒光基團(tuán)為none,；檢測參比熒光為 ROX。
3.設(shè)置三步法反應(yīng)程序如下表：反應(yīng)體積 20μL,。

反應(yīng)程序

4. 運(yùn)行PCR程序,。

四、 結(jié)果分析

1. 在Results 的Amplification Plot 中,，可初步查看擴(kuò)增曲線的形態(tài)是否正常,。機(jī)器通常會自動設(shè)置閾值（Threshold ）和基線（Baseline），當(dāng)target設(shè)置等不同時(shí)可能會出現(xiàn)多個(gè)閾值,，而導(dǎo)致結(jié)果分析有誤,，此時(shí)請手動設(shè)置閾值線，但需確保設(shè)置的閾值線在指數(shù)擴(kuò)增區(qū),，如通常Threshold設(shè)置為0.15,，選Auto Baseline，點(diǎn)擊Analyze,，可看到調(diào)整后的結(jié)果,。
2. 在Results的Standard Curve 中，可讀取標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率（Slope）,、截距（Intercept）,、R2。 可接受標(biāo)準(zhǔn)Effective：85%~110%,，R2≥0.98,；
3. 在Results 的Report中,，Mean Quantity 一欄可讀取無模板對照 NTC、待測樣本的檢測值,，單位為fg/μL,。NTC的Ct值應(yīng)大于ST5的Ct值，檢測值應(yīng)低2fg/μL,。
4. 分析IPC的Ct值,，正常情況下樣本的Ct-IPC值應(yīng)該與無模板對照NTC的Ct-IPC值一致或±2。如樣本的Ct-IPC值與無模板對照NTC的Ct-IPC值相比明顯增大,，則表明樣本可能存在明顯抑制,。
5. E.coli RNA 殘留量計(jì)算：
異常數(shù)據(jù)及檢測過程出現(xiàn)意外情況比如管漏液，樣本蒸發(fā)以及樣本加錯(cuò)等,，其產(chǎn)生的數(shù)據(jù)應(yīng)刪除,，并在檢測記錄中說明原因，其他正常的數(shù)據(jù)可以繼續(xù)應(yīng)用于檢測結(jié)果的計(jì)算中

注意事項(xiàng)：

1. 本試劑盒已通過穩(wěn)定性（凍融等因素）的驗(yàn)證,，無需分裝,。
2. 陰性樣品和陽性樣品（參考品和待測樣品等）的配制環(huán)境需區(qū)分區(qū)域，不可在一個(gè)區(qū)域內(nèi)操作,，配制人員需穿戴整齊,，戴
好口罩,、手套和穿好潔凈服,。
3. 注意在不同加樣步驟間及時(shí)更換吸頭，避免交叉污染,，避免長時(shí)開蓋,。
4. 試劑盒必須在有效期內(nèi)使用。
5. 試劑盒內(nèi)所有組分建議在低溫環(huán)境融化后使用,。
6. 只有嚴(yán)格遵守說明書的操作方法,，全部使用本試劑盒配套的試劑才能保證優(yōu)良檢測效果。
7. 盡量在當(dāng)天完成樣本前處理純化后立即進(jìn)行后續(xù)qPCR檢測,，以保證檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性,。
8. 最終的試驗(yàn)結(jié)果與試劑的有效性、操作者的操作方法及試驗(yàn)環(huán)境密切相關(guān),。
9. 公司只對試劑盒本身負(fù)責(zé),，不對因使用該試劑盒所造成的樣本消耗負(fù)責(zé)，請使用者使用前充分考慮到樣本的可能使用量,，
預(yù)留充足的樣本,。
10. 本試劑盒僅供體外研究使用，不用于臨床診斷,。

E.coli殘留總RNA檢測試劑盒產(chǎn)品訂購,，請聯(lián)系柏萊源（天津）生物科技有限公司,！

柏萊源（天津）生物科技有限公司的優(yōu)勢：

現(xiàn)貨供應(yīng)：公司庫存充足，可快速發(fā)貨,，減少用戶等待時(shí)間,。

效期保障：嚴(yán)格把控產(chǎn)品質(zhì)量，確保試劑效期新鮮,，保障實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性,。

專業(yè)技術(shù)支持：提供詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)方案和技術(shù)指導(dǎo)，幫助用戶優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件,，提高實(shí)驗(yàn)成功率,。

定制化服務(wù)：根據(jù)用戶需求，提供個(gè)性化的產(chǎn)品和服務(wù)解決方案,。

售后保障：完善的售后服務(wù)體系,，及時(shí)解決用戶在使用過程中遇到的問題。

E.coli殘留總RNA檢測試劑盒：柏萊源（天津）生物科技有限公司,，更多產(chǎn)品資訊,，請聯(lián)系我們哦！