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大腸桿菌折戟沉沙,誰來拯救包涵體蛋白,?

閱讀:190      發(fā)布時間:2024-7-16
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哈嘍寶子們,,我最近遇到了一個難纏的蛋白,用大腸桿菌表達后會出現(xiàn)在沉淀中,。如果從沉淀中提取純化,,操作復雜姑且不論,還有可能沒有活性,!如果優(yōu)化培養(yǎng)條件讓它在上清中表達,,需要慢慢摸索,費時費力還不一定成功,。這幾天為了思考解決辦法,,真是要茶飯不思了!

閉門造車不如出門取經(jīng),,這不,,我在萬能的師兄這里求來了一樣新“法寶",據(jù)說它可以讓包涵體蛋白在上清中表達,。今天讓我們一起來看一下它究竟“威能"如何吧,!內(nèi)含我的真實實驗步驟+結(jié)果+操作Tips哦,。


如何拯救包涵體蛋白?


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“法寶"顯威——無細胞蛋白表達試劑盒初體驗



一,、使用前準備


打開試劑盒,,讓我們看一下它的廬山真面目。

試劑盒內(nèi)一共三個組分,,分別是:

組分A,、組分B、PC(陽性對照質(zhì)粒),。

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將各組分取出,在冰上融化,。

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二,、模板準備


與原核細胞表達不同,這款無細胞試劑盒可以不用質(zhì)粒模板,,只需要在目的基因上下游引入T7轉(zhuǎn)錄表達原件,,構(gòu)建一個線性模板。

第一步,,用PCR分別獲得5UTR片段,,3UTR片段以及目的基因片段;

第二步,,用重疊PCR方法,,將上一步獲得的目的基因片段和5UTR片段,3UTR片段拼接稱完整的線性表達模板,。

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三,、體系構(gòu)建


由于是初次嘗試,我這次選擇50μL的總體積,。在96孔板中反應,,按照這張表加試劑和構(gòu)建好的DNA模板5μL(體系體積的1/10),用移液槍反復吹打混勻,。


試劑

陰性對照(μL

陽性對照(μL

實驗組(μL

組分A

20.5

20.5

20.5

組分B

16.7

16.7

16.7

DNA模板

/

5

5

雙蒸水

12.8

7.8

7.8

反應總體積

50

50

50


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四,、孵育


將混合好的反應液轉(zhuǎn)移至搖床中,溫度25℃,、180rpm,,反應16h,確保蛋白表達,。


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孵育四小時后,,迫不及待先看一下GFP的表達情況,觀察到陽性對照已有明顯綠色熒光,。

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五,、收獲


次日一早,,打開搖床就看到了陽性對照醒目的綠色熒光。既然陽性對照表達了,,目標蛋白想來不成問題,!滿懷期待開始離心、跑膠鑒定,。


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六,、鑒定


將陰性對照和實驗組分別制洗脫樣、上清樣,、沉淀樣,,上樣量:洗脫樣、上清樣10μL,,沉淀樣5μL,。電泳條件:12%SDS-PAGE膠,100V,,1.5h,。

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不愧是師兄力薦的“法寶",沒有辜負我的厚望,,第一次實驗,,我的蛋白就在上清中成功表達了!


七,、總結(jié)

這次實驗真是一次全新的體驗,。在無細胞蛋白表達體系下,整個實驗從模板構(gòu)建,、反應體系構(gòu)建,、孵育、到最后收獲目標蛋白并鑒定,,只用了兩天時間,,不但在上清中表達出了原核細胞表達中會形成包涵體的蛋白,還大大縮短了實驗時間,。真讓我有把所有蛋白都用無細胞體系表達的沖動,!

Tips:


1.無細胞蛋白表達試劑盒可以用線性模板也可以用質(zhì)粒模板,線性模板更加方便快捷,,但是質(zhì)粒模板表達量一般較高,。

2.組分A、B在實驗前要提前放在冰上融化,,防止試劑失效,。使用前先用移液槍吹打混勻,再吸取相應體積。

3.微孔板四周可以加入適量雙蒸水,,防止孵育過程中體系水分蒸發(fā),。本次實驗因為要過夜表達,為了確保反應體系不被蒸干,,我在96孔板最外側(cè)一周的所有孔位里都加了水,,而且在搖床四角也各放置了一只裝水的離心管。

4.對于復雜蛋白表達,,可以延長孵育時間,,保證蛋白充分表達。

5.如果調(diào)整反應體積,,需要按照說明書推薦隨之調(diào)整反應容器,。


CFPS——蛋白表達“新勢力"


初次表達包涵體大獲成功,無細胞蛋白表達究竟是“何方神圣",?在實驗結(jié)束之后,,我粗略了解了一下這一新技術(shù),發(fā)現(xiàn)它的強大不止于此,。

無細胞蛋白表達(Cell-free protein expression,CFPS)是指將細胞內(nèi)合成蛋白所需要的RNA聚合酶,、核糖體及轉(zhuǎn)錄翻譯輔助因子等分子機器提取出來,,并輔以核苷酸、氨基酸,、能量物質(zhì)及基因模板,,在沒有活細胞參與的體外直接合成蛋白質(zhì)的生物合成反應。

受細胞自身生理功能限制,,有些蛋白在傳統(tǒng)的細胞表達系統(tǒng)產(chǎn)量低甚至不能表達,,而無細胞系統(tǒng)可以擺脫這種限制,廣泛適用于細胞因子,、抗體,、膜蛋白、毒性蛋白,、包涵體蛋白表達等場景,。此外,無細胞蛋白表達反應周期短,、易與自動化設備結(jié)合,、自由度與可控程度高,適合蛋白快速交付,、酶定向進化篩選,、AI蛋白制造、ADC藥物開發(fā)等領(lǐng)域,,可謂是蛋白表達領(lǐng)域的“新勢力",。

隨著合成生物學發(fā)展,,無細胞蛋白表達技術(shù)已然嶄露頭角,大有騰飛之勢,。技術(shù)的發(fā)展是推動科學研究進步的重要助力,,善于利用新技術(shù),有時能使科研過程事半功倍,,我也算是深有體會了,!



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