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無細胞蛋白表達:突破傳統(tǒng)瓶頸的新興技術(shù)

閱讀:363      發(fā)布時間:2024-6-20
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蛋白質(zhì)是生命體最重要的分子之一,,具有極其廣泛的功能和作用。傳統(tǒng)上,,研究者可以利用細胞表達體系來制備需要的蛋白質(zhì),,并對其進行深入的研究。然而,,受限于細胞生長,、維護,、污染等因素,,細胞表達體系面臨著一些瓶頸和挑戰(zhàn),特別是在高通量生產(chǎn)和定制蛋白質(zhì)方面更是如此,。

 為了突破這些限制以及為高效蛋白質(zhì)制備和研究提供更多選擇,,無細胞蛋白表達技術(shù)應(yīng)運而生。它作為一種基礎(chǔ)研究工具已經(jīng)在生命科學(xué)中使用了五十多年,,最近的技術(shù)發(fā)展促進了無細胞蛋白表達的高產(chǎn),。與傳統(tǒng)的細胞表達體系不同,無細胞表達體系可以在體外條件下完成蛋白質(zhì)的合成,并且具有高效,、便捷,、靈活以及高純度等優(yōu)點。隨著技術(shù)的發(fā)展無細胞蛋白表達技術(shù)正在成為生物醫(yī)藥和基礎(chǔ)研究領(lǐng)域中備受關(guān)注的新興技術(shù)之一,。




無細胞蛋白表達:突破傳統(tǒng)瓶頸的新興技術(shù)

圖1:無細胞蛋白表達系統(tǒng)的發(fā)展


今天,,小編將從無細胞蛋白表達的概念、技術(shù)原理,、關(guān)鍵技術(shù)細節(jié)等方面探討這一引人注目的技術(shù),。


概述


無細胞蛋白表達是一種體外重組蛋白質(zhì)表達技術(shù)也稱為無細胞蛋白質(zhì)合成技術(shù)(CFPS:Cell-free protein synthesis),是指用含有蛋白合成必需的組分(核糖體,,轉(zhuǎn)運RNA,,氨酰合成酶,啟動/延伸/終止因子,,三磷酸鳥苷,,ATP,Mg2+和K+)的細胞裂解物在體外進行蛋白合成,。

無細胞蛋白表達技術(shù)適用于制備各種類型的蛋白質(zhì),,包括難表達蛋白質(zhì)、毒性蛋白質(zhì),、復(fù)雜蛋白質(zhì)等,。在藥物研究、生物制造和生命科學(xué)等領(lǐng)域中得到廣泛關(guān)注和應(yīng)用,,無論是研究,、開發(fā)還是商業(yè)化應(yīng)用過程。目前無細胞蛋白表達主要應(yīng)用于藥物研發(fā)領(lǐng)域,,例如抗體制備和生物藥物生產(chǎn)等,。隨著人工智能技術(shù)的不斷發(fā)展,無細胞蛋白表達技術(shù)可以與人工智能算法結(jié)合,,構(gòu)建計算機輔助的高通量生產(chǎn)系統(tǒng),,實現(xiàn)個性化、精準的生物醫(yī)學(xué)治療,。除此之外,,還能夠應(yīng)用于其他領(lǐng)域,例如基因工程,、環(huán)境保護和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)等,。隨著無細胞蛋白表達技術(shù)的不斷發(fā)展和人工智能技術(shù)的不斷進步,我們可以看到更多的新領(lǐng)域和新應(yīng)用出現(xiàn),,給生物科技行業(yè)帶來更多的機遇和挑戰(zhàn),。

無細胞蛋白表達:突破傳統(tǒng)瓶頸的新興技術(shù)


圖2:典型無細胞蛋白表達的工作流程


技術(shù)原理



CFPS系統(tǒng)使用微生物,、植物或動物的粗細胞裂解物中的成分來合成蛋白質(zhì)。常用的粗提取物是大腸桿菌,、兔網(wǎng)織紅細胞,、小麥胚芽(WGE)、昆蟲細胞或市售的純化重組元件系統(tǒng)(PURE),。CFPS系統(tǒng)的制備是一個簡單的過程,,其中目的細胞過夜生長,稀釋,,并進一步生長,,直到光密度達到0.8至1.0,之后收獲細胞并超聲處理以提取細胞裂解物,。然后將添加了必要輔因子,、能量源、核苷酸,、底物,、氨基酸和tRNA的緩沖混合物添加到細胞提取物中,將其轉(zhuǎn)化為CFPS和無細胞轉(zhuǎn)錄-翻譯(TX–TL)系統(tǒng),。

CFPS系統(tǒng)的一般方案如圖3所示,,該實驗使用含有必要細胞裂解物和DNA(線性或質(zhì)粒)的緩沖液,以及相關(guān)的能量源,、核苷酸,、氨基酸、鹽和輔因子,,共同維持反應(yīng)以合成感興趣的產(chǎn)物,。CFPS的合成產(chǎn)物可能因多種化學(xué)或生物部分而異,包括病毒,、治療劑,、抗體、化學(xué)品,、生物燃料和蛋白質(zhì),。在合成此類產(chǎn)物時,CFPS系統(tǒng)相對于體內(nèi)系統(tǒng)具有直接優(yōu)勢,,特別是考慮到該技術(shù)的相對速度,、簡單性和有效性。通常,,體內(nèi)系統(tǒng)是耗時的,,并且往往比CFPS系統(tǒng)有更多的步驟,。

無細胞蛋白表達:突破傳統(tǒng)瓶頸的新興技術(shù)

圖3:在單管中進行的CFPS系統(tǒng)的示意圖


技術(shù)細節(jié)


1

反應(yīng)體系

反應(yīng)體系的搭建是無細胞蛋白表達實驗的關(guān)鍵,,為保證反應(yīng)的高效性和可重復(fù)性,需要精心構(gòu)建反應(yīng)體系,,包括選用合適的模板、化學(xué)物質(zhì),、電解質(zhì),、抗氧化劑和各種工具等。

2

反應(yīng)條件

需要根據(jù)實驗要求調(diào)整反應(yīng)條件,包括溫度,、離子強度,、pH、反應(yīng)時間等多個方面,,有利于促進核苷酸的轉(zhuǎn)錄和翻譯,,以及蛋白質(zhì)的自組裝和成型,。

3

生產(chǎn)規(guī)模

無細胞蛋白表達技術(shù)可以擴大生產(chǎn)規(guī)模,,提高生產(chǎn)效率,但需要保證反應(yīng)體系的穩(wěn)定性和可重復(fù)性,,同時要保證反應(yīng)環(huán)境的清潔和消毒,,以避免其他污染物的進入,從而影響蛋白質(zhì)的純度和活性,。


技術(shù)優(yōu)勢


1

更高的蛋白質(zhì)表達量

傳統(tǒng)的活細胞蛋白表達技術(shù)受限于細胞本身的多方面因素,,其表達的蛋白質(zhì)數(shù)量往往受到限制。而無細胞蛋白表達技術(shù)通過在體外底物濃度高的環(huán)境中進行合成反應(yīng),,不但避免了傳統(tǒng)活細胞表達所面臨的方方面面的限制,,還能夠很好地控制反應(yīng)體系,從而獲得表達量更高的蛋白質(zhì),。

2

更快的表達速度

傳統(tǒng)活細胞蛋白表達需要細胞生長并達到最佳密度時才能進行蛋白質(zhì)表達,,這個過程往往需要數(shù)天時間。而無細胞蛋白表達技術(shù)通常只需要數(shù)小時就能夠完成蛋白質(zhì)的表達,,這個速度明顯快于傳統(tǒng)活細胞表達技術(shù),。

3

更精準的蛋白質(zhì)合成

無細胞蛋白表達技術(shù)在體外進行蛋白質(zhì)合成,能夠精確控制底物濃度,、反應(yīng)溫度,、反應(yīng)劑比例等參數(shù),,因此可以更加精準地合成定制的蛋白質(zhì),這對于研究和應(yīng)用來講具有重要意義,。

4

更靈活控制

在無細胞蛋白表達技術(shù)中,,可以使用分離的組分體系進行蛋白質(zhì)的合成,可以控制底物和反應(yīng)劑的比例,,也可以在適當?shù)姆磻?yīng)條件下進行自定義的修飾,,如蛋白質(zhì)標記、藥效分析等,。這些優(yōu)點使得無細胞蛋白表達技術(shù)更加靈活,、可控,適用于更廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域,。

無細胞蛋白表達:突破傳統(tǒng)瓶頸的新興技術(shù)


圖4:體內(nèi)細胞和體外無細胞蛋白質(zhì)合成比較



應(yīng)用



無細胞蛋白表達技術(shù)是一種飛速發(fā)展的新型生物技術(shù),,具有廣闊的應(yīng)用前景和潛力。該技術(shù)可以快速,、高效,、經(jīng)濟地合成蛋白質(zhì),可廣泛應(yīng)用于醫(yī)療,、制藥,、農(nóng)業(yè)、生物材料等多個領(lǐng)域,。


1

醫(yī)療領(lǐng)域

無細胞蛋白表達技術(shù)在醫(yī)療領(lǐng)域應(yīng)用廣泛,,可以用于生產(chǎn)多種蛋白質(zhì)藥品,如單克隆抗體等,。其中,,單克隆抗體是一種重要的治療藥物,具有高度特異性和親和力,,可用于腫瘤,、心血管疾病、自身免疫性疾病等疾病的治療,。傳統(tǒng)單克隆抗體生產(chǎn)方法需要花費大量時間和成本,,而無細胞蛋白表達技術(shù)則可以在短時間內(nèi)大規(guī)模合成單克隆抗體,從而大大縮短生產(chǎn)周期,,并且可以降低成本,。此外,無細胞蛋白表達技術(shù)也可以用于疫苗研發(fā),。比如瘧疾疫苗研究開發(fā)昂貴又耗時,,目前利用WGE系統(tǒng)可加速疫苗研發(fā),并建立高通量瘧原蟲抗體篩查系統(tǒng),。Stark等利用大腸桿菌的便攜式凍干裂解物再水化,,1h內(nèi)合成高致病性病原體土拉弗朗西斯菌亞種的生物偶聯(lián)疫苗,,與工程菌生產(chǎn)的疫苗相比,其可引發(fā)更高水平的病原體特異性抗體,。

2

制藥領(lǐng)域

制藥領(lǐng)域是無細胞蛋白表達技術(shù)的一個重要應(yīng)用領(lǐng)域,。藥物開發(fā)的成功率取決于藥物分子對目標蛋白的親和力,,而目標蛋白對于專一的細胞表達系統(tǒng)和分類的組織或器官非常敏感,。通過無細胞蛋白表達技術(shù),研究人員可以在不依賴于細胞的情況下直接生產(chǎn)大量需要的蛋白質(zhì),,為藥物研發(fā)提供了更快更便捷的方法,。

3

基礎(chǔ)研究領(lǐng)域

利用無細胞蛋白質(zhì)合成系統(tǒng)可以直接對表達產(chǎn)物進行核磁共振分析,目前已確定了數(shù)千個蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),??梢酝ㄟ^合成蛋白質(zhì)建立蛋白質(zhì)陣列,解開基因產(chǎn)物的功能,;應(yīng)用核糖體展示和 mRNA 展示技術(shù),,更有利于實現(xiàn)高通量篩選,全面深入研究基因特征和功能,。通過無細胞蛋白表達技術(shù)可以實現(xiàn)對大型蛋白質(zhì)的生產(chǎn)和分析,,同時也為基礎(chǔ)研究打開了新的研究領(lǐng)域。


AI賦能無細胞蛋白表達



隨著計算機技術(shù)的不斷發(fā)展和進步,,機器學(xué)習(xí)技術(shù)以及基于機器學(xué)習(xí)的人工智能技術(shù)在生物領(lǐng)域的應(yīng)用也日益成熟和廣泛,。同時,由于無細胞蛋白表達技術(shù)的新型性和高效性,,使得該技術(shù)與人工智能技術(shù)的結(jié)合也更加有前景,。當前,人工智能正在被廣泛應(yīng)用于科學(xué)和醫(yī)療領(lǐng)域,。在無細胞蛋白表達研究方面,,人工智能已被應(yīng)用于實驗設(shè)計、分析和解釋結(jié)果,。
一方面,,人工智能技術(shù)可以為無細胞蛋白表達技術(shù)的高效應(yīng)用提供支持。在無細胞蛋白表達技術(shù)中,,蛋白質(zhì)合成是一個十分關(guān)鍵和繁瑣的過程,,需要進行多層面調(diào)控和優(yōu)化。而人工智能技術(shù)則可以利用算法分析數(shù)據(jù),,預(yù)測蛋白質(zhì)表達的最佳參數(shù),,并實現(xiàn)高通量的蛋白質(zhì)表達。例如,,一些研究團隊開發(fā)了一種利用深度學(xué)習(xí)預(yù)測無細胞蛋白質(zhì)表達的算法,,可以預(yù)測蛋白質(zhì)表達的最佳條件并改善合成效率,。

另一方面,無細胞蛋白表達技術(shù)和人工智能技術(shù)的結(jié)合也可以拓展生物醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用范圍,。例如,,利用無細胞蛋白表達技術(shù)和人工智能技術(shù)可以快速高效地生產(chǎn)一些生物標志物或特定蛋白質(zhì),用于生物檢測和診斷,。同時,,人工智能技術(shù)可以根據(jù)病態(tài)組織特異性標識,利用無細胞蛋白表達技術(shù)高效合成具有特定作用的生物藥劑,,實現(xiàn)精準醫(yī)療和個性化治療,,具有廣闊的研究和應(yīng)用前景。


展望


無細胞蛋白表達技術(shù)是一項革命性的技術(shù),,具有非常廣泛的應(yīng)用前景,。通過不斷的探索和研究,相信這一技術(shù)將在醫(yī)療,、制藥,、農(nóng)業(yè)、科學(xué)等領(lǐng)域中發(fā)揮越來越重要的作用,,為人類生產(chǎn)和生活帶來更多的可能性,。未來,結(jié)合AI技術(shù),,無細胞蛋白表達技術(shù)有望繼續(xù)創(chuàng)新和發(fā)展,,成為生命科學(xué)在全球范圍內(nèi)最為重要的技術(shù)之一。
無細胞蛋白表達:突破傳統(tǒng)瓶頸的新興技術(shù)


圖5:無細胞蛋白表達技術(shù)的展望
無細胞蛋白表達:突破傳統(tǒng)瓶頸的新興技術(shù)

參考文獻:


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