微生物實(shí)驗(yàn)室一般包括清潔區(qū),、操作區(qū)和無菌區(qū)三個(gè)區(qū)域,，可劃分為準(zhǔn)備室、培養(yǎng)室,、菌種室,、消毒室、無菌室等多個(gè)房間,。微生物實(shí)驗(yàn)室根據(jù)專業(yè)領(lǐng)域（環(huán)保,、食品,、藥品、醫(yī)學(xué)等）和性質(zhì)（教學(xué),、生產(chǎn),、科研、檢測等）的不同,，實(shí)驗(yàn)室的組成和規(guī)模有較大差別,。
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