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CRISPR重要成果:scRNA
閱讀:456 發(fā)布時(shí)間:2015-1-23為了和病毒或入侵核酸進(jìn)行斗爭,細(xì)菌采用了多種防御機(jī)制,。以CRISPR序列為核心的適應(yīng)性核酸免疫系統(tǒng)就是其中之一,。在CRISPR和CRISPR相關(guān)蛋白(Cas)的幫助下,細(xì)菌可以在小RNA分子的引導(dǎo)下,,靶標(biāo)和沉默入侵者的遺傳信息,。近年來,CRISPR系統(tǒng)已經(jīng)成為了炙手可熱的基因編輯工具,,掀起了一股性的基因組編輯熱潮,。
日前,,加州大學(xué)的科學(xué)家們開發(fā)了一種CRISPR支架RNA(scRNA)。scRNA編碼了靶位點(diǎn)和調(diào)控功能,,能同時(shí)實(shí)現(xiàn)對不同基因的激活和抑制,。這項(xiàng)研究發(fā)表在zui近一期的Cell雜志上,文章的通訊作者是加州大學(xué)舊金山分校的齊磊(Lei S. Qi,,音譯)和Wendell A. Lim,。齊磊博士所在的研究組已經(jīng)在Cell、Nature Biotechnology,、Nature Methods等雜志上接連發(fā)表了多篇CRISPR文章,。
真核生物的細(xì)胞有著復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄程序,特異性的調(diào)控復(fù)合體通過不同途徑調(diào)節(jié)著基因組的不同位點(diǎn),。研究人員根據(jù)這一原則,,以 CRISPR為基礎(chǔ)設(shè)計(jì)了適用于酵母和人類細(xì)胞的人工轉(zhuǎn)錄程序。
CRISPR/Cas體系包括一個稱為Cas9的DNA剪切酶,,和一段與目標(biāo)DNA片段匹配的引導(dǎo)性短RNA(gRNA),。研究人員拓展了CRISPR的引導(dǎo)RNA,在上面加入了效應(yīng)蛋白的招募位點(diǎn),,建立了既編碼靶位點(diǎn)又編碼調(diào)控活性的支架RNA(scaffold RNA,,scRNA)。
這種支架RNA可以用來設(shè)計(jì)多基因轉(zhuǎn)錄程序,在激活一些基因的同時(shí)抑制另一些基因。研究人員用這種方法,,成功在酵母中重新定向了一個復(fù)雜的代謝通路。研究顯示,,scRNA在哺乳動物和酵母細(xì)胞中均能有效發(fā)揮功能。此外,,誘導(dǎo)dCas9蛋白的表達(dá)可以控制轉(zhuǎn)錄程序的執(zhí)行,,成為整個體系的一個主要控制點(diǎn)。(延伸閱讀:張鋒Nature發(fā)表重要突破:用 CRISPR啟動基因)
這項(xiàng)研究為設(shè)計(jì)基因表達(dá)程序的研究者們提供了一個有力工具,,該技術(shù)有著非常廣泛的應(yīng)用,,比如改寫細(xì)胞命運(yùn)或者設(shè)計(jì)代謝通路。多基因的組合性控制可以幫助人們靈活操縱細(xì)胞中的通路,。