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新型冠狀病毒系列解決方案二：糞便及環(huán)境水體類樣本病毒提取方法匯總
閱讀：2569 發(fā)布時(shí)間：2020-2-10對(duì)于糞-口傳播,，除了病患的排泄物及嘔吐物還需注意環(huán)境水源中的污染檢測(cè)及控制,。針對(duì)這類樣本的核酸檢測(cè)，其主要難點(diǎn)在于糞便及環(huán)境廢水中存在的各類高濃度抑制劑,，如果在核酸提取過程中沒有*去除會(huì)導(dǎo)致下游檢測(cè)的假陰性風(fēng)險(xiǎn),，延誤病毒的發(fā)現(xiàn)。
I
糞便&環(huán)境水體類樣本處理方法匯總
TissueRuptor
TissueLyser LT
TissueLyser II
研磨珠
2×10ml 研磨鋼罐T
2×24 2ml 適配器
使用勻漿器TissueRuptor（貨號(hào)9001272）或高通量組織研磨器TissueLyser II（ 貨號(hào)85300） 可以實(shí)現(xiàn)各種組織,、細(xì)菌,、酵母等樣品的快速破碎和均質(zhì)化。TissueRuptor 處理單個(gè)樣品快至30 秒,，TissueLyser 在2-4分鐘可處理192個(gè)樣品,。
TissueRuptor TissueLyser LT&TissueLyser樣本破碎系統(tǒng)：
TissueRuptor 是一款單通道的手持式電動(dòng)勻漿器，使用一次性鉆頭,，可對(duì)動(dòng)物及人細(xì)胞或組織進(jìn)行快速,、高效的破碎和勻漿。
TissueLyser LT是一款中低通量的研磨器,，一次可在幾分鐘內(nèi)處理12個(gè)新鮮或冰凍樣本,，TissueLyser II 是一款中到高通量的研磨器，一次可處理2×24 或2×96個(gè)樣本,，可在5 分鐘以內(nèi)完成,，TissueLyser 系列適合各種動(dòng)物組織、植物,、酵母或細(xì)菌樣本,。
一次性鉆頭有效降低交叉污染
快速、高效地破碎各類生物樣本
與QIAGEN 樣本純化技術(shù)無縫整合
可重復(fù)的,、標(biāo)準(zhǔn)化的樣本破碎
| 產(chǎn)品 | 說明 | 貨號(hào) |
| Vortex Adapter for 24 (1.5–2.0 ml) tubes | 24 孔 (1.5–2 ml) Tubes | 13000-V1-24 |
| Vortex Adapter for 6 (5 ml) tubes | 6 孔 (5.0 ml) Tubes | 13000-V1-5 |
| Vortex Adapter for 4 (15 ml) tubes | 4 孔 (15 ml) Tubes | 13000-V1-15 |
| Vortex Adapter for 2 (50 ml) tubes | 2 孔 (50 ml) Tubes | 13000-V1-50 |
| TissueLyser II | 研磨儀 | 85300 |
| TissueLyser Adapter Set 2×24 | Tissuelyser 適配器2×24 | 69982 |
| TissueLyser Adapter Set 2×96 | Tissuelyser 適配器2×96 | 69984 |
II
糞便&環(huán)境水體類樣本處理方法匯總
01
RNeasy PowerMicrobiome Kit（50）貨號(hào)：26000-50
• 可從多至250mg糞便樣本中提取微生物總RNA,。包含抑制因子去除zhuan利技術(shù)，可*去除糞便樣本中各類復(fù)雜高濃度抑制劑,。包含柱上DNase消化過程,，獲得不含gDNA污染的總RNA。*包含2ml珠磨研磨管,，搭配PowerLyzer 24（貨號(hào)：13155）,，30秒或渦旋振蕩儀匹配Vortex Adapter for 24(1.5-2.0 ml) tubes （貨號(hào)：13000-v1-24）10-20分鐘可獲得*裂解效果,。可在QIAcube Connect（貨號(hào)：9002864）上自動(dòng)純化,。從血漿,、血清和無細(xì)胞體液中同時(shí)純化毒 DNA 和 RNA，無需有機(jī)提取或乙醇沉淀,，*去除污染物和抑制劑,。起始樣品體積可多至 0.2 ml，使用選擇性結(jié)合的硅膠膜,，具有 20–150μl 的靈活洗脫體積,。表格中列出的試劑盒除了可以靈活的手工操作外，均可以在 QIAcube 全自動(dòng)核酸純化儀上實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化操作,。
02
Allprep PowerViral DNA/RNA Kit(50) 貨號(hào)：28000-50
• 可從多至250mg糞便,、腸容物樣本或200ul廢水或拭子樣本中提取所有病毒DNA和RNA。包含抑制因子去除zhuan利技術(shù),，可*去除樣本中高濃度抑制劑,。*包含2ml珠磨研磨管，搭配PowerLyzer 24（貨號(hào)：13155）,，30秒或渦旋振蕩儀匹配Vortex Adapter for 24(1.5-2.0 ml) tubes （貨號(hào)：13000-v1-24）10-20分鐘可獲得*裂解效果,。
03
RNeasy PowerWater Kit(50) 貨號(hào)：14700-50-NF
• 可從一張47mm水體濾膜或25mm空氣濾膜中提取微生物總RNA。無需剪碎濾膜,，避免額外接觸引入交叉污染,。包含抑制因子去除zhuan利技術(shù)，可*去除樣本中高濃度抑制劑,。*包含5ml珠磨研磨管,，搭配渦旋振蕩儀匹配Vortex Adapter for 6(5 /15 ml) tubes （貨號(hào)：13000-v1-5）10-20分鐘可獲得*裂解效果。
III
病毒定性檢測(cè)(有效提升陽性篩查率)
QuantiNova Pathogen +IC Kit (100/500) 貨號(hào)：（208652/ 208654）
• 凱杰208652內(nèi)置Internal Control（IC）,，幫助監(jiān)控提取及PCR效果,，助力疫情篩查出真陽性！
• 內(nèi)置合成的轉(zhuǎn)錄本,，可以非常好的監(jiān)控從提取，反轉(zhuǎn)錄到熒光定量的整個(gè)環(huán)節(jié),，確保每個(gè)環(huán)節(jié)都精準(zhǔn)可控
• 通過內(nèi)置顏色指示劑實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確的反應(yīng)構(gòu)建,，避免重復(fù)或者漏加樣