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IC50是一種測量化合物抑制生物學(xué)活性的常用方法,藥物研發(fā)中的應(yīng)用尤其廣泛,。IC50代表半最大抑制濃度,,即一種化合物抑制特定生物學(xué)反應(yīng)的能力,使其活性降低50%的濃度,。這種生物學(xué)活性可以是酶的活性,、受體的信號(hào)傳導(dǎo)、細(xì)胞增殖或其他生物學(xué)效應(yīng),。
IC50的測定通常通過在不同濃度的化合物溶液中進(jìn)行生物學(xué)實(shí)驗(yàn)來完成,。通過測量生物學(xué)效應(yīng)的變化(例如酶活性或細(xì)胞生存率)并繪制濃度-響應(yīng)曲線,可以確定IC50值,。通常,,IC50值越低,即化合物對(duì)生物學(xué)目標(biāo)的抑制作用越強(qiáng),。
IC50在藥物研發(fā)中具有多種應(yīng)用,。首先,它可以用來評(píng)估化合物對(duì)特定靶標(biāo)的親和力和選擇性,。較低的IC50值通常表示化合物對(duì)靶標(biāo)具有較高的親和力,。其次,IC50還可以用來評(píng)估化合物的藥理學(xué)效應(yīng),,如藥物對(duì)疾病相關(guān)酶的抑制作用,。此外,IC50值還可以用來比較不同化合物之間的活性,,以便進(jìn)行藥物篩選和優(yōu)化,。
盡管IC50的應(yīng)用十分廣泛,但是我們?cè)谧约旱腎C50測試過程中經(jīng)常遇到測試結(jié)果與報(bào)道結(jié)果不一致的情況,。實(shí)際上,,IC50的差異是廣泛存在的。
如,,Pexidartinib vs CSF1R檢測中,,最常被報(bào)道的IC50值是20nM,,但是其他的測試結(jié)果也同樣被報(bào)道:
1.7 nM (doi.org/10.1016/j.bmcl.2022.128928)
2.7nM (doi.org/10.1016/j.cbi.2022.110255)
9.7nM (doi.org/10.1021/acs.jmedchem.3c00428)
文獻(xiàn)中的測試方法是不一樣的,以上的測試結(jié)果分別使用了分光光度法, Z-LYTE檢測和LANCE TR-FRET檢測,。20nM的測試數(shù)值很可能是Plexxikon最先報(bào)道出來的,,通過ChEMBL數(shù)據(jù)庫查詢,并沒有給出詳細(xì)的出處和測試方法,。不同的測試方法所獲得的IC50的數(shù)值是不一樣的,,甚至是數(shù)量級(jí)上的差別。
U0126 vs MKK1的IC50測試中,,使用的截短的,、構(gòu)成活性的重組MKK1結(jié)構(gòu)域,其IC50約為70 nM,,使用細(xì)胞中分離的全長內(nèi)源活化的野生型MKK1,,其IC50約為500 nM。酶的結(jié)構(gòu),,甚至翻譯后修飾,、氧化還原狀態(tài)或部分降解產(chǎn)物同樣會(huì)對(duì)IC50的測試結(jié)果產(chǎn)生極大影響。
下圖分別顯示底物濃度[S],、酶濃度[E] 對(duì)standard competitive, uncompetitive和non-competitive抑制中IC50檢測的不同的影響,。對(duì)更多的抑制類型的影響請(qǐng)參考原文。
此外,,緩沖成分,、pH值和離子強(qiáng)度也同樣對(duì)IC50的檢測有著不可預(yù)知的影響。
由于IC50數(shù)值的影響因素眾多,,自己實(shí)驗(yàn)室的IC50檢測值很難與報(bào)道或其他實(shí)驗(yàn)室的IC50檢測值進(jìn)行直接比較。
BPS Bioscience Inc.是一家科學(xué)家創(chuàng)建的科學(xué)家管理的生物技術(shù)公司,。我們的科學(xué)家一直專注于活性重組酶和酶復(fù)合物的設(shè)計(jì),、表達(dá)、純化,。此外,,BPS Bioscience還提供優(yōu)質(zhì)的重組細(xì)胞系和多種檢測試劑盒。BPS Bioscience供應(yīng)超過5000種產(chǎn)品,,同時(shí)提供多樣性的檢測服務(wù)和產(chǎn)品定制化服務(wù),。
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