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靶向蛋白質(zhì)組學概述:技術,、關鍵點及應用

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靶向蛋白質(zhì)組學概述:技術、關鍵點及應用檢測技術服務: 在生命科學研究不斷向jīngzhǔn化、量化與臨床轉(zhuǎn)化推進的jīntiān,,靶向蛋白質(zhì)組學(Targeted Proteomics)以其高靈敏、高特異性與高重復性的特征,,已成為蛋白質(zhì)組學走向臨床的重要工具,。它是連接“組學發(fā)現(xiàn)"與“實際應用"的關鍵橋梁,特別適用于疾病標志物驗證,、藥效學研究,、免疫監(jiān)測和質(zhì)量控制等領域。 一,、什么是靶向蛋白質(zhì)組學,?靶

靶向蛋白質(zhì)組學概述:技術、關鍵點及應用檢測技術服務詳情介紹

在生命科學研究不斷向jīngzhǔn化,、量化與臨床轉(zhuǎn)化推進的jīntiān,,靶向蛋白質(zhì)組學(Targeted Proteomics)以其高靈敏、高特異性與高重復性的特征,,已成為蛋白質(zhì)組學走向臨床的重要工具,。它是連接“組學發(fā)現(xiàn)"與“實際應用"的關鍵橋梁,,特別適用于疾病標志物驗證、藥效學研究,、免疫監(jiān)測和質(zhì)量控制等領域,。


一、什么是靶向蛋白質(zhì)組學,?

靶向蛋白質(zhì)組學以質(zhì)譜為核心檢測手段,,其共同特征是對目標肽段進行事先選擇、再進行特異性采集與定量,。當前常用的三種策略包括:

1,、MRM/SRM(Multiple/Selected Reaction Monitoring):基于三重四極桿質(zhì)譜,監(jiān)測設定的前體-產(chǎn)物離子對,,廣泛用于高通量,、多樣本驗證;

2,、PRM(Parallel Reaction Monitoring):基于高分辨率質(zhì)譜(如Orbitrap),,對目標前體離子所有碎片進行并行掃描,提高特異性與數(shù)據(jù)再利用能力,;

3、SWATH-MS(Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ions):一種數(shù)據(jù)非依賴采集(DIA)策略,,通過滑動窗口采集全范圍碎片信息,,后期可實現(xiàn)類靶向定量分析。


值得注意的是,,SWATH技術雖然具備靶向分析能力,,但其本質(zhì)屬于DIA技術范疇,實際應用中常用于靶標初篩與中通量定量,。


靶向蛋白質(zhì)組學概述:技術,、關鍵點及應用


二、靶向蛋白質(zhì)組學的技術關鍵點

1,、肽段選擇策略


  • wéiyī性(只來自目標蛋白)

  • 良好的離子化效率

  • 穩(wěn)定,、不含修飾或易降解位點


2、內(nèi)標引入與定量方法


  • 相對定量:基于肽段峰面積比較

  • juéduì定量:加入穩(wěn)定同位素標記肽(SIS)校正系統(tǒng)誤差


3,、標準化實驗流程


  • 樣本處理(提取,、酶解、凈化)

  • 儀器參數(shù)優(yōu)化(碰撞能,、保留時間窗口)

  • 軟件分析(Skyline,、Spectronaut 等)


三、靶向蛋白質(zhì)組學的優(yōu)勢與局限

1,、優(yōu)勢


靶向蛋白質(zhì)組學概述:技術,、關鍵點及應用


2,、局限性

* 需要先驗信息,無法用于未知蛋白發(fā)現(xiàn)


  • 方法開發(fā)仍需優(yōu)化過程,,尤其MRM的轉(zhuǎn)移選擇


四,、靶向蛋白質(zhì)組學的典型應用場景

1、疾病生物標志物驗證


  • 癌癥早篩:如乳腺癌中PRM驗證候選蛋白

  • 自身免疫病標志物評估

  • 心血管病高風險人群分型


2,、藥物靶點與療效評估


  • 監(jiān)測藥物對信號通路關鍵蛋白的表達調(diào)控

  • 多時間點PRM監(jiān)控治療動態(tài)變化


3,、液體活檢與復雜樣本分析


  • 靶向蛋白組學適合血漿、尿液,、腦脊液等

  • 可識別極低豐度的腫瘤來源蛋白


4,、合成生物與細胞工廠監(jiān)測


  • jīngzhǔn定量代謝通路關鍵酶

  • 輔助微生物蛋白表達調(diào)控與優(yōu)化


五、百泰派克生物科技的靶向蛋白組服務特色

百泰派克生物科技構建了涵蓋 MRM,、PRM 及 DIA/SWATH 技術的完整服務平臺,,滿足科研及轉(zhuǎn)化研究的多樣化需求:


  • 多平臺支持:Agilent 6495、SCIEX QTRAP 三重四極桿平臺,;Orbitrap Exploris 高分辨PRM平臺,;支持SWATH數(shù)據(jù)采集與譜庫構建;

  • 方法開發(fā)靈活:提供靶點篩選,、SIS肽設計與定制等個性化服務,;

  • 標準化流程控制:從樣本處理到數(shù)據(jù)分析全流程質(zhì)量管理;

  • 支持DIA與靶向聯(lián)合分析:助力候選蛋白從發(fā)現(xiàn)到驗證的閉環(huán)研究,。


靶向蛋白質(zhì)組學作為蛋白定量分析的重要工具,,正在成為連接基礎研究與轉(zhuǎn)化應用的橋梁。通過合理選擇MRM,、PRM或SWATH策略,,科研人員可根據(jù)研究目標實現(xiàn)對關鍵蛋白的靈敏、穩(wěn)定,、可重復的定量檢測,。百泰派克生物科技致力于為研究者提供高質(zhì)量、高可信度的靶向蛋白質(zhì)組學服務,,推動疾病機制研究,、生物標志物驗證與生物藥研發(fā)的深入發(fā)展。


百泰派克生物科技特色項目


一,、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對蛋白質(zhì)序列進行分析,,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析,,N端測序,,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質(zhì),,提供基于從頭測序法的蛋白質(zhì)從頭測序服務,,對蛋白序列進行分析。


※服務優(yōu)勢:

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液,、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響,。



二,、蛋白質(zhì)組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量蛋白質(zhì)組學,、靶向蛋白質(zhì)組學,、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質(zhì)組學分析服務,。此外,,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學服務,助力微量樣本蛋白組學,、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作,。


※服務優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標記方法,,適用于分析組織,、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,,實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確,。



三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析,,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量,。


※服務優(yōu)勢:

1.技術先進,填補技術空白

采用金屬標記抗體技術,,避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題,。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白,。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,,而流式質(zhì)譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq,。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景,;

②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向,。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾,;

③可檢測細胞存活率,、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量,、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的,、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量,。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,,深入挖掘未知的靶標。



五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術,,MALDI TOF,高效色譜分離技術,,提供一系列完善的生物藥物分析方案,,從蛋白質(zhì)、多肽,、抗體,、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務,,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

靶向蛋白質(zhì)組學概述:技術,、關鍵點及應用




百泰派克生物科技-生物制品表征,,生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,,支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行,。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務;

2.獲國家CNAS實驗室認可,,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務,;

3.業(yè)務范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學、多肽組學,、代謝組學,、生物藥物表征、單細胞分析,、單細胞質(zhì)譜流式,、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,,滿足您一站式服務需求,;

5.服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇,;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!



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