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PT0101-20T-LabpO TOPO-TA/Blunt克隆試劑盒
  • PT0101-20T-LabpO TOPO-TA/Blunt克隆試劑盒

貨物所在地:北京北京市

地: 北京

更新時間:2024-12-25 21:00:08

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本制品和傳統(tǒng)的T4連接酶原理不同,,它利用了Topoisomerase可以在瞬間,、高效(接近100%)連接DNA片段的原理采用本公司du創(chuàng)的工藝制成。

產(chǎn)品貨號PT0101

儲存溫度:-20℃儲存,,至少12個月,。冰袋運輸,1-2 天置于室外常溫不影響質(zhì)量,。


試劑盒組成

20次

80次

TOPO-TA/Blunt Vector(30ng/ul)

40ul

160ul

1000bp Control(30ng/ul

5ul

5ul

10 Enhancer

20ul

80ul







產(chǎn)品介紹

本制品和傳統(tǒng)的T4連接酶原理不同,,它利用了Topoisomerase可以在瞬間(幾秒鐘-幾min)、高效(接近100%)連接DNA片段的原理采用本公司du創(chuàng)的工藝制成,。

1)可以在瞬間(幾秒鐘-幾min)完成任意PCR產(chǎn)物(兼容A末端/平末端)連接,。

2)特制的新型載體質(zhì)粒大小僅僅不到2kb,充分發(fā)揮了TOPO載體越小,,可容納片段越大的優(yōu)勢,,最大限度提高了大片段連接效率;連接后質(zhì)粒大小比傳統(tǒng)載體小2kb以上,,質(zhì)粒越小,,轉(zhuǎn)化效率越高,極大的提高了各種片段連接后的轉(zhuǎn)化子數(shù)量,。

3)采用氨芐抗性載體只需10min復蘇時間,,比卡那抗性載體1小時復蘇時間縮短6倍。

4)最快可以不用冰浴和熱休克,,室溫5min內(nèi)完成轉(zhuǎn)化,;無需1小時復蘇,只需37℃10 min復蘇便可以涂板。從連接到涂板最快只需15-20min,。

5)zi殺基因零背景原理,,無自連假陽性,無需繁瑣藍白斑篩選和菌落PCR篩選,。大部分情況下隨機挑一個克隆便是有插入的(接近100%),。

6)連接長片段能力遠超傳統(tǒng)TA/Blunt克隆載體,可連接長達10kb片段(例如連接5kb片段,,也可能達到挑10個菌落,,至少8個是有插入的效果),是新一代shi界領xian的簡單,、快速,、零背景免篩選的TOPO TA/Blunt克隆載體。

注意:測序只能采用M13F/M13R通用引物測序(見后面圖譜),,但是不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物測序,。菌落 PCR 可使用和測序相同的引物。

操作步驟

1.連接反應的準備:

PCR引物使用正常設計的引物即可,,不需做任何改變(不能用磷酸化引物),。任意PCR產(chǎn)物(兼容A末端/平末端)均可以直接連接。PCR產(chǎn)物一般建議膠回收純化,,這樣可以避免后續(xù)可能的問題,。如果PCR產(chǎn)物僅有目的條帶、無非特異條帶和引物二聚體,,也可嘗試直接進行連接反應,。如果是以質(zhì)粒為模板的PCR產(chǎn)物則最好進行純化,因為模板質(zhì)粒也可能長出菌落(但不是想構(gòu)建的目的載體),。

2.連接反應:

1室溫(25℃-37℃)設立10ul連接體系(建議用0.2ml PCR 管,,PCR儀器控溫):

純化后的PCR產(chǎn)物或1ul 1000bp control

0.5-5ul

TOPO-TA/Blunt Vector

2ul

10 x Enhancer

1ul

無菌水

Xul

總體積

10ul

加完試劑后,用移液器輕輕吹打混勻或者輕彈管底混勻,,低速瞬時離心收集所有液體在離心管底,,注意此步驟不能在冰上進行,只能在室溫(25℃-37℃)進行,。

注:如果使用5ul體系連接,,各成分按照比例減半使用,使用次數(shù)可以加倍,。不同大小插入片段的推薦用量(注意過量太多了,,反而導致轉(zhuǎn)化子減少)

插入片段大小(bp)

推薦用量(ng)

100-1000

10-40

1000-2000

40-80

2000-5000

80-180

2室溫(25℃-37℃)連接5min,。

本載體推薦室溫(25℃-37℃)5min完成連接,。長片段或者連接困難片段可以延長連接時間到10-15min,,溫度可選37℃,可顯著增加轉(zhuǎn)化子數(shù)量,。


3連接產(chǎn)物置于冰上備用,。立即接標準的感受態(tài)轉(zhuǎn)化步驟或者快速轉(zhuǎn)化步驟。

3.快速轉(zhuǎn)化:

1感受態(tài)細胞從-80℃拿出,,迅速插入冰浴中,,解凍融化(約1-3min左右)。

2立刻加入5ul連接液(最多可全部加入,,只要體積不超過感受態(tài)細胞體積的1/10),, 用手撥da離心管底輕輕混勻(避免用槍吸打),冰浴放置5min,。

342℃水浴熱激60秒,,迅速放回冰浴靜置2-3min,該過程不要搖動離心管,。

注意:此步驟shou選建議 42℃水浴 60 秒熱激。但是根據(jù)我們的經(jīng)驗,,大部分商品化的TOP 10 和 DH5a 感受態(tài)細胞此步驟也可將離心管置于室溫(?22℃)進行,, 時間不需十分準確,夏季或室溫較高時,,可放置 5-8min左右,;如果室溫較低,可延長時間至8-15min左右,。有經(jīng)驗的客戶可以根據(jù)具體情況嘗試無熱激轉(zhuǎn)化,。

4) 300-500ul LB或者SOC培養(yǎng)基(不含抗生素),37℃ 200 rpm 振蕩培養(yǎng)10min,。

根據(jù)經(jīng)驗,,一般可以直接將培養(yǎng)基(如從冰箱取出溫度低,應事先置37℃溫箱回溫至22℃-37℃)加入到感受態(tài)細胞的1.5 ml 離心管,,蓋上離心管蓋,,水平固定在振蕩培養(yǎng)箱中振蕩培養(yǎng)復蘇即可,不需要轉(zhuǎn)移到試管培養(yǎng)復蘇,。

一般商品化的感受態(tài)細胞不超過 2kb 插入片段情況下,,熱休克后 10-15 min復蘇可以得到足夠多轉(zhuǎn)化子,如果使用實驗室自制的感受態(tài)效率低,、或者轉(zhuǎn)化子少,、插入片段長的情況下可以提高復蘇時間到 30-60 min以得到更多的轉(zhuǎn)化子。

5)100-200ul菌液涂板(培養(yǎng)板含氨芐qing霉素100ug/ml),,培養(yǎng)過夜,。(如果預計轉(zhuǎn)化子少,,為得到較多克隆,4000rpm 離心1min,,吸棄掉部分上清,,保留100-150ul,輕彈懸浮菌體,,取全部菌液涂板)

4.轉(zhuǎn)化子的篩選鑒定:

本制品采用zi殺基因零背景原理,,無插入自連的細菌會zi殺無法生長,因此幾乎沒有假陽性,,一般情況下,,可以達到所見即所得,只要是長出來的菌落正常(不是污染的雜菌,,轉(zhuǎn)化子數(shù)量也不算太少),,基本就包含插入。因此插入片段不超過 2-3kb 的情況下可以不用菌落PCR 鑒定,直接挑 1-2 個菌去測序,。


1)一般本公司TOPO 載體陽性率非常高,,所以菌落生長正常,數(shù)量也不是太少的情況下建議省略菌落 PCR/菌液 PCR 鑒定直接去測序,。注意測序引物不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物測序,。

2) TOPO 載體的菌落 PCR 結(jié)果容易出現(xiàn)假陰性。因此在使用菌落 PCR 鑒定的情況下,,如菌落 PCR 結(jié)果陽性,,一般可以相信此結(jié)果。如結(jié)果是陰性,,或者顯示擴增出大小和預期不符合,,一般不可相信,要考慮到菌落 PCR 結(jié)果假陰性的可能,。需要進一步提取質(zhì)粒電泳跑大小,,或者酶切鑒定來確認。


用上述培養(yǎng)的白色菌落的菌液抽提質(zhì)粒,,插入片段較大的情況下,,直接跑電泳看質(zhì)粒大小就直接能鑒定出有插入的質(zhì)粒,還可用 EcoR I/Ecor V 單酶切釋放插入片段或用其它合適的酶切,,瓊脂糖凝膠電泳檢查片段大小,,確定是否含有目的片段。


pTOPO-TA/Blunt 載體圖譜:

pTOPO-TA/Blunt 載體多克隆位點序列:





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