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DYKDDDDK-Nanoab-Agarose

貨號(hào)：FNA-25-500   FNA-50-1000

保存條件：4℃一年,；-80℃長(zhǎng)期保存,，避免反復(fù)凍融

產(chǎn)品描述：

偶聯(lián)anti-DYKDDDDK-tag納米抗體的瓊脂糖珠子用于免疫沉淀DYKDDDDK-tag (DYKDDDDK)融合蛋白,。

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)：

沒(méi)有普通抗體的輕鏈和重鏈,；

即用型,，節(jié)約時(shí)間,；

高親和力,，高載量;

應(yīng)用范圍：

可用于免疫沉淀（IP）/免疫共沉淀（CoIP）、染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）/RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀（RIP）,、酶活性測(cè)定,、質(zhì)譜分析等,；

特異性

特異性結(jié)合DYKDDDDK-tag。

產(chǎn)品特性：

存儲(chǔ)緩沖液：PBS(含有20%乙醇),。

保存條件：可在4℃保存1年(確保wan全密封),，或在-80℃長(zhǎng)期保存，避免反復(fù)凍融,。

實(shí)驗(yàn)步驟：

收集細(xì)胞
每個(gè)免疫沉淀反應(yīng)大約使用 106-107 個(gè)表達(dá)DYKDDDDK-tag融合蛋白的細(xì)胞,，可根據(jù)DYKDDDDK-tag融合蛋白表達(dá)量適當(dāng)調(diào)整細(xì)胞數(shù)。吸出培養(yǎng)基,，向培養(yǎng)皿中加入預(yù)冷的1×PBS,，漂洗2次，利用細(xì)胞刮或yi酶消化收集貼壁細(xì)胞,，細(xì)胞轉(zhuǎn)移到離心管,，500g離心3min并丟棄上清液。

植物組織裂解處理：

取適量植物組織樣本（葉片等）放置于冷凍液氮中,，之后將冷凍后得植物組織樣本放于研缽進(jìn)行研磨,，盡可能充分研磨破壞其細(xì)胞壁。加入500-1000ul RIPA 裂解液（已加蛋白酶抑制劑 PMSF 等）進(jìn)行裂解,，為了提高裂解效率,，加入 200ul 玻璃粉充分震蕩 30min，裂解完成后 12000 rpm,，離心 30min,，吸取上清 置新的離心管中，棄去沉淀,。

細(xì)胞裂解
1．在裂解緩沖液中加入蛋白酶抑制劑,，用500μl預(yù)冷的裂解緩沖液重懸細(xì)胞。

2．置于冰上30分鐘,，可每10分鐘充分吹打一次,。
3．4℃，20,000g離心15分鐘,，將裂解產(chǎn)物（上清）轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的預(yù)冷管中，丟棄沉淀,。

注意：此時(shí)細(xì)胞裂解產(chǎn)物可長(zhǎng)期保存于-80℃,。

結(jié)合蛋白
4．將20μl平衡好的DYKDDDDK -Nanoab-Agarose加入到細(xì)胞裂解產(chǎn)物中（可在細(xì)胞裂解產(chǎn)物中直接加入20μl該產(chǎn)品），于4℃旋轉(zhuǎn)混合結(jié)合1小時(shí),。根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要可調(diào)整結(jié)合時(shí)間,。如果需要，留存50μl的裂解產(chǎn)物進(jìn)行免疫印跡分析,。

5．4℃,，2,500g離心30秒,，丟棄上清液。如果需要,，留存50μl上清液進(jìn)行免疫印跡分析,。

清洗珠子
6．用500μl預(yù)冷的裂解緩沖液中重懸5中的DYKDDDDK -Nanoab-Agarose，4℃,，2,500g條件下離心30秒,，丟棄上清液并重復(fù)洗滌3次。盡量減少清洗時(shí)間,。

洗脫蛋白
方法一：
7. 加入20μl 2×SDS-sample buffer重懸DYKDDDDK -Nanoab-Agarose,。95℃，加熱10min充分變性,，2,500g離心30秒收集上清,，收集的產(chǎn)物可進(jìn)行SDS-PAGE及免疫印跡分析。
方法二：
8. 替代步驟7的可選步驟：加入50μl 0.2M pH2.5的gan氨酸洗脫結(jié)合的蛋白,，孵育時(shí)間30秒,，期間不斷混勻，2,500g離心30秒收集上清,，立即加入5μl 1.0M Tris（pH10.4）以中和酸性的gan氨酸,。如果洗脫的蛋白含量少，可嘗試用2×DYKDDDDK-tag進(jìn)行親和純化,。

注意：為了提高洗脫效率可以重復(fù)這一步,。

可選方案：
方案一：
如需進(jìn)行DYKDDDDK融合酶的活性檢測(cè)，無(wú)需洗脫,，可以直接檢測(cè),。
方案二：
如需進(jìn)行染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）實(shí)驗(yàn)，主要用于含有DYKDDDDK融合蛋白的蛋白質(zhì)/DNA相互作用的實(shí)驗(yàn),。染色質(zhì)免疫沉淀一般包括細(xì)胞固定,，染色質(zhì)斷裂，染色質(zhì)免疫沉淀,，聯(lián)反應(yīng)的逆轉(zhuǎn),，DNA的純化以及DNA的鑒定。其中前期細(xì)胞固定,，染色質(zhì)斷裂不變,；然后接著直接進(jìn)入說(shuō)明書的第4步，加入細(xì)胞裂解產(chǎn)物后,，DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物結(jié)合到DYKDDDDK -Nanoab-Agarose上,；
進(jìn)入第5和6步，分離得到復(fù)合物,；進(jìn)入第8步,，得到洗脫的復(fù)合物,；后期交聯(lián)反應(yīng)的逆轉(zhuǎn)，DNA的純化及DNA的鑒定等同于普通的ChIP實(shí)驗(yàn),。RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀（RIP）實(shí)驗(yàn)步驟同上,。
方案三：
DYKDDDDK-Nanoab-Agarose 不僅可以用于在體內(nèi)外檢測(cè)和驗(yàn)證蛋白質(zhì)之間的相互作用，也可以結(jié)合質(zhì)譜分析篩選與已知蛋白相互作用的未知蛋白,。其操作步驟同免疫沉淀法,，得到洗脫的復(fù)合物后，然后進(jìn)行SDS–PAGE分析,，用考馬斯亮藍(lán)或者銀染的方法染色后,，切下未知蛋白的條帶，用質(zhì)譜技術(shù)鑒定未知蛋白,。