1.基線設(shè)置?:實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)的基線是指在PCR的初始循環(huán)期間的信號(hào)水平,,通常是3至15個(gè)循環(huán)之間,此時(shí)熒光信號(hào)幾乎沒(méi)有變化,,可以認(rèn)為是背景或反應(yīng)的噪音,。
2. ?閾值設(shè)定?:?qPCR的閾值代表的是明顯超出基線的擴(kuò)增信號(hào)水平,用以區(qū)分明確的擴(kuò)增信號(hào)和背景,。通常qPCR儀器自帶軟件會(huì)自動(dòng)將閾值設(shè)置為基線熒光值標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍,。
3. ?CT值計(jì)算?:Ct是指熒光信號(hào)超過(guò)閾值時(shí)對(duì)應(yīng)的循環(huán)數(shù),Ct值與目的基因的起始量成反比,,可用于計(jì)算DNA初始拷貝數(shù),。
4. ?擴(kuò)增曲線分析?:擴(kuò)增曲線有兩種展現(xiàn)形式,一種是線性,,一種是對(duì)數(shù)形式,。通常用CT來(lái)推算樣品中樣品的濃度,,CT值越高說(shuō)明模板濃度越低。
5. ?標(biāo)準(zhǔn)曲線?:將已知濃度的樣品(標(biāo)準(zhǔn)品)經(jīng)過(guò)梯度稀釋后分別取樣進(jìn)行熒光定量PCR,,得到的一系列Ct值與Log模板數(shù)對(duì)應(yīng)可以得到一個(gè)相關(guān)的曲線,,即標(biāo)準(zhǔn)曲線。這個(gè)標(biāo)準(zhǔn)曲線可以用來(lái)判斷熒光定量PCR體系的優(yōu)劣,。
6. ?熔解曲線分析?:PCR產(chǎn)物進(jìn)行逐步升溫監(jiān)測(cè),,可以看到在達(dá)到其解鏈溫度時(shí),熒光信號(hào)會(huì)有一個(gè)忽然的下降,。理論上如果PCR得到特異性產(chǎn)物則只有一個(gè)Tm值,,在溶解曲線上表示只有單峰存在。如果是多相峰,,可以判斷產(chǎn)物不是單一的,,發(fā)生了非特異擴(kuò)增。
1. ?第一代PCR技術(shù)?:采用瓊脂糖電泳的方式對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行分析,,通過(guò)電泳判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的大小,用于臨床檢測(cè),。
2. ?第二代PCR技術(shù)?:熒光定量PCR(qPCR),,通過(guò)設(shè)置基線、閾值和CT值進(jìn)行定量分析,,適用于需要精確測(cè)量DNA或RNA含量的實(shí)驗(yàn),。
3. ?第三代PCR技術(shù)?:以微滴化處理步驟為主要特征,提高了檢測(cè)的靈敏度和特異性,,適用于更復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)需求,。
三、具體實(shí)驗(yàn)操作步驟
1. ?樣品處理?:將樣品進(jìn)行稀釋和離心處理,,確保DNAwanquan裂解和分離,。
2. ?PCR反應(yīng)?:按照試劑盒說(shuō)明書(shū)操作,將反應(yīng)管與凍干成分一起離心,,添加緩沖液和引物/探針/核苷酸混合物,,進(jìn)行PCR反應(yīng)。
3. ?結(jié)果分析?:通過(guò)基線,、閾值,、CT值和擴(kuò)增曲線等參數(shù)分析PCR結(jié)果,比較實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的差異,,確定基因表達(dá)的變化,。
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