簡介
獲得高質量和完整的 RNA 是很多分子生物學實驗中最重要的一步,,當前應用最多的是 Trizol/氯仿萃取的方法。
原理
1,、4℃ 預冷離心機;
2,、取出培養(yǎng)皿,在超凈臺中去除培養(yǎng)基,,按照每 1x107 細胞加入 1mL Trizol 試劑,,用槍頭吹打充分裂解細胞;
3,、將細胞裂解液轉移到 1.5 mL 無 RNA 酶的 EP 管中,向每個 EP 管中加入(1/5 Trizol 體積的)200 μL 氯仿,,上下翻轉充分混合后,,室溫靜置 10 分鐘,使核酸蛋白復合物wan全解離;
4,、在 4℃ 下 12000 g 離心 15 分鐘;
5,、離心后,將上層水相(約 1/2 Trizol體積)小心轉移到一個新的 EP 管,,加入等體積異丙醇,,震蕩后室溫靜置 5-10 分鐘,然后 12000 g 4℃ 離心 15 分鐘,,棄上清保留沉淀;
6,、加入1 mL 75% 乙醇清洗并沉淀 RNA,,12000 g 離心 10 分鐘;
7,、棄上清,并重復上述操作一次;
8,、棄上清,,在超凈工作臺中打開 EP 管蓋,風干 5-10 分鐘,,不需wan全干燥;
9,、視沉淀的量,加入 10-30 μL RNase-Free 的 DEPC 雙蒸水中;
10,、待沉淀溶解后,,用 nanodrop 測定其濃度和純度并作標記,進行下游實驗,,多余的RNA 保存于 -80℃ 冰箱,。
用途
RT-PCR、分子克隆,、Northern-Blot,、RNA 體外轉錄與翻譯等。
材料與儀器
【材料】:細胞,;Trizol 試劑,;氯仿;異丙醇,;75% 乙醇(使用 RNase-Free 水配制),;RNase-Free 水。
【物品及儀器】:1.5 ml EP管(RNA-free),,大,,中,,小號槍頭(RNA-free),移液器,,渦旋振蕩器,,高速冷凍離心機,超凈工作臺,。
步驟
1,、4℃ 預冷離心機;
2、取出培養(yǎng)皿,,在超凈臺中去除培養(yǎng)基,,按照每 1x107 細胞加入 1mL Trizol 試劑,用槍頭吹打充分裂解細胞;
3,、將細胞裂解液轉移到 1.5 mL 無 RNA 酶的 EP 管中,,向每個 EP 管中加入(1/5 Trizol 體積的)200 μL 氯仿,上下翻轉充分混合后,,室溫靜置 10 分鐘,,使核酸蛋白復合物wan全解離;
4、在 4℃ 下 12000 g 離心 15 分鐘;
5,、離心后,,將上層水相(約 1/2 Trizol體積)小心轉移到一個新的 EP 管,加入等體積異丙醇,,震蕩后室溫靜置 5-10 分鐘,,然后 12000 g 4℃ 離心 15 分鐘,棄上清保留沉淀;
6,、加入1 mL 75% 乙醇清洗并沉淀 RNA,,12000 g 離心 10 分鐘;
7、棄上清,,并重復上述操作一次;
8,、棄上清,在超凈工作臺中打開 EP 管蓋,,風干 5-10 分鐘,,不需wan全干燥;
9、視沉淀的量,,加入 10-30 μL RNase-Free 的 DEPC 雙蒸水中;
10,、待沉淀溶解后,用 nanodrop 測定其濃度和純度并作標記,,進行下游實驗,,多余的RNA 保存于 -80℃ 冰箱。
注意事項
1、過程中需佩戴口罩和新手套,,對臺面以及周圍環(huán)境進行滅酶處理,,盡量在超凈臺中進行操作,;
2,、使用無 Rnase 的塑料制品和槍頭,,避免交叉污染,。
3、溶液配制應使用無 Rnase 的水,,(將水加入到干凈的玻璃瓶中,,加入 DEPC 至終濃度為 0.1%(V/V),,放置過夜,,高壓滅菌,。注:DEPC 有致癌之嫌,須小心操作),。
4,、Trizol 裂解液非常危險,因小心避免濺到身上,,臺面上的 Trizol 要及時清理干凈,。
常見問題
RNA 得率過低:
1.使用更有效的破碎/勻漿方法。如液氮搗碎,、酶消化破壁,、電動勻漿器勻漿;
2.更換抽提試劑,;
3.核酸濃度低時,采用低溫沉淀,,并延長沉淀時間,;
4.增加細胞。
RNA 質量不高:
1,、取上層水相時求多,,吸到了下層有機相;
2,、清洗不干凈,。
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