簡(jiǎn)介
獲得高質(zhì)量和完整的 RNA 是很多分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中最重要的一步,當(dāng)前應(yīng)用最多的是 Trizol/氯仿萃取的方法,。
原理
1、4℃ 預(yù)冷離心機(jī);
2,、取出培養(yǎng)皿,,在超凈臺(tái)中去除培養(yǎng)基,按照每 1x107 細(xì)胞加入 1mL Trizol 試劑,,用槍頭吹打充分裂解細(xì)胞;
3,、將細(xì)胞裂解液轉(zhuǎn)移到 1.5 mL 無(wú) RNA 酶的 EP 管中,向每個(gè) EP 管中加入(1/5 Trizol 體積的)200 μL 氯仿,,上下翻轉(zhuǎn)充分混合后,,室溫靜置 10 分鐘,使核酸蛋白復(fù)合物wan全解離;
4,、在 4℃ 下 12000 g 離心 15 分鐘;
5,、離心后,將上層水相(約 1/2 Trizol體積)小心轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的 EP 管,,加入等體積異丙醇,,震蕩后室溫靜置 5-10 分鐘,然后 12000 g 4℃ 離心 15 分鐘,棄上清保留沉淀;
6,、加入1 mL 75% 乙醇清洗并沉淀 RNA,,12000 g 離心 10 分鐘;
7、棄上清,,并重復(fù)上述操作一次;
8,、棄上清,在超凈工作臺(tái)中打開 EP 管蓋,,風(fēng)干 5-10 分鐘,,不需wan全干燥;
9、視沉淀的量,,加入 10-30 μL RNase-Free 的 DEPC 雙蒸水中;
10,、待沉淀溶解后,用 nanodrop 測(cè)定其濃度和純度并作標(biāo)記,,進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn),,多余的RNA 保存于 -80℃ 冰箱。
用途
RT-PCR,、分子克隆,、Northern-Blot、RNA 體外轉(zhuǎn)錄與翻譯等,。
材料與儀器
【材料】:細(xì)胞,;Trizol 試劑;氯仿,;異丙醇,;75% 乙醇(使用 RNase-Free 水配制);RNase-Free 水,。
【物品及儀器】:1.5 ml EP管(RNA-free),,大,中,,小號(hào)槍頭(RNA-free),,移液器,渦旋振蕩器,,高速冷凍離心機(jī),,超凈工作臺(tái)。
步驟
1,、4℃ 預(yù)冷離心機(jī);
2,、取出培養(yǎng)皿,在超凈臺(tái)中去除培養(yǎng)基,,按照每 1x107 細(xì)胞加入 1mL Trizol 試劑,,用槍頭吹打充分裂解細(xì)胞;
3、將細(xì)胞裂解液轉(zhuǎn)移到 1.5 mL 無(wú) RNA 酶的 EP 管中,向每個(gè) EP 管中加入(1/5 Trizol 體積的)200 μL 氯仿,,上下翻轉(zhuǎn)充分混合后,,室溫靜置 10 分鐘,使核酸蛋白復(fù)合物wan全解離;
4,、在 4℃ 下 12000 g 離心 15 分鐘;
5,、離心后,將上層水相(約 1/2 Trizol體積)小心轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的 EP 管,,加入等體積異丙醇,,震蕩后室溫靜置 5-10 分鐘,然后 12000 g 4℃ 離心 15 分鐘,,棄上清保留沉淀;
6,、加入1 mL 75% 乙醇清洗并沉淀 RNA,12000 g 離心 10 分鐘;
7,、棄上清,,并重復(fù)上述操作一次;
8、棄上清,,在超凈工作臺(tái)中打開 EP 管蓋,,風(fēng)干 5-10 分鐘,不需wan全干燥;
9,、視沉淀的量,,加入 10-30 μL RNase-Free 的 DEPC 雙蒸水中;
10、待沉淀溶解后,,用 nanodrop 測(cè)定其濃度和純度并作標(biāo)記,,進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn),多余的RNA 保存于 -80℃ 冰箱,。
注意事項(xiàng)
1,、過程中需佩戴口罩和新手套,對(duì)臺(tái)面以及周圍環(huán)境進(jìn)行滅酶處理,,盡量在超凈臺(tái)中進(jìn)行操作;
2,、使用無(wú) Rnase 的塑料制品和槍頭,,避免交叉污染。
3,、溶液配制應(yīng)使用無(wú) Rnase 的水,,(將水加入到干凈的玻璃瓶中,加入 DEPC 至終濃度為 0.1%(V/V),,放置過夜,,高壓滅菌。注:DEPC 有致癌之嫌,須小心操作),。
4,、Trizol 裂解液非常危險(xiǎn),因小心避免濺到身上,,臺(tái)面上的 Trizol 要及時(shí)清理干凈,。
常見問題
RNA 得率過低:
1.使用更有效的破碎/勻漿方法。如液氮搗碎,、酶消化破壁,、電動(dòng)勻漿器勻漿;
2.更換抽提試劑,;
3.核酸濃度低時(shí),,采用低溫沉淀,并延長(zhǎng)沉淀時(shí)間,;
4.增加細(xì)胞,。
RNA 質(zhì)量不高:
1、取上層水相時(shí)求多,,吸到了下層有機(jī)相,;
2、清洗不干凈,。
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