原理
Trizol 是一種新型總 RNA 抽提試劑,采用變性劑即內(nèi)含異硫氰酸胍酚和 β-巰基乙醇等變性物質(zhì),,能迅速破碎細(xì)胞,,抑制細(xì)胞釋放出的核酸酶。異硫氰酸胍屬于解偶劑,,是一類強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑,,可溶解蛋白質(zhì),并使蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)消失,,細(xì)胞結(jié)構(gòu)降解,,核蛋白迅速與核酸分離。β-巰基乙醇主要破壞 RNase 蛋白質(zhì)中的二硫鍵,。細(xì)胞裂解后,,細(xì)胞釋放出蛋白質(zhì)、DNA,、RNA 等物質(zhì),,再根據(jù)它們在不同的 PH 值和不同極性溶劑的溶解度不同而使得分開。
材料與儀器
儀器:細(xì)胞樣品,、TRIzol 試劑、氯仿,、異丙醇,、75% 乙醇、DEPC,、H2O
材料:離心管,、離心機(jī)、EP 管,、勻漿器,、移液管、冰袋,、漩渦振蕩器
步驟
1. 樣品處理:
(1) 培養(yǎng)細(xì)胞:收獲細(xì)胞 1~5 × 107,,移入 1.5 mL 離心管中,加入 1 mL Trizol,混勻,,室溫靜置 5 min,。
(2) 組織:取 50~100 mg 組織(新鮮或 -70 ℃ 及液氮中保存的組織均可)置 1.5 mL 離心管中,加入 1 mL Trizol 充分勻漿,,室溫靜置 5 min,。
2. 加入 0.2 mL 氯仿,振蕩 15 s,,靜置 2 min,。
3. 4 ℃ 離心,12000 g × 15 min,,取上清,。
4. 加入 0.5 mL 異丙醇,將管中液體輕輕混勻,,室溫靜置 10 min,。
5. 4 ℃ 離心,12000 g × 10 min,,棄上清,。
6. 加入 1 mL 75% 乙醇,輕輕洗滌沉淀,。4 ℃,,7500 g × 5 min,棄上清,。
7. 晾干,,加入適量的 DEPC H2O 溶解(65 ℃ 促溶 10~15 min)
注意事項(xiàng)
1. 樣品量和 Trizol 的加入量一定要按步驟(1)的比例,不能隨意增加樣品量或減少 Trizol 量,,否則會(huì)使內(nèi)源性 RNase 的抑制不wan全,,導(dǎo)致 RNA 降解。
2. 實(shí)驗(yàn)過程必須嚴(yán)格防止 RNsae 的污染,。
常見問題
1. RNA 的定量計(jì)算:
RNA 定量方法與 DNA 定量相似,,RNA 在 260 nm 波長處有最大的吸收峰。因此,,可以用 260 nm 波長分光測定 RNA 濃度,,OD 值為 1 相當(dāng)于大約 40 μg/mL 的單鏈 RNA。如用 1 cm 光徑,,用 ddH2O 稀釋 DNA 樣品 n 倍并以 ddH2O 為空白對(duì)照,,根據(jù)此時(shí)讀出的 OD260 值即可計(jì)算出樣品稀釋前的濃度:RNA(mg/mL) = 40 × OD260 讀數(shù) × 稀釋倍數(shù)(n) / 1000。
2. RNA 的純度:
RNA 純品的 OD260/OD280 的比值為 2.0,,故根據(jù) OD260/OD280 的比值可以估計(jì) RNA 的純度,。
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