原理
紅細(xì)胞裂解液選擇性裂解紅細(xì)胞,然后du特的裂解液/β-巰基乙醇迅速裂解白細(xì)胞和滅活細(xì)胞RNA酶,,然后用乙醇調(diào)節(jié)結(jié)合條件后,,RNA在高離序鹽狀態(tài)下選擇性吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜, 再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 去蛋白液和漂洗液將細(xì)胞代謝物,,蛋白等雜質(zhì)去除,,最后低鹽的RNase free H20將純凈RNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。
材料與儀器
鮮血液
抗凝劑 紅細(xì)胞裂解液RLB 去蛋白液RW1 乙醇 漂洗液RW
制冰機(jī) 離心機(jī) 離心管 移液槍 移液管 針頭 注射器 水浴鍋
步驟
一,、在適合大小的RNase free離心管中加入1體積(<1.5 ml)加入各種抗凝劑新鮮血液 (顛倒混勻后)和3體積的紅細(xì)胞裂解液RLB,,顛倒混勻,可輕彈管壁,,確?;靹?。
二、室溫放置10分鐘(期間應(yīng)該顛倒輕彈混勻數(shù)次幫助裂解紅細(xì)胞),。
如果RNA降解嚴(yán)重,,可在冰上裂解,但是時(shí)間可長一些以充分裂解,。
三,、12 000 rpm離心20秒,倒棄紅色上清,,并小心的盡可能多的吸棄上清(注意不要吸到管底的細(xì)胞團(tuán)),,留下完整的管底白細(xì)胞團(tuán)。
離心后在管底應(yīng)該見到白色的白細(xì)胞團(tuán),,也可能有一些紅細(xì)胞殘片和白細(xì)胞團(tuán)在一起,,但是如果看到的是大部分的紅色細(xì)胞團(tuán),說明紅細(xì)胞裂解很不充分,,應(yīng)該再加入紅細(xì)胞裂解液重懸細(xì)胞團(tuán)后重復(fù)步驟二,、三。
上清盡可能的吸棄,,殘留過多會(huì)稀釋裂解液,,造成裂解結(jié)合異常,產(chǎn)量純度降低,。
四,、渦旋或者輕彈管壁將白細(xì)胞沉淀wan全松散重懸,加入350 ul(<0.5 ml全血)或者600 ul(0.5-1.5ml全血)裂解液RLT,,吹打混勻后用手劇烈振蕩20秒,,充分裂解。病人血樣中白細(xì)胞數(shù)量可能大幅增加,,應(yīng)該適當(dāng)減少處理量,。或者按照350 ul(<2x106白細(xì)胞)或者600 ul(2x106-1x107白細(xì)胞)比例加RTL,。
五、用帶鈍針頭的一次性 1 ml(配0.9 mm針頭) 注射器抽打裂解物 5-10 次或直到得到滿意勻漿結(jié)果(或者電動(dòng)勻漿30秒),,可以剪切DNA,,降低粘稠度和提高產(chǎn)量。
六,、較精確估計(jì)裂解物體積,,加入等體積的70%乙醇(請(qǐng)先檢查是否已加入無水乙醇!),此時(shí)可能出現(xiàn)沉淀,,但是不影響提取過程,,立即吹打混勻,,不要離心。
七,、立刻將混合物(每次小于700 ul,,多可以分兩次加入)加入一個(gè)吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13 000 rpm離心60秒,,棄掉廢液,。
八、加700 ul 去蛋白液RW1,,室溫放置30秒,,12 000rpm 離心30秒,棄掉廢液,。
如果DNA殘留明顯,,可在加入RW1后室溫放置5分鐘再離心。
九,、加入500 ul漂洗液RW(請(qǐng)先檢查是否已加入無水乙醇),,12 000 rpm 離心30秒,棄掉廢液,。加入500 ul漂洗液RW,,重復(fù)一遍。
十,、將吸附柱RA放回空收集管中,,13 000 rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液,, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng),。
十一、取出吸附柱RA,,放入一個(gè)RNase free離心管中,,根據(jù)預(yù)期RNA產(chǎn)量在吸附膜的中間部位加30-50 ul RNase freewater(事先在 70-80℃水浴中加熱效果更好), 室溫放置1分鐘,,12 000 rpm 離心1分鐘,。
十二、如果提取全血>0.5 ml或者>2x106白細(xì)胞,,加30-50 ul RNase free water重復(fù)步驟十一,,合并兩次洗脫液,或者使用第一次的洗脫液加回到吸附柱重復(fù)步驟一遍(如果需要RNA濃度高),。
洗脫兩遍的RNA洗脫液濃度高,,分兩次洗脫合并洗脫液的RNA產(chǎn)量比前者高15-30%,但是濃度要低,,用戶根據(jù)需要選擇,。
注意事項(xiàng)
1. 第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入zhi定量無水乙醇,。
2. 使用前將10X紅細(xì)胞裂解液RLB用DEPC處理水稀釋到1X。
3. 操作前在裂解液RLT中加入β-巰基乙醇至終濃度1%,,如1 ml RLT 中加入10 ul β-巰基乙醇,。此裂解液最好現(xiàn)用現(xiàn)配。配好的RLT 4℃可放置一個(gè)月,。
常見問題
1. 第一次使用前請(qǐng)先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入zhi定量無水乙醇,。
2. 使用前將10X紅細(xì)胞裂解液RLB用DEPC處理水稀釋到1X。
3. 操作前在裂解液RLT中加入β-巰基乙醇至終濃度1%,,如1 ml RLT 中加入10 ul β-巰基乙醇,。此裂解液最好現(xiàn)用現(xiàn)配。配好的RLT 4℃可放置一個(gè)月,。
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