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CsCl法從培養(yǎng)細(xì)胞中提取RNA(基本方法一)

閱讀:724      發(fā)布時間:2023-07-11
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材料與儀器

磷酸鹽緩沖溶液 硫氰酸胍溶液 CsCl TES 緩沖液 乙酸鈉緩沖液 無水乙醇 經(jīng) DEFC 處理的水,。
離心機(jī) 注射器及20W針頭

步驟

材料與設(shè)備
1) 磷酸鹽緩沖溶液 (PBS)
2) 硫氰酸胍溶液:4mol/L 硫氰酸胍,,0.lmmol/LTris-HClpH7.51%β-巰基乙醇
3)CsCl5.7mol/L(DEPC 處理)
4)TES 緩沖液:0.1%SDS,,10 mmol/LTris-ClpH7.4,,lmmol/LEDTA
5)3 mmol/L 乙酸鈉緩沖液 (PH5.2DEPC 處理)
6) 無水乙醇
7) 經(jīng) DEFC 處理的水
8) 離心機(jī)
9)6 ml 注射器及 20W 針頭
操作方法
1. 單層培養(yǎng)細(xì)胞
1) 室溫下用 PBS 洗滌細(xì)胞,,每平皿 5 ml 洗滌 2 次,。
2) 在不超過 105 個細(xì)胞中加人 3.5 ml 硫氰酸胍溶液,使之遍布整個平皿,。用橡膠細(xì)胞刮于擦刮平皿,,回收黏稠的細(xì)胞裂解液,用裝有 20-G 針頭的注射器往返抽吸裂解物,,舍并在一起
2. 懸浮培養(yǎng)細(xì)胞
1) 離心回收≤l08 個細(xì)胞,,用相當(dāng)于 1/2 原有體積的 PBS 重懸之,并再次離心回收細(xì)胞,。
2) 往離心管中加人 3.5 ml 硫氰酸胍溶液,。
3) 用裝有 20-G 針頭的 6 ml 注射器將黏稠的細(xì)胞裂解液往返抽吸 4 次,并將其移至一個干凈的試管中。本步驟的重要性在于可對染色體 DNA 進(jìn)行剪切,,以降低溶液的黏度,,
4) 在經(jīng)硅化井高壓過的 13 mmX51 mm 的超速離心管中,加人 1.5 ml 5.7mol/LCsCl 并在 CsCl 層加人 3.5 ml 細(xì)胞裂解液,,界面應(yīng)保持清晰,。1)?4) 步的操作均在室溫進(jìn)行。
5) 18℃,,150000g 離心 12?20 h(緩慢加速和減速)
6) 用巴斯德吸管的管尖在液面上吸取上清,,管子隨液面的下降而下降。當(dāng)吸至僅剩約 100 ul 時,,小心倒置管子, 倒出剩余液體在界面處應(yīng)有一白色的 DNA 帶,,必須仔細(xì)地wan全移去此帶,因為它含有染色體 DNA,。
7) 晾于沉淀約 5?lOmin,,然后以 360ul TES 溶液重溶沉淀,,反復(fù)用吸管上下抽吸,,如此在室溫逬行 5?l0 min,轉(zhuǎn)移溶液于另一干凈的微量離心管,。
8) 加人 40u 13 mol/L pH5.2 的乙酸鈉緩沖液和 1 ml 無水乙醇,,在干冰/乙醇中沉淀 30mim,離心 10?15 min, 360 ul 水重溶沉淀并重復(fù)沉淀過程,。
9) 沉淀晾干 l0 min, 溶解于 20ul 水中,,取 10ul 稀釋至 lml,測 A260 A280. 最后,,以水溶液或乙醇沉淀的形式在一 70℃ 儲存 RNA,。

注意事項

1) 要用足夠的時間去重溶沉淀,否則 RNA 的產(chǎn)量會有顯著下降,。
2) RNA CsCl 中離心時不能有效地沉淀,,因此不能用此方法制備 5SRNA tRNA 等分子。
3) 乙醇可以洗去沉淀中的氯化銫. 使沉淀易于溶解

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