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從石蠟包埋固定的組織中制備 RNA 實(shí)驗(yàn)

閱讀:620      發(fā)布時(shí)間:2023-07-07
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材料與儀器

1. 緩沖液、溶液和試劑
去離子化的甲酰胺,;焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過(guò)的水,;消化緩沖液(lmol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/Lβ-巰基乙醇,0.5%N-月桂酰肌氨酸,,20 mmol/LTris-HCl,,pH7.5)乙醇,100% 70%
,;肝糖,;異丙醇,;苯酚 (pH4.3): 氯仿(70%:30%)蛋白酶 K(60 mg/ml,,20U/mg),;Trizol(Invitrogen)二甲苯
2. 特殊設(shè)備
微量離心管,,2 ml, 無(wú) RNA
恒溫箱,,預(yù)調(diào)至 37°C
水浴或恒溫箱,預(yù)調(diào)至 55°C
3. 細(xì)胞和組織

石蠟包埋的組織樣品,,切割為 5~50 5um 厚的切片

步驟

1. 將組織塊置于 2.0 ml 微量離心管中,,向樣品中加 1.8 ml 二甲苯。37°C 溫育 20 min,。
2. 稍微地離心樣品,,移棄上清液再加入二甲苯,重復(fù)溫育和離心步驟,。
3. 0.5 ml 乙酵洗滌組織,。移棄乙醇,風(fēng)干,。
4. 80ul 蛋白酶 K(60 mg/ml,,20U/mg) 72ul 消化緩沖液。55°C 下振蕩溫育過(guò)夜,。
5. 再次加 80ul 蛋白酶 K,,55°C 下振蕩溫育過(guò)夜。次日再次加 80ul 蛋白酶 K, 再次 55°C下振蕩溫育過(guò)夜,。
6. 加等體積酚:氯仿,,混合,在微量離心機(jī)中以最大轉(zhuǎn)速離心 5 min,。將液相轉(zhuǎn)移到RNA 酶的新管中,。
7. 加等體積異丙醇和 2ug 肝糖,-20°C 放置 30 min,。
8. 在微董離心機(jī)中以最大轉(zhuǎn)速離心 30 min,。移棄上清液,用 70% 乙酵洗滌沉降物,。
9. 在微量離心機(jī)中以最大轉(zhuǎn)速離心 30 min 并移棄上清液,。風(fēng)干沉降物,將之再溶解20ulDEPC 處理過(guò)的水中,。加 500ulTrizol,。遵循 Trizol 方案(見(jiàn)本章方案 3),對(duì)一處做修改:在第一次 Trizol 處理后,將液相轉(zhuǎn)移到無(wú) RNA 酶的新管中,,用 500ulTrizol 第二次處理樣品,。
10. 向第二次 Trizol 處理過(guò)的液相加 500ul 異丙醇以沉淀 RNA
11. RNA 沉降物再溶解于 20ul 去離子甲酰胺中,。-20°C 儲(chǔ)存 RNA,。

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