材料與儀器
1. 細(xì)胞和組織
細(xì)胞/組織,凍于液氮
2. 緩沖液,、溶液和試劑
氯仿
氯化銫溶液,,5.7mol/L(5.7mol/L 氯化銫,25 mmol/L 醋酸鈉,,pH6.0,,1mmol/LEDTA,pH8.0)
用焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水
二硫蘇糖醇(DTT),0.2 mmol/L
EDTA,1mmol/L,,pH8.0
乙醇,,70%(體積分?jǐn)?shù))
異硫氰酸胍裂解緩沖液 (4mol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/L 醋酸鈉,,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)
異丙醇
N-月桂酰肌氨酸,,20%(200 g/L)
氯化鋰(LiCl),8mol/L
液氮
β-巰基乙醇,10 ml/L
苯酚, 水飽和,pH4.0
3. 離心機和轉(zhuǎn)子
BeckmanTi50 轉(zhuǎn)子或相當(dāng)?shù)霓D(zhuǎn)子
4. 特殊設(shè)備
研缽和杵,,用 DEPC 處理過的水洗滌,,預(yù)冷
超速離心管(異質(zhì)同晶共聚材料),或相當(dāng)?shù)?/span> Polygon, 或相當(dāng)?shù)母咚賱驖{器
步驟
1、使用研缽和杵在液氮下將樣品研磨成細(xì)粉,。使用 Polygon 均化器或其他合適的器具在 7 ml 胍裂解緩沖液中均質(zhì)化組織或細(xì)胞(達 1X109 個),。
2、將 4 ml5.7mol/L 的 CsCl 溶液加到超速離心管中,。
3,、將 1ml5.7mol/L 的 CsCl 溶液、120ul10mol/L 的沒-巰基乙醇和 240ulN-月桂酰肌氨酸加到裂解產(chǎn)物中,。
4,、將氯化銫/裂解產(chǎn)物混合物混合,小心使之位于離心管中的氯化銫溶液上分層,。
5,、20°C 下 180000 g 離心 21 h。
6,、移棄氯化銫上清液,,小心避免擾動管底的 RNA 沉降物。
7,、小心將 RNA 沉降物再溶解于 750ul 異硫氰酸胍裂解緩沖液中,。
8、加等體積酚,,混勻,。
9、10000g 離心 15 min,。
10,、將水相轉(zhuǎn)移到一新管中。重復(fù)水相的酚抽提,,直到界面變清,。
11、向清澈的水相加 1 倍體積氯仿,。
12,、混合,10000 g 離心 l0 min,。
13,、將水相轉(zhuǎn)移到一干凈試管中。加等體積的異丙酵和 1/10 體積 8mol/L 的氯化鋰,。10000g 離心10min,。
14、移棄上清液,。用 750ul70% 乙醇洗滌 RNA 沉降物,,10000 g 離心,。
15、移棄乙酵,,風(fēng)干沉降物,,再溶解于 50~500ul0.2 mmol/L 的 DTT 中。
16,、RNA 儲存于-70°C,。
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