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異硫氰酸胍/氯化銫超速離心法制備 RNA 實(shí)驗(yàn)

閱讀:673      發(fā)布時間:2023-07-07
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材料與儀器

1. 細(xì)胞和組織
細(xì)胞/組織,凍于液氮

2. 緩沖液,、溶液和試劑
氯仿
氯化銫溶液,5.7mol/L(5.7mol/L 氯化銫,,25 mmol/L 醋酸鈉,,pH6.01mmol/LEDTA,pH8.0)
用焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水
二硫蘇糖醇(DTT),,0.2 mmol/L
EDTA,1mmol/L,,pH8.0
乙醇,70%(體積分?jǐn)?shù))
異硫氰酸胍裂解緩沖液 (4mol/L 異硫氰酸胍,,25 mmol/L 醋酸鈉,,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)
異丙醇
N-月桂酰肌氨酸,20%200 g/L)
氯化鋰(LiCl),8mol/L
液氮
β-巰基乙醇,10 ml/L
苯酚, 水飽和,,pH4.0
3. 離心機(jī)和轉(zhuǎn)子
BeckmanTi50 轉(zhuǎn)子或相當(dāng)?shù)霓D(zhuǎn)子
4. 特殊設(shè)備
研缽和杵,,用 DEPC 處理過的水洗滌,預(yù)冷
超速離心管(異質(zhì)同晶共聚材料),,或相當(dāng)?shù)?/span> Polygon, 或相當(dāng)?shù)母咚賱驖{器

步驟

1,、使用研缽和杵在液氮下將樣品研磨成細(xì)粉。使用 Polygon 均化器或其他合適的器具在 7 ml 胍裂解緩沖液中均質(zhì)化組織或細(xì)胞(達(dá) 1X109 個)。
2,、將 4 ml5.7mol/L CsCl 溶液加到超速離心管中,。
3、將 1ml5.7mol/L CsCl 溶液,、120ul10mol/L 的沒-巰基乙醇和 240ulN-月桂酰肌氨酸加到裂解產(chǎn)物中,。
4、將氯化銫/裂解產(chǎn)物混合物混合,,小心使之位于離心管中的氯化銫溶液上分層,。
520°C 180000 g 離心 21 h,。
6,、移棄氯化銫上清液,小心避免擾動管底的 RNA 沉降物,。
7,、小心將 RNA 沉降物再溶解于 750ul 異硫氰酸胍裂解緩沖液中。
8,、加等體積酚,,混勻。
9,、10000g 離心 15 min,。
10、將水相轉(zhuǎn)移到一新管中,。重復(fù)水相的酚抽提,,直到界面變清。
11,、向清澈的水相加 1 倍體積氯仿,。
12、混合,,10000 g 離心 l0 min,。
13、將水相轉(zhuǎn)移到一干凈試管中,。加等體積的異丙酵和 1/10 體積 8mol/L 的氯化鋰,。10000g 離心10min
14,、移棄上清液,。用 750ul70% 乙醇洗滌 RNA 沉降物,10000 g 離心,。
15,、移棄乙酵,,風(fēng)干沉降物,再溶解于 50~500ul0.2 mmol/L DTT 中,。
16,、RNA 儲存于-70°C


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