RPPA靶向蛋白組學(xué)分析

靶向蛋白質(zhì)組學(xué)-反相蛋白微陣列(Reverse Phase Protein Array, RPPA)技術(shù)是一種結(jié)合平面高精度大規(guī)模樣品蛋白抗原微陣列打印和抗體檢測的高通量蛋白組學(xué)技術(shù),，該平臺引進自MD安德森個體化治療中心，具有高通量和高內(nèi)涵雙重優(yōu)勢,，可平行分析上千個樣本中幾百種關(guān)鍵癌癥蛋白的表達水平及翻譯后修飾,。

并作為The Cancer Genome Atlas (TCGA)的核心蛋白組學(xué)技術(shù)平臺,，承擔(dān)了33種癌種、超過10000例臨床樣本的數(shù)據(jù)采集與分析工作,，其相關(guān)研究成果發(fā)表在Nature,、Cell、Cancer Cell,、New England Journal of Medicine,、Nature Biotechnology等學(xué)術(shù)雜志的高水平論文多達500篇以上。

RPPA技術(shù)平臺設(shè)計嚴(yán)謹(jǐn)精密,，流程高度自動化,，質(zhì)量控制極其嚴(yán)格，每次進行樣品蛋白抗原微陣列打印,，都會將多種陽性標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系樣品與待分析樣品一起進行點陣,，確保實驗結(jié)果的高度可追溯、高度可信度與可重復(fù)性,。RPPA可在15毫克組織中（米粒大?。┮淮涡苑治龆噙_500種以上不同豐度蛋白,，且抗體反應(yīng)過程及靶點信號采集彼此獨立,，避免了不同靶標(biāo)抗體反應(yīng)之間的串?dāng)_及不同靶標(biāo)豐度差異較大帶來的信號采集無法兼容的問題，具有其它高通量蛋白組學(xué)所五可比擬的超高特異性和靈敏度,，可以對大量細(xì)胞表面受體蛋白,、細(xì)胞信號關(guān)鍵蛋白及蛋白修飾（磷酸化、乙?；?、甲基化等）、蛋白酶類,、轉(zhuǎn)錄因子等各類代表性靶標(biāo)進行分門別類的系統(tǒng)深度檢測,，也可根據(jù)需求定制所需研究的靶點蛋白進行分析，包括直接和間接的上下游蛋白網(wǎng)絡(luò)分析,。RPPA可應(yīng)用于蛋白功能與調(diào)控機理分析,、細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)全景掃描、腫瘤標(biāo)志物及蛋白分子分型,、藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)與藥物機理分析等不同領(lǐng)域,。  

一、RPPA——源自MD安德森,，TCGA的蛋白組學(xué)分析策略

二,、RPPA技術(shù)服務(wù)Panel設(shè)置

三、RPPA技術(shù)服務(wù)流程

四,、RPPA技術(shù)服務(wù)特點與優(yōu)勢

1,、樣本需求量少

20-40微克蛋白即可實現(xiàn)380靶點檢測,，能夠滿足RPPA分析的樣品范圍廣，包括臨床實體瘤手術(shù)樣品,、穿刺活檢標(biāo)本,、PDX模型樣品、體外培養(yǎng)細(xì)胞,、3D培養(yǎng)物等都廣泛適用,。

2、標(biāo)準(zhǔn)化的樣品處理和分析

蛋白及蛋白修飾位點在蛋白變性后的線性狀態(tài)下檢測,，樣本穩(wěn)定性高,，消除表位識別中潛在的問題?；贗SO15189質(zhì)量管理體系的標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)流程,，質(zhì)控嚴(yán)格，能夠高效對大樣本平行進行檢測,、數(shù)據(jù)分析與評估,。

3、靶點獨立檢測,，樣本通量高

針對一個檢測靶標(biāo),，在同一反應(yīng)微環(huán)境下平行分析100-1000個樣本，樣本通量明顯高于其他蛋白組學(xué)技術(shù)平臺,，而且獨立進行各靶點檢測反應(yīng),，萬全排除不同靶點間信號串?dāng)_問題。

4,、不同豐度靶點信號兼容性高

樣品微陣列經(jīng)過精心設(shè)計,，設(shè)立嚴(yán)格和全面的多種細(xì)胞系樣品對照，每一個樣品(包括待測樣品與對照樣品)都進行系列梯度稀釋,，靶點信號進行相對定量,，能夠兼顧不同豐度靶點信號，且能夠檢出微小信號差別及低豐度信號,，靈敏度高,。

5、兼具系統(tǒng)性與靈活性

既能對前期積累的關(guān)鍵信號通路與代表性靶標(biāo)(380種)進行分門別類的系統(tǒng)深度檢測,，也可根據(jù)需求定制所需研究的靶點蛋白進行個性化分析,，兼具系統(tǒng)性與靈活性。

6,、專業(yè)和豐富的RPPA技術(shù)服務(wù)經(jīng)驗

專業(yè)的技術(shù)服務(wù)團隊,，10年以上RPPA反相蛋白微陣列技術(shù)服務(wù)經(jīng)驗，國際儀流的實驗室條件和自動化水平,，確?？煽康膶嶒灲Y(jié)果,。可實現(xiàn)一對一的項目方案設(shè)計,，靈活性強,，充分理解實驗需求，從樣本準(zhǔn)備開始直到數(shù)據(jù)分析挖掘都由專項人員負(fù)責(zé),，充分將臨床樣本中能獲得的數(shù)據(jù)信息和臨床病人資料進行關(guān)聯(lián)分析,。

五、RPPA技術(shù)服務(wù)應(yīng)用場景

目前,，根據(jù)不同分析需求,，RPPA技術(shù)服務(wù)可以支持以下兩大模式的應(yīng)用場景。

五,、RPPA技術(shù)服務(wù)應(yīng)用場景

目前,，根據(jù)不同分析需求，RPPA技術(shù)服務(wù)可以支持以下兩大模式的應(yīng)用場景,。

萬全