支原體污染是細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中較常見(jiàn)污染之一,，保守估計(jì)常規(guī)細(xì)胞培養(yǎng)中有15–35%存在支原體污染。支原體生長(zhǎng)緩慢,，不會(huì)馬上使細(xì)胞死亡,，但會(huì)影響細(xì)胞內(nèi)的各種參數(shù)，例如部分支原體會(huì)快速消耗培養(yǎng)基中的精氨酸,，與細(xì)胞競(jìng)爭(zhēng)營(yíng)養(yǎng),，從而使細(xì)胞的生長(zhǎng)速度減慢或停止；同時(shí)支原體還可以改變細(xì)胞的酶譜,、細(xì)胞膜成分,，造成細(xì)胞染色體異常或細(xì)胞病理性改變等,。

細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中,，在顯微鏡下能看到一些小黑點(diǎn)，這些小黑點(diǎn)可以呈點(diǎn)狀,，也可以呈碎片狀,，一般在原地振動(dòng)。抗生素藥物對(duì)其均無(wú)效,，一般即可判斷為黑膠蟲(chóng),。

黑膠蟲(chóng)可寄生于動(dòng)物細(xì)胞，也可以生存于培養(yǎng)基中,，依靠細(xì)胞和培養(yǎng)基中的營(yíng)養(yǎng)為生,，并隨細(xì)胞傳代而傳代。黑膠蟲(chóng)污染常在細(xì)胞復(fù)蘇,、培養(yǎng)條件改變,、細(xì)胞接種密度低及細(xì)胞狀態(tài)不佳時(shí)出現(xiàn)，黑膠蟲(chóng)與細(xì)胞競(jìng)爭(zhēng)性生長(zhǎng),，開(kāi)始時(shí)對(duì)細(xì)胞沒(méi)有什么影響,，但當(dāng)黑膠蟲(chóng)的數(shù)量多到一定程度的時(shí)候，細(xì)胞生長(zhǎng)就會(huì)受到影響甚至死亡,，嚴(yán)重影響實(shí)驗(yàn)進(jìn)展,。

在細(xì)胞污染源中，研究人員往往忽略了來(lái)自細(xì)胞房,、培養(yǎng)箱,、水浴鍋、水盤(pán)內(nèi)的細(xì)菌及真菌等污染,。保持細(xì)胞房大環(huán)境綠色安全,，對(duì)我們獲得理想的實(shí)驗(yàn)結(jié)果也十分重要。

EB（溴化乙錠）,，屬于核酸分子嵌入劑,，通常用于分子遺傳學(xué)、DNA和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析等研究中,，特別是國(guó)內(nèi)實(shí)驗(yàn)室經(jīng)常使用EB進(jìn)行凝膠核酸電泳實(shí)驗(yàn)的染色,。EB作為誘變性的化合物，在人體中誘導(dǎo)突變的機(jī)制是不可逆轉(zhuǎn)的,。長(zhǎng)期使用EB或者所處實(shí)驗(yàn)環(huán)境中有暴露的EB,，都可能對(duì)操作人員造成潛移默化的危害，尤其是遺傳方面,。EB的廢液處理不當(dāng),，也對(duì)周?chē)嬖谏锇踩[患，污染環(huán)境,。

RNase的存在會(huì)降解與其接觸的任何RNA分子,，導(dǎo)致有價(jià)值的樣品丟失或干擾實(shí)驗(yàn)。由生物體表達(dá)制成的生物制品,，或者實(shí)驗(yàn)環(huán)境,、平臺(tái)中易存在RNase殘留污染,，RNase會(huì)迅速降解芯片研究、實(shí)時(shí)熒光定量PCR,、Northern blot,、cDNA克隆等實(shí)驗(yàn)中的重要樣品，導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的丟失,，以及時(shí)間或金錢(qián)的浪費(fèi),。

核酸氣溶膠污染，即DNA/RNA氣溶膠污染,，是實(shí)驗(yàn)室中極易出現(xiàn)的一種空氣污染,。空氣與液體的液面摩擦,，離心機(jī)離心,，劇烈搖動(dòng)反應(yīng)管，PCR開(kāi)蓋,，移液器反復(fù)吸樣,，污染物外泄等情況均會(huì)產(chǎn)生核酸氣溶膠，但更多的是樣本間的交叉感染,。這類(lèi)污染的危害對(duì)于PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果尤其顯著：極微量的核酸氣溶膠污染, 即可形成假陽(yáng)性,。更嚴(yán)重的是，一旦形成氣溶膠污染,，則可引起整個(gè)PCR實(shí)驗(yàn)室污染,，甚至需要關(guān)閉實(shí)驗(yàn)室。