測定蛋白質(zhì)的構(gòu)型和功能要用什么儀器,,有哪些步驟,!
閱讀:1294 發(fā)布時間:2022-12-2
構(gòu)型這個概念是指一個有機分子中各個原子*的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的,。構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化,。蛋白質(zhì)的構(gòu)型就是一級結(jié)構(gòu),指其氨基酸排列順序,。
測定蛋白質(zhì)的構(gòu)型的主要有兩種方法:Edman降解(Edman degradation)和質(zhì)譜法,。
EDMAN降解法測序是經(jīng)典的方法,通過從多肽鏈游離的N末端(或者C末端,,但是很少)測定氨基酸殘基的序列的過程,。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,,現(xiàn)在一般都是自動測序儀,。
質(zhì)譜法測蛋白只要是利用生物質(zhì)譜儀,比如ESI-Q-TOF,,ESI-IT-Obitraq。利用特異的酶將蛋白切成肽段,,然后通過質(zhì)譜方法進行測定,,產(chǎn)生數(shù)據(jù)或通過重頭比對,或者通過生物信息學(xué)中數(shù)據(jù)庫搜索的方法推斷出肽段序列,,然后再由肽段序列拼接處蛋白序列,。這種方法是近些年來隨著蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展而廣泛被使用,但是對于蛋白完整序列測定需要較強的生物信息學(xué)技術(shù),。
整體而言,,EDMAN降解法準確,但是耗時長,,而且對于所測定的肽段要求很高,,不能太長,不能太難修飾等等,,一般能測個20-50堿基不錯了,。而質(zhì)譜法方法快速,但是準確性比EDMAN降解法略差,。
另外,,樓主講的蛋白功能測定,不同的蛋白質(zhì)功能各異,,蛋白功能主要通過生物學(xué)實驗反復(fù)驗證次得到,,這個比較復(fù)雜,沒有固定的模式,,要逐一研究,。
另外,,像核磁儀可以用來研究蛋白的構(gòu)象或者說晶體結(jié)構(gòu),表面等離子共振儀器可以用來研究蛋白蛋白相互作用,,等等,,蛋白質(zhì)是未來有限的生物研究資源,現(xiàn)在對蛋白質(zhì)的研究熱情都很高,。也有許多相關(guān)的基礎(chǔ)科教書,,樓主感興趣可以去看看。