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人多能干細(xì)胞 （hPSC） 衍生的內(nèi)胚層定量聚合酶鏈反應(yīng) （qPCR） 芯片設(shè)計(jì)用于表征 hPSC 衍生的確定性內(nèi)胚層祖細(xì)胞及其分化的后代，包括胰腺、肝臟和腸道細(xì)胞,。該 qPCR 陣列提供了體外分化后 hPSC 衍生的內(nèi)胚層細(xì)胞的基因表達(dá)譜，并有助于開發(fā)定向分化至內(nèi)胚層譜系的方案,。根據(jù)它們在hPSCs中或在hPSC衍生的外胚層,、中胚層和內(nèi)胚層譜系細(xì)胞（D'Amour等人）中的表達(dá)來選擇基因，包括胰腺（Kroon等人）,、肝臟（Hay等人）和腸道祖細(xì)胞（Grapin-Botton和Melton）。

qPCR 用于確定多個樣品中基因表達(dá)的穩(wěn)態(tài) mRNA 水平的變化,，通常歸一化為內(nèi)部對照基因的相對表達(dá),。基因特異性引物可擴(kuò)增從 mRNA 逆轉(zhuǎn)錄的 cDNA 庫中的靶序列,，并且與 TaqMan® 技術(shù)一樣,，雜交序列特異性探針提供來自 Taq DNA 聚合酶的 5' 核酸外切酶活性的熒光信號。熒光信號的積累速率用于定量樣品 cDNA,，從而定量原始細(xì)胞裂解物中 mRNA 的量,。

該 qPCR 芯片包含經(jīng)驗(yàn)證的引物和探針，用于檢測 90 個基因,，這些基因的表達(dá)與 hPSC 或 hPSC 衍生的外胚層,、間胚層和內(nèi)胚層細(xì)胞或胰腺、肝臟和腸道祖細(xì)胞相關(guān),，以及 6 個內(nèi)源性（管家）對照基因,。TBP（TATA 盒結(jié)合蛋白）qPCR 對照模板作為合成 DNA 陽性對照提供。其他基因信息和 qPCR 分析工具可在獲得,。