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如何提高DNA濃度/純度測(cè)定的準(zhǔn)確性,?

時(shí)間:2024/4/23閱讀:654
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分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中經(jīng)常需要對(duì)樣品進(jìn)行濃度和純度的測(cè)定,,它相當(dāng)于一種質(zhì)控,,以此來(lái)確保下游實(shí)驗(yàn)的結(jié)果可靠,。


常用的DNA濃度/純度測(cè)定設(shè)備是紫外分光光度計(jì),它的原理是利用物質(zhì)分子對(duì)紫外可見(jiàn)光譜區(qū)的輻射吸收來(lái)進(jìn)行分析物質(zhì)成分,。


這樣來(lái)描述可能有點(diǎn)生硬,,我們舉個(gè)栗子:


假設(shè)現(xiàn)在有一樣物質(zhì)A,它溶解在溶液內(nèi),,當(dāng)光照射溶液時(shí),,溶液內(nèi)的A會(huì)吸收一部分的光。不同顏色的光有不同的波長(zhǎng),,A對(duì)不同顏色的光(不同波長(zhǎng))的吸收程度是不一樣的,。


雙鏈的DNA,它能對(duì)波長(zhǎng)為260nm的光進(jìn)行強(qiáng)烈的吸收,,吸收的程度可以用一個(gè)叫吸光度的數(shù)值來(lái)測(cè)量,,濃度越高的DNA,理論上吸光度也越高。


最后,,通過(guò)與標(biāo)準(zhǔn)品的吸光度數(shù)值對(duì)比后,,就可以知道未知濃度的DNA有多少量了。


如何提高DNA濃度/純度測(cè)定的準(zhǔn)確性,?


DNA濃度測(cè)定通常會(huì)使用紫外分光光度計(jì),,常見(jiàn)的有NanoDrop這類(lèi)設(shè)備。除了DNA,,它還能測(cè)定RNA和蛋白的吸光度,。

要提高濃度測(cè)定的準(zhǔn)確性,需要注意以下幾點(diǎn):

  • 檢測(cè)之前,,務(wù)必充分混勻DNA溶液,,因?yàn)檫@類(lèi)機(jī)器的上樣檢測(cè)體積只需要1-2uL,如果樣品沒(méi)有混勻,,那么每次檢測(cè)樣品濃度也會(huì)不一樣,。

  • 因?yàn)樯蠘芋w積很小,所以樣品很容易揮發(fā),,如果把樣品加在檢測(cè)基座后不馬上檢測(cè)的話,,會(huì)導(dǎo)致測(cè)出來(lái)的樣品濃度偏高。

  • 實(shí)驗(yàn)環(huán)境和耗材的穩(wěn)定性要高,。檢測(cè)設(shè)備應(yīng)該在放置在溫度可控,、通風(fēng)的環(huán)境下;裝樣品的管子如果不是要進(jìn)行吸取樣品操作的話,,需要時(shí)刻緊閉,。

  • 每次檢測(cè)完畢,都需要對(duì)檢測(cè)基座或者比色皿進(jìn)行清洗和擦拭,,確保不會(huì)有樣品殘留后,,再進(jìn)行下一次上樣檢測(cè)。

  • 空白調(diào)零,,應(yīng)該使用溶解待檢測(cè)樣品的溶液來(lái)調(diào)零,。例如如果用水溶解DNA,那就用水調(diào)零,,用其他緩沖液溶解,,則用對(duì)應(yīng)的緩沖液調(diào)零。

在測(cè)定后,,我們通常會(huì)看到,,設(shè)備會(huì)提供幾個(gè)不同的結(jié)果給我們,有的是數(shù)值,,例如OD230,、OD260,,有的是比值,例如OD260:280,,那這些結(jié)果代表什么呢,?

OD是optical density(光密度)的縮寫(xiě),表示被檢測(cè)物吸收的光密度。

OD=lg(1/trans),,其中trans為被測(cè)物質(zhì)的透光值,。

不同的OD以及OD比值,代表不同的意義:

如何提高DNA濃度/純度測(cè)定的準(zhǔn)確性,?


【OD230】

提取核酸時(shí)會(huì)用到各種化合物,,它們以鹽離子的形式存在,例如胍鹽,、苯氧基離子,、硫氰酸酯。

這些鹽離子對(duì)230nm波長(zhǎng)的紫外光有強(qiáng)烈的吸收值,。如果測(cè)定核酸時(shí),,發(fā)現(xiàn)OD230數(shù)值很高,代表溶液中的鹽離子濃度很高,。

【OD260】

雙鏈DNA在這個(gè)波長(zhǎng)下會(huì)對(duì)光有強(qiáng)烈的吸收,。

【OD280】

芳香族氨基酸在這個(gè)波長(zhǎng)下,,有強(qiáng)烈的光吸收,。如果該數(shù)值很高,代表DNA溶液中可能存在蛋白質(zhì)的污染.

【OD320】

通常是由光散射造成的,。如果該數(shù)值很高,,意味著溶液內(nèi)有顆粒物污染、待檢器皿例如比色皿有污漬,。

【OD260:OD280】

通常用于判斷DNA或RNA溶液的純度,。常用的指標(biāo)是:在OD230數(shù)值較低,OD320數(shù)值較低的前提下,。較高純度的DNA,,比值應(yīng)該為1.7~1.9之間,較高純度的RNA,,比值應(yīng)該為1.9~2.0之間,。

當(dāng)然,以上測(cè)定的結(jié)果并非是絕對(duì)計(jì)數(shù)的數(shù)值,,它是一個(gè)參考數(shù)值,,因?yàn)槲覀冊(cè)跍y(cè)定時(shí)是不涉及用到標(biāo)準(zhǔn)品這樣?xùn)|西,所以,,也就是我們測(cè)出來(lái)的數(shù)可以作為一定程度的參考,。

而且,,當(dāng)一些外界因素影響時(shí),測(cè)定也會(huì)出現(xiàn)偏差,,例如樣本含量非常非常低時(shí),,測(cè)定的數(shù)值誤差就會(huì)很高并不具參考意義,設(shè)備耗材出現(xiàn)問(wèn)題時(shí),,測(cè)定的數(shù)值也會(huì)不準(zhǔn),。

以上就是本期的內(nèi)容,更多資訊,,歡迎點(diǎn)擊安培生物網(wǎng)站鏈接了解更多技術(shù)與產(chǎn)品資訊,。

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