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當(dāng)前位置:深圳市安培生物科技有限公司>>技術(shù)文章>>臨床M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因輔助治療胰腺導(dǎo)管腺癌
胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)是全球七大癌癥相關(guān)死亡原因,也是最常見的人類惡性腫瘤之一,。根據(jù)2018年全球癌癥統(tǒng)計,,大約有45.9萬名新確診患者和近43.2萬人死亡患者。由于早期準(zhǔn)確診斷和腫瘤快速進(jìn)展等困難,,大量PDAC(胰腺導(dǎo)管腺癌)病例在診斷時出現(xiàn)臨床晚期或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,。因此,開發(fā)新的,、可靠的預(yù)后評估和療效預(yù)測指標(biāo)以進(jìn)一步推進(jìn)針對性治療具有十分重要的意義,。
越來越多的證據(jù)支持浸潤M2巨噬細(xì)胞在胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)的腫瘤進(jìn)展中起關(guān)鍵作用。然而,,對M2巨噬細(xì)胞浸潤和中樞基因(FAM53B)在臨床結(jié)局和免疫治療中的生物學(xué)作用缺乏全面的分析,。近期有一個研究團(tuán)隊針對M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因表達(dá)進(jìn)行研究,以期望能探索出評估PDAC預(yù)后及療效的新指標(biāo),。
研究人員合并了兩個PDAC樣本數(shù)據(jù)集,,GSE16515和TCGA-PAAD,以研究M2巨噬細(xì)胞分析的潛在作用,。使用CIBERSORT算法獲得M2巨噬細(xì)胞圖譜,,然后通過WGCNA發(fā)現(xiàn)與M2巨噬細(xì)胞相關(guān)較為顯著的模塊。然后,,利用多cox回歸模型進(jìn)一步確定模塊中的候選基因,,最終確定5個關(guān)鍵基因。然后,,建立了多基因風(fēng)險模型和綜合預(yù)后圖,。在后續(xù)分析和外部試驗組(ICGC-PACA-CA)中驗證其預(yù)后價值。隨后,,研究潛在的信號通路和治療預(yù)測的風(fēng)險評分,。最后,進(jìn)一步探討FAM53B在預(yù)后預(yù)測,、免疫浸潤和免疫治療中的生物學(xué)功能,,為PDAC的臨床治療策略提供可靠的見解。
22個候選基因的LASSO系數(shù)譜
為了進(jìn)一步研究候選基因的預(yù)后價值,,研究人員從TCGA-PAAD項目中提取了表達(dá)數(shù)據(jù)和隨訪信息,。在單因素Cox分析的幫助下,,鑒定了22個M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因,具有顯著的預(yù)后價值,。并對這些hub基因進(jìn)行了Lasso回歸,,識別出PDAC中與預(yù)后相關(guān)的9個M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因。進(jìn)行多因素COX回歸分析,,確定5個M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因(FAM53B,、SPINK2、ABCB4,、GH1,、INTU)為中心基因,所有這些基因均被認(rèn)為是有益的預(yù)后指標(biāo)(所有HRs <1,表S6),。使用HPA數(shù)據(jù)庫來探索PDAC樣品中的蛋白表達(dá)水平,。結(jié)果顯示,相對于正常樣本,,腫瘤組織中的蛋白(ABCB4,、FAM53B和INTU)明顯失調(diào)。此外,,在低表達(dá)和高表達(dá)基因亞組之間,,生存分析顯示,大多數(shù)hub基因mRNA表達(dá)異常導(dǎo)致總體生存時間顯著不同,。
采用ROC分析評估預(yù)后特征的預(yù)測價值
綜上所述,,建立基于M2巨噬細(xì)胞的風(fēng)險評分,可作為預(yù)測PDAC臨床結(jié)局的穩(wěn)健的預(yù)測性生物標(biāo)志物和預(yù)后指標(biāo),,為PDAC的治療管理提供指導(dǎo),。
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