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Amicon® Ultra超濾管 | 使用過程中的常見問題

時間:2024/7/25閱讀:299
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之前我們有幾期文章介紹了使用默克Amicon® Ultra超濾管的應用場景(分離外泌體,、濃縮病毒),有很多老師反饋了一些超濾管使用時的問題,,針對其中問的比較多的問題,,小編特意進行了收集、整理,。今天給大家介紹超濾管的使用過程中,,離心力g與RPM的換算及常見問題的解答。

01
離心力g與RPM的換算


01

 測量轉子的半徑

從離心機廠家文件上查閱轉子半徑,,或像以下圖示這樣自己測量轉子半徑,。

640.webp.jpg

02

 采用列線圖計算RPM


繪制轉子半徑和建議的RCF(離心力g)圖,連線確定RPM,。

640.webp (1).jpg

此列線圖實際是通過右側的公式計算得出的,。


640.webp (2).jpg

02
Amicon® Ultra超濾管-常見問題解答


Q1:Amicon® Ultra超濾管的膜材質是什么?

A1:Amicon® Ultra超濾管的膜材質為默克密理博Ultracel®再生纖維素膜,,生產(chǎn)工藝嚴格,,截留分子量明確而精準,蛋白吸附損失最小,。


Q2如果要用超濾的方法分離兩種蛋白,,那么這兩個蛋白的大小需要相差多少?

A2按照經(jīng)驗,,建議兩個蛋白的分子量要相差一個數(shù)量級(10倍),。


Q3Amicon® Ultra超濾管可以用于病毒濃縮么?

A3可以,。對于慢病毒推薦Amicon® Ultra 100 kDa,; 對于腺病毒推薦Amicon® Ultra 50kDa。具體的操作步驟可以參考病毒濃縮純化試劑盒FTLV00003和FTAV00003的產(chǎn)品使用說明書。另提供AAV(腺相關病毒)的制備方法供參考,。


Q4 Amicon® Ultrar超濾管可以用酒精消毒滅菌么,?

A4Amicon® Ultra與70%乙醇是兼容的,但是對滅菌處理的具體方法沒有做相關的測試,,所以無法提供更進一步的參考信息。建議采用Ultrafree無菌離心管對濃縮后的樣品進行過濾除菌,。


Q5:Amicon® Ultra超濾裝置是否可以用于高壓滅菌,?

A5:Amicon® Ultra都是采用熱封設計,不可以用高壓高溫滅菌,。


Q6:Amicon® Ultra超濾管是否不含RNA酶,?

A6:不保證超濾管不含RNA酶,建議用0.1% DEPC在37度浸泡2h,,以滅活RNA酶,;殘留的DEPC可以用Milli-Q®超純水洗滌除去。


Q7:用Amicon® Ultra超濾管去除去污劑是有什么需要注意的嗎,?

A7:去污劑因其性質,,當濃度大于臨界微團濃度(Critical Micelle Concentration, CMC)時,去污劑分子會聚集形成微團而改變分子構象,,這有可能會影響去污劑的去除效果,。


Q8:蛋白在濃縮時出現(xiàn)了沉淀,如何改進,?

A8:蛋白如果濃縮過快或者過度濃縮都有可能引起蛋白沉淀,。建議蛋白濃縮后的最終濃度不超過20mg/ml。對于對濃縮速度敏感而容易沉淀的蛋白,,建議的改進方法是:

  • 離心力降為推薦離心力的30%-50%,;

  • 改用截留分子量更大的超濾管(如原本選用10k,此時可以選擇30k),;

  • 在濃縮過程中取出超濾管,,用槍頭反復吹吸幾次后再繼續(xù)濃縮;

  • 體積較大的樣品可考慮選用攪拌式超濾杯,,減少沉淀的發(fā)生,。

Q9:有時候用超濾離心管連水都離不下來,可能是什么原因,?

A9: Amicon® Ultra超濾膜中含有微量甘油,。 如果出現(xiàn)這種情況,請先用0.1N NaOH清洗再離心,。最后用緩沖液或Milli-Q®水再次清洗后甩干,。清洗后的濾膜應立即使用,如暫時不用,請保持潤濕狀態(tài),,避免重新干燥,。


Q10:說明書中推薦在室溫下進行離心,考慮到蛋白的穩(wěn)定性,,是否可以在4℃進行離心,?
A10:可以,但是低溫會增加蛋白樣品的粘性,,導致流速減慢,,建議可將離心時間延長到原來的1.5倍。


Q11:濃縮后發(fā)現(xiàn)濃縮液中沒有目的蛋白,,可能的原因有哪些,?
A11:首先,Amicon® Ultra超濾管的蛋白zui低起始濃度為25ug/ml,。請確保樣本的起始濃度大于這個濃度,。其次,如果問題仍然出現(xiàn),,請不要丟棄樣本濾過液以便用于分析可能的原因:
· 如果目的樣本在濾過液中,,那么請排查:
a)是否選擇了合適截留分子量的超濾管(目的蛋白分子量的1/2或者1/3)?
b)使用的離心力是否是在限定范圍內,?如果使用的是rpm,,請換算成相應的g離心力,具體換算方法請垂詢,。
c)離心機最近是否有校準過,?
d)是否shou次嘗試這個蛋白?如果能確保用同樣的超濾管對其它蛋白成功操作的話,,那么有可能是這個目的蛋白的原因,。有時蛋白會因其本身的一些特性(構象差異)而影響濃縮效果,建議選用更小截留分子量的超濾管(如原本選用30k,,此時可以選擇10k),。
· 如果目的樣本也不在濾過液中,那么:
a)蛋白樣本起始濃度是否大于25ug/mL,?
b)用來確定樣本濃度的方法是什么,?是否可信?
c)目的蛋白是不是沉淀了,?如果是,,具體解決方法請參考上面的關于蛋白沉淀問題的解釋。


Q12:如何對超濾管進行去除內毒素的處理,?
A12:提供的超濾管是沒有經(jīng)過去內毒素處理的,,同時由于內毒素通常以多聚體的形式存在,,大小在10-1000KD之間不等,在超濾的過程中是無法去除的,??稍趯嶒炃巴ㄟ^先用0.5MNaOH預清洗,隨后用Milli-Q®水/緩沖液清洗的步驟去除大部分內毒素,。關于針對Amicon®,、Microcon®、Centricon®嘗試過的內毒素去除方案,。


Q13:用濃縮后的蛋白做下游分析時發(fā)現(xiàn)有干擾,,可能有哪些原因?
A13:Amicon®Ultra超濾膜含有微量甘油,。如果此成分干擾分析,可用緩沖液或Milli-Q®水預清洗,。如果干擾仍然存在,,用0.1NNaOH清洗,然后用緩沖液或Milli-Q®水再次清洗后甩干,。


Q14:懷疑濃縮過程中目的蛋白和超濾膜之間可能存在非特異性吸附,,如何改善?
A14:Amicon® Ultra超濾管使用的是再生纖維素膜,,這種材質是蛋白吸附zui低的超濾膜,。但是對于一些疏水性蛋白或非極性蛋白,它們和膜的非特異吸附可能會增強,。對于這種情況,,可以嘗試在實驗前對超濾管進行封閉處理,也可以嘗試換成Amicon® Ultra 0.5或2來進行實驗,,通過減小膜面積來降低非特異性吸附,。


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