各位奮戰(zhàn)在科研前線的戰(zhàn)友們,,你們是否曾在凌晨三點的細胞房里,,在顯微鏡下盯著細胞培養(yǎng)瓶里可疑的那些小黑點,糾結這到底是細胞碎片還是污染,,這細胞還能做實驗嗎,?事實上,細胞碎片和微生物污染都有其明顯的特征,,了解這些特征,,我們就能夠簡單有效地將它們區(qū)分開。
01
細胞內(nèi)黑點和細胞外黑點的區(qū)分
細胞內(nèi)黑點:首先需要明確的是,,細胞內(nèi)的黑色顆粒既不是碎片也不是污染,,是細胞器及細胞外分泌泡,屬于細胞自身的結構及特性,。不同類型的細胞,,胞內(nèi)顆粒的數(shù)量可能不同。培養(yǎng)條件也會影響細胞內(nèi)顆粒的數(shù)量,。
▲ 細胞內(nèi)黑色顆粒為自身結構特性
細胞外黑點:通常為細胞碎片,、細胞代謝產(chǎn)物或血清中的磷酸鈣沉淀(此文中統(tǒng)稱為碎片),常常與污染混淆,。
02
常見的細胞培養(yǎng)微生物污染類型
最常見的微生物污染為細菌,、真菌、支原體污染,。真菌與碎片差別很大,,真菌通常為白色圓球狀或白色菌絲狀,碎片是小黑點,,不難區(qū)分,。
▲ 真菌污染的兩種典型特征
而支原體用光學顯微鏡是看不見的,必須要用PCR等實驗手段進行檢測,。在此不做贅述,。
然而,細菌(特別是球狀細菌)與碎片卻極為相似,,顯微鏡下呈現(xiàn)為小黑點,,分布于細胞周圍。區(qū)分細菌和碎片則是此文的重點,。
03
從形態(tài),、運動和增殖特點區(qū)分碎片和細菌
4倍或10倍物鏡觀察,可以初步判斷黑點分布情況,但看不清形態(tài),,不容易判斷,。所以我們首先要將物鏡調(diào)到20或40倍,再進一步觀察黑點的特征,。主要從三個方面來判斷:1. 形態(tài)特點 2. 運動方式 3. 是否增殖,。
● 看形態(tài)
碎片通常是不規(guī)則的,有圓形有多邊形,,大小不一,,分布不均勻。細菌形態(tài)規(guī)則,,呈桿狀,、球狀或線狀,具有高度重復性,,分布較為均勻,。
▲ 左:細胞碎片 右: 細菌污染
● 看運動
碎片可分為貼壁或懸浮兩種狀態(tài):貼壁的碎片不會自主運動,而懸浮的細胞碎片會隨液體輕微震動或緩慢飄動(越小的碎片越容易震動,,震動頻率越高),。
細胞碎片或分泌物是細胞在培養(yǎng)過程中產(chǎn)生的,正常培養(yǎng)過程中細胞代謝和死亡無可避免,,大多細胞系都會有類似情況,,只是不同細胞系碎片顆粒多少會有區(qū)別。顆粒會動是基于高中時期所學基本物理原理-布朗運動,,根據(jù)其他細胞庫細胞照片情況,,只要拍攝比較清晰的,都可以看到細胞外黑色顆粒,這些碎片只要是懸浮在液體里都會做布朗運動,。JCRB細胞庫延時攝影信息可以更明顯觀測到碎片位置變化,,是布朗運動的時間積累結果。
▲ 細胞生長延時攝影(來源:JCRB細胞庫)
細菌不會貼壁,,無鞭毛的細菌不會運動;有鞭毛的細菌會定向游動,、原地打轉,、震動,細菌這幾種運動方式經(jīng)常是同時存在的,。細菌相比于碎片,,運動速度要快得多,運動幅度也會更大,。
▲ 碎片隨著液體輕微震動
▲ 細菌快速運動
● 看增殖
碎片不會增殖,但細胞逐漸死亡或細胞密度增大,,碎片都會逐漸增多,。隨著培養(yǎng)時間延長,培養(yǎng)基中的血清也會緩慢析出沉淀,,導致黑點變多,。但培養(yǎng)基不會渾濁。
現(xiàn)在我們大部分時候培養(yǎng)細胞都會加1%青鏈霉素雙抗(也稱為P/S)預防細菌污染,,然而有一些細菌不在P/S抗菌譜中,一旦落入培養(yǎng)基就會開始增殖,。
大部分細菌會在1-2天內(nèi)爆發(fā)式生長,,導致培養(yǎng)基渾濁,肉眼可見流沙狀物質,。
也有少數(shù)種類細菌會受到雙抗的影響,,增殖速度沒那么快。當比較難判斷的時候,,我們可以使用不含雙抗的培養(yǎng)基過夜培養(yǎng),,觀察黑點的增殖情況。
▲ 細菌污染導致培養(yǎng)基渾濁
04
涂平板菌檢
如果通過以上三種方法還是難以判斷,,還有一招——將培養(yǎng)上清涂布細菌培養(yǎng)平板進行驗證:取細胞培養(yǎng)上清,,無菌環(huán)境下涂布細菌專用的固體培養(yǎng)基平板,置于生化培養(yǎng)箱培養(yǎng)24-72h,,觀察是否產(chǎn)生菌落,。此方法更準確,但要求實驗室有微生物培養(yǎng)設備和材料,,同學們可以根據(jù)自己的實際情況選擇合適的方法,。
▲ LB平板菌檢(左:陽性 右:陰性)
總之,面對細胞中的小黑點,,我們無需過分恐慌,。只要我們深入了解細胞碎片與微生物污染的特征,并掌握正確的判斷方法,,便能輕松應對,。
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