Precellys Evolution—蛋白質(zhì)樣本制備理想方案
蛋白質(zhì)是生命的基石,它們幾乎在地球的每一種生物中都能被找到,,對我們的生存很重要,。一些蛋白質(zhì)例如抗體、酶,、激素等會參與化學反應免疫過程以及細胞活動,。蛋白質(zhì)還在運動、結(jié)構(gòu)支持,、存儲能量,、細胞消化、底物運輸?shù)确矫嫫鹱饔?。蛋白質(zhì)由長鏈氨基酸組成,形成多種多樣,,不同形狀大小的蛋白質(zhì),。蛋白質(zhì)因為其不同的長鏈氨基酸組成,每一種類型都有穩(wěn)定特別的三維結(jié)構(gòu),。這種特殊的結(jié)構(gòu)是至關(guān)重要的,,每一個形狀的改變都會引起蛋白質(zhì)功能的變化。所以說像蛋白質(zhì)這種對熱敏感的分子,,在分子下游分析過程之前的樣品制備就顯得格外重要,。Precellys Evolution結(jié)合Cryolys Evolution冷卻系統(tǒng)能夠有效的在研磨過程中使研磨腔室溫度穩(wěn)定保持在4℃。
使用Precellys提高組織蛋白質(zhì)的提取量
APPNOTE 1:從大鼠皮膚組織提取蛋白質(zhì)沉淀和脂肪
APPNOTE 2:使用Minilys從小鼠心臟組織從提取蛋白質(zhì)
Protocol 1:大體積大腸桿菌中提取蛋白質(zhì)
Protocol 2: 96通道眼睛組織中提取蛋白質(zhì)
APPNOTE 1
從*勻質(zhì)的大鼠皮膚組織中提取蛋白質(zhì)沉淀和脂肪
本應用中研究了從大鼠皮膚組織中提取蛋白質(zhì)沉淀和有生物活性的脂肪,。本應用中利用固相萃取與液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)來測組織中脂肪含量,。大鼠皮膚組織使用Precellys Evolution生物樣品研磨器和Cryolys冷卻系統(tǒng)進行研磨,配合7mlCKMix50_研磨管,。此外還測試了在大鼠組織整個研磨的過程結(jié)束后,,樣本溫度都在40℃以下。
實驗材料
自動研磨器:Precellys Evolution生物樣品研磨器和Cryolys冷卻系統(tǒng),;
研磨管:CKMix50_7ml(Cat #: KT03961-1-306.7),;
組織樣本:大鼠皮膚組織(后足背側(cè)和腹側(cè));
干冰,;
Buffer:甲醇,。
實驗方法
20-90mg成年大鼠皮膚組織(后足背側(cè)和腹側(cè)),7ml研磨管加2.8mm和5.0mm陶瓷珠,,500µL甲醇,;轉(zhuǎn)速8000rpm,5個循環(huán),每個循環(huán)10s,,循環(huán)之間間歇120s,;Cryolys冷卻系統(tǒng)將腔室內(nèi)溫度降至5℃時開始研磨;研磨結(jié)束之后立即使用溫度探針檢測樣本管內(nèi)的溫度,。
實驗結(jié)果
如下圖1,、2所示,圖1中a,、b分別為研磨前與研磨后效果對比,,結(jié)果顯示皮膚樣本被充分研磨;圖2為樣本被勻質(zhì)后經(jīng)過固相萃取,,用LC-MS/MS技術(shù)檢測,,成功檢測到花生四烯酸,5-HETE,、8-HETE,、9-HETE的濃度分別為1.3 ±0.3、7.9±0.6和1.3 ± 0.4 ng/mg,。
實驗結(jié)論
大鼠的后爪皮膚比背部皮膚厚,,因此獲得其完整勻質(zhì)的難度更大,使用Precellys Evolution生物樣品研磨器,,結(jié)合Precellys裂解試劑盒成功研磨大鼠后爪皮膚組織,。本應用同樣也展示了Cryolys冷卻系統(tǒng)能夠保證樣本溫度在40℃以下。
APPNOTE 2
使用Minilys從小鼠心臟組織中提取蛋白質(zhì)
開曼化學研究和生產(chǎn)抗體,,為了營造更好的研究市場,。為了保證質(zhì)量,需要合適的組織裂解產(chǎn)物來確保我們的產(chǎn)品達到或者超過我們質(zhì)量控制的標準,。我們很多目標蛋白都是多通道跨膜受體,,因此需要一個非常強力的裂解系統(tǒng)。
實驗材料
Minilys生物樣品研磨器,;CKMix 2mL (KT03961-1-009.2)研磨管,;920mg小鼠心臟組織;裂解Buffer:920µL M-PER (Mammalian Protein Extraction Reagent, Pierce),。
實驗方法
Minilys研磨參數(shù):研磨速率5000rpm,;4個循環(huán),每個循環(huán)20s,,循環(huán)之間間歇5s,;
分析方法:使用Minilys研磨樣本之后,從中提取細胞質(zhì)和膜蛋白,;HEK 293細胞(S1P3轉(zhuǎn)染和未轉(zhuǎn)染)在細胞培養(yǎng)板上培養(yǎng),,隨后提取蛋白質(zhì),;所有的蛋白通過BCA法測定,溶菌產(chǎn)物通過Western Blot分析,。
結(jié)果如圖所示:圖1為使用S1P3多克隆抗體,;一列為3µLMark,第二列為2.5μgS1P3轉(zhuǎn)染過的HEK293細胞裂解產(chǎn)物,,第三列為5μgS1P3轉(zhuǎn)染過的HEK293細胞裂解產(chǎn)物,,第4列為50μg小鼠心臟膜蛋白裂解產(chǎn)物。結(jié)果顯示均有很好的條帶,,研磨提取效果好,。圖2為使用一種視神經(jīng)多克隆抗體(C-Terminal);一列為3µLMark,,第二列為60μgHEK293細胞裂解產(chǎn)物,,第三列為40μgHEK293細胞裂解產(chǎn)物,第四列為50μg小鼠心臟細胞質(zhì)裂解產(chǎn)物,,第五列為小鼠心臟膜蛋白裂解產(chǎn)物,,結(jié)果顯示均有很好條帶,研磨提取效果好,。
實驗結(jié)論
Minilys生物樣品研磨器結(jié)構(gòu)緊湊,,使用方便,Minilys提供了更純凈,、更濃縮的裂解產(chǎn)物,對目標蛋白分析有很高的重復性,。Minilys可同時研磨3個樣本,,可用2ml或0.5ml研磨管,是低通量實驗的理想選擇,。
Protocol 1
大體積大腸桿菌中提取蛋白質(zhì)方案
研磨管:7ml VKMix_或15mlVK05_
樣本量:5ml或10ml(OD600下為50)
研磨參數(shù):7ml:轉(zhuǎn)速9000rpm,,6個循環(huán),每個循環(huán)30s,,循環(huán)間歇60s,;15ml:轉(zhuǎn)速9900rpm,6個循環(huán),,每個循環(huán)60s,,循環(huán)間歇60s
Protocol 2
96通道從眼組織中提取蛋白質(zhì)
研磨管:CKMix_WP
樣本:視網(wǎng)膜神經(jīng)或眼杯
Buffer:50µL M-PER
研磨參數(shù):視網(wǎng)膜:轉(zhuǎn)速5500rpm,3個循環(huán),,每個循環(huán)30s,,循環(huán)間歇30s;眼杯:轉(zhuǎn)速8200rpm,,3個循環(huán),,每個循環(huán)30s,,循環(huán)間歇30s。
Precellys生物樣品研磨器:
超快速: up to 10 000 rpm
超靈活: 0.5, 2, 7和 15mL研磨管
超高效: 強力3D振動
超保護: Cryolys Evolution新型冷卻技術(shù),,無需液氮和壓縮空氣