詳細(xì)介紹
2× P6 High-Fidelity Premix 高保真酶產(chǎn)品簡介
2×P6 High-Fidelity Premix 是將 PCR 反應(yīng)用到的超保真 P6 DNA 聚合酶,、buffer,、dNTP Mixture 以及穩(wěn)定劑以 2倍的終濃度進(jìn)行混合,。使用時,只需在制品溶液中加入模板和引物便可進(jìn)行 PCR反應(yīng),,大大簡化了操作過程,,降低了 PCR操作過程中污染的可能性。P6 High-Fidelity DNA Polymerase 是基于 Pyrococcus furiosus 的高溫 DNA聚合酶,,具有耐熱型 5´-3´ 的聚合酶活力以及 3´-5´的核酸外切酶活力,,因此屬于高保真 DNA 聚合酶(其保真度達(dá)到普通 Taq 酶的 55 倍)。該酶經(jīng)過生物工程改造后,,其擴(kuò)增能力,、保真度都得到提升,并且具有廣泛的模板適應(yīng)性,,擴(kuò)增速度達(dá)到 2-4 kb/min。優(yōu)化的 Premix 針對 λ DNA 等簡單模板的有效擴(kuò)增長度可達(dá) 40 kb,,cDNA 有效擴(kuò)增長度可達(dá) 15 kb,,基因組有效擴(kuò)增長度可達(dá) 20 kb。
2× P6 High-Fidelity Premix 高保真酶產(chǎn)品組成
無染料
2×P6 High-Fidelity Premix
Loading buffer
預(yù)混液應(yīng)置于-20 ℃保存,,避免反復(fù)凍融,。
2× P6 High-Fidelity Premix 高保真酶產(chǎn)品質(zhì)控
(1)性能檢測 1:
在 50 μL PCR 反應(yīng)體系加入 25 μL premix、100 ng Human RP11 13M9-pBACe3.6 質(zhì)粒,,擴(kuò)增 15 kb 的 DNA目的片段,,在 30 個循環(huán)擴(kuò)增后經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠檢測可在 15 kb 處檢測到非常亮且單一的目的條帶。
(2)性能檢測 2:
在 50 μL PCR 反應(yīng)體系加入 25 μL premix,、大腸桿菌菌落,,擴(kuò)增 5 kb 的 DNA 目的片段,在 30 個循環(huán)擴(kuò)增后經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠檢測可在 5 kb 處檢測到較亮的單一目的條帶,。
(3)大腸桿菌核酸殘留檢測:
在 20 μL 熒光定量 PCR 反應(yīng)體系加入 10 μL premix(無染料)和大腸桿菌特異基因擴(kuò)增引物(如 gapA),;
在不加入大腸桿菌 DNA 模板的情況下,20 個循環(huán)內(nèi)熒光信號值在基線范圍,。
2× P6 High-Fidelity Premix 高保真酶常規(guī) PCR 反應(yīng)體系:
* 針對不同類型的模板,,所需的模板量會有不同,如基因組和質(zhì)粒,,等等,;需要根據(jù)實際情況,添加合適的模板量,。
** 退火溫度需根據(jù)引
物和模板實際的 G+C 含量來作調(diào)整,。 mix
2. PCR 反應(yīng)參數(shù)(供參考)**:
(起始變性): 95 ℃ 5 min
(解鏈): 95 ℃ 30 sec
(退火): 55 ℃ 30 sec
(延伸): 72 ℃ x min (30-35 循環(huán):2 kb/min)
(終延伸): 72 ℃ 7 min
(臨時保存): 16 ℃ 保溫
1. 在冰浴上設(shè)置 PCR 反應(yīng)(供參考)*:
模板: < 500 ng
2× P6 High-Fidelity Premix: 25 μL
Primer 1/2: 0.2 - 1.0 μM (final conc.)
滅菌蒸餾水 Up to 50 μL
2× P6 High-Fidelity Premix 高保真酶?應(yīng)用實例
P6 擴(kuò)增速度測試
以pUC18質(zhì)粒為模板擴(kuò)增不同長度的DNA的片段,PCR反應(yīng)程序設(shè)置為:95℃ 5min,;98℃ 5sec, 55℃ 30sec, 72℃ 1sec,;72℃ 5min(30 Cycles),。結(jié)果如下:
常規(guī) PCR 擴(kuò)增指南:
1. 簡單模板如質(zhì)粒等可按照 5 sec/kb 設(shè)置程序。
2. 大多數(shù)模板的預(yù)變性溫度為 95 度,,30 sec-5 min,。
高 GC 含量模板預(yù)變性溫度為 98 度,30 sec-5 min,。
3. 常規(guī)退火時間設(shè)置為 10 sec,,復(fù)雜模板設(shè)置為 10 sec-30 sec。
P6 擴(kuò)增不同長度的 DNA的片段
以 100 ng Human RP11 13M9-pBACe3.6 質(zhì)粒為模板擴(kuò)增不同長度的 DNA的片段,,PCR 反應(yīng)程序設(shè)置為: 95 ℃ 5min,;98 ℃ 5 sec, 55 ℃ 30 sec, 72 ℃ 8 min;72 ℃ 10 min(30 Cycles),。結(jié)果如下:
長片段擴(kuò)增指南:
1. 使用高質(zhì)量的模板,。
2. 增加引物長度提高退火溫度,退火/延伸合并成一步,。
3. 添加適當(dāng)濃度的 DMSO,,一般不高于 5%。
4. 提高變性溫度為 98 度,,縮短變性時間為 5 sec,。
P6 擴(kuò)增高 GC 含量和低 GC 含量 DNA的片段。
以人基因組為模板擴(kuò)增不同 GC 含量的 DNA的片段,,程序設(shè)置為:95 ℃ 5min,;95 ℃ 30 sec, 55 ℃ 30 sec, 72 ℃ 1 sec;72 ℃ 5 min(30 Cycles),。結(jié)果如下:
高 GC 和低 GC 模板擴(kuò)增指南
1. 使用高質(zhì)量的模板,。
2. 高 GC 模板可適當(dāng)添加 DMSO,一般終濃度不高于 5%,。
3. 高 GC 含量模板可適當(dāng)提高退火溫度,,還可使用 Touch down 的方法進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。
4. 低 GC 含量模板可以適當(dāng)降低退火溫度,。