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SILAC(定量蛋白質(zhì)組學(xué))
一、SILAC(定量蛋白質(zhì)組學(xué))原理:
SILAC ( Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)技術(shù)是利用哺乳動物細胞增殖對必需氨基酸(Lys,,Arg等)的依賴性原理而設(shè)計的代謝標(biāo)記蛋白質(zhì)的方法,。以Lys為例,普通的Lys分子中有6個12C原子,,用13C替代普通Lys中的全部12C原子,,從而生成13C標(biāo)記的Lys。13C標(biāo)記的Lys要比普通的Lys多6Da,。
比如兩組細胞,,一組用含普通Lys的培養(yǎng)基培養(yǎng)(記為K0),一組用含13C的Lys培養(yǎng)(記為K6),。由于Lys是細胞增殖的必需氨基酸,,在細胞培養(yǎng)過程中13C標(biāo)記的Lys自然“摻入”到新和成的蛋白質(zhì)中,導(dǎo)致整個細胞的蛋白質(zhì)組被13C標(biāo)記的Lys所標(biāo)記,。鑒于K0和K6兩個氨基酸存在6Da的質(zhì)量差異,,所以在后續(xù)LC-MS/MS對蛋白質(zhì)進行分析時,能同時完成樣品中蛋白質(zhì)的鑒定和定量(6Da的質(zhì)量差異),。根據(jù)定量結(jié)果,,能直接判斷蛋白質(zhì)表達水平差異、區(qū)分特異性和非特異性相互作用等,。
二,、SILAC(定量蛋白質(zhì)組學(xué))特色:
(1、進行 細胞中 蛋白質(zhì)相互作用和 蛋白質(zhì)表達差異的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),;
(2)通過LC-MS/MS分析,,能 同時實現(xiàn)對未知樣品中蛋白質(zhì)分子的 鑒定與定量;
(3)依據(jù)定量結(jié)果,,能直接判定蛋白質(zhì)表達水平差異,、區(qū)分特異性和非特異性相互作用等。
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