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誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)的研究和應(yīng)用正日益成為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的重要方向,。然而,,iPSC的培養(yǎng)過程中存在諸多不確定性,因此,,進行規(guī)律性的質(zhì)量控制( QC)對于確保實驗的可靠性,、降低成本和提高效率至關(guān)重要。國際干細(xì)胞研究學(xué)會(ISSCR)提供了一系列指導(dǎo)原則和建議,,本文將圍繞iPSC QC 的三個關(guān)鍵點:基本因素,、功能性驗證和基因組穩(wěn)定性,探討何時進行QC檢測以及如何實施,。
一,、iPSC QC的關(guān)鍵點
iPSC QC(誘導(dǎo)多能干細(xì)胞質(zhì)量控制)的關(guān)鍵點主要包括以下三個方面:
1. 基本因素:這些因素是評估iPSC質(zhì)量的基礎(chǔ),包括:
- 細(xì)胞是否污染:檢查細(xì)胞培養(yǎng)物中是否存在細(xì)菌,、真菌,、支原體等外來污染。
- STR類型:通過短串聯(lián)重復(fù)序列分析來確認(rèn)細(xì)胞株的遺傳身份,,確保其來源的準(zhǔn)確性,。
- 生長速度:監(jiān)測細(xì)胞的增殖速率,以評估其生長活力,。
- 細(xì)胞形態(tài):觀察細(xì)胞的大小,、形狀和排列,以判斷其正常性,。
2. 功能性驗證:這些測試確保iPSC具有正常的生物學(xué)功能,,包括:
- 基因表達(dá)分析:通過RT-PCR、基因芯片等技術(shù),,檢測iPSC中特定基因的表達(dá)水平,。
- 分化潛能:評估iPSC分化為三種胚層細(xì)胞的能力,以及是否能形成功能性細(xì)胞類型,。
3. 基因組穩(wěn)定性:這些分析確保iPSC的遺傳穩(wěn)定性,,包括:
- 拷貝數(shù)變異(CNV)分析:檢測細(xì)胞基因組中的拷貝數(shù)變化,這些變化可能導(dǎo)致基因功能的改變,。
- 單核苷酸變異(SNV)分析:識別基因組中的單點突變,,這些突變可能影響細(xì)胞的功能。
- 基因編輯正確性及脫靶效應(yīng)評估:對于經(jīng)過基因編輯的iPSC,,檢查編輯是否準(zhǔn)確以及是否存在非特異性的脫靶效應(yīng),。
二,、iPSC QC檢測的時機
l 重要項目開始前:在項目啟動前進行QC檢測,可以確保使用的iPSC質(zhì)量合格,,避免后續(xù)實驗的無效投入,。
l iPSC編輯或凍存后:編輯或凍存過程可能影響iPSC的質(zhì)量,因此在這些操作后進行QC檢測十分必要,。
l 細(xì)胞培養(yǎng)異常時:當(dāng)細(xì)胞培養(yǎng)過程中出現(xiàn)表型改變或?qū)嶒炛貜?fù)性差時,,應(yīng)及時進行QC檢測,以發(fā)現(xiàn)問題所在,。
三,、IPCS基因組突變的QC策略
突變風(fēng)險:研究顯示,iPSC細(xì)胞株有20%-30%的概率發(fā)生基因突變,,這些突變可能隨著傳代次數(shù)的增加而加劇,,對實驗結(jié)果產(chǎn)生嚴(yán)重影響。
篩選時機:為了及時發(fā)現(xiàn)突變并降低成本,,建議在iPSC還未進行重編程和基因改造的野生型(WT)時期進行篩選,。
高效鋪板方法:在需要大量樣本的情況下,手動鋪板不現(xiàn)實,。采用安達(dá)望的VIPS高效率細(xì)胞鋪板系統(tǒng)結(jié)合CMX系統(tǒng)細(xì)胞檢測系統(tǒng)進行單克隆篩選和生長追蹤,,可以提高效率。
克隆恢復(fù)率:通過培養(yǎng)基的優(yōu)化,,可以使克隆恢復(fù)率達(dá)到最高70%,,確保篩選過程的效率。
l基因分析:選取單克隆來源且形態(tài)符合要求的克隆團進行基因分析,,排除突變細(xì)胞株,,從源頭避免突變帶來的風(fēng)險。
iPSC的培養(yǎng)和應(yīng)用潛力巨大,,但隨之而來的質(zhì)量控制問題也不容忽視,。通過遵循ISSCR的指導(dǎo)原則,我們可以在適當(dāng)?shù)臅r機進行有效的QC檢測,,確保iPSC的質(zhì)量和穩(wěn)定性,。特別是在基因組突變方面,通過早期篩選和高效的單克隆篩選技術(shù),,我們可以減少突變風(fēng)險,,提高實驗的可靠性和效率。隨著iPSC技術(shù)的不斷進步,,未來還將出現(xiàn)更多高效,、精確的QC方法,為iPSC的研究和應(yīng)用提供更強有力的支持,。
安達(dá)望的VIPS高效率細(xì)胞鋪板系統(tǒng)結(jié)合CMX系統(tǒng)細(xì)胞檢測系統(tǒng)進行單克隆篩選和生長追蹤,,可以提高效率,。更多實驗室儀器,實驗耗材,,細(xì)胞生長試劑可以進入蘇州阿爾法生物實驗器材有限公司進行了解,。
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